Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475999
• Subject: NM_148944.4
• Aligned Length: 1520
• Identities: 1262
• Gaps: 61

Alignment

Query    1  ATGAGGCGCGCGCCTTCCCTGGTCCTTTTCTTCCTGGTCGCCCTTTGCGGGC----GC--GGGAACTGCCGCGT  68
            ||||||.|..|||   |||||.||||..|||..|||.||||.||      ||    ||  |||.||||||||.|
Sbjct    1  ATGAGGGGTACGC---CCCTGCTCCTCGTCTCTCTGTTCGCTCT------GCTTCAGCCTGGGGACTGCCGCCT  65

Query   69  GGCCAATGCGGAGGAAAAGCTGATGGACGACCTTCTGAACAAAACCCGTTACAATAACCTGATCCGCCCAGCCA  142
            ||||||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct   66  GGCCAACGCAGAGGAGAAGCTGATGGATGATCTCCTGAACAAAACCCGCTACAACAACCTGATCCGCCCAGCCA  139

Query  143  CCAGCTCCTCACAGCTCATCTCCATCAAGCTGCAGCTCTCCCTGGCCCAGCTTATCAGCGTGAATGAGCGAGAG  216
            ||||||||||.|||||||||||||||...|||.||||.||.|||.|||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct  140  CCAGCTCCTCCCAGCTCATCTCCATCCGCCTGGAGCTATCACTGTCCCAGCTCATCAGTGTGAATGAGCGAGAA  213

Query  217  CAGATCATGACCACCAATGTCTGGCTGAAACAGGAATGGACTGATTACCGCCTGACCTGGAACAGCTCCCGCTA  290
            ||||||||||||||||...|||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  214  CAGATCATGACCACCAGCATCTGGCTGAAACAGGAATGGACTGACTACCGCCTGGCCTGGAACAGCTCCTGCTA  287

Query  291  CGAGGGTGTGAACATCCTGAGGATCCCTGCAAAGCGCATCTGGTTGCCTGACATCGTGCTTTACAACAACGCCG  364
            .||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||.|.||||||||.||||
Sbjct  288  TGAAGGGGTGAACATTCTGAGGATTCCTGCAAAGCGAGTCTGGTTGCCTGACATCGTGTTGTACAACAATGCCG  361

Query  365  ACGGGACCTATGAGGTGTCTGTCTACACCAACTTGATAGTCCGGTCCAACGGCAGCGTCCTGTGGCTGCCCCCT  438
            |.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.||.||||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct  362  ATGGGACCTATGAGGTGTCTGTCTACACCAACGTGATCGTGCGTTCCAACGGCAGCATCCAGTGGCTGCCCCCT  435

Query  439  GCCATCTACAAGAGCGCCTGCAAGATTGAGGTGAAGTACTTTCCCTTCGACCAGCAGAACTGCACCCTCAAGTT  512
            ||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  436  GCCATCTACAAGAGTGCCTGCAAGATAGAGGTGAAGCACTTTCCCTTCGACCAGCAGAACTGCACCCTCAAATT  509

Query  513  CCGCTCCTGGACCTATGACCACACGGAGATAGACATGGTCCTCATGACGCCCACAGCCAGCATGGATGACTTTA  586
            .|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|...|.||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  510  TCGCTCCTGGACCTATGACCACACAGAGATTGACATGGTTCTTAAATCACCCACAGCCATCATGGATGACTTTA  583

Query  587  CTCCCAGTGGTGAGTGGGACATAGTGGCCCTCCCAGGGAGAAGGACAGTGAACCCACAAGACCCCAGCTACGTG  660
            |.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  584  CCCCCAGCGGTGAATGGGACATTGTGGCCCTCCCGGGTCGAAGGACAGTGAACCCACAGGACCCCAGCTATGTG  657

Query  661  GACGTGACTTACGACTTCATCATCAAGCGCAAGCCTCTGTTCTACACCATCAACCTCATCATCCCCTGCGTGCT  734
            ||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct  658  GACGTGACCTATGACTTCATCATCAAGCGCAAGCCACTCTTCTACACCATCAATCTGATCATCCCTTGTGTGCT  731

Query  735  CACCACCTTGCTGGCCATCCTCGTCTTCTACCTGCCATCCGACTGCGGCGAGAAGATGACACTGTGCATCTCAG  808
            ||.|||.|.||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  732  CATCACGTCGCTGGCTATCCTGGTCTTCTACCTGCCCTCCGACTGTGGGGAGAAGATGACGCTCTGCATCTCAG  805

Query  809  TGCTGCTGGCACTGACATTCTTCCTGCTGCTCATCTCCAAGATCGTGCCACCCACCTCCCTCGATGTGCCTCTC  882
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||..|.||.|||
Sbjct  806  TGCTGCTGGCACTCACATTCTTCCTGCTGCTCATCTCCAAGATCGTGCCTCCCACCTCCCTTGACATTCCCCTC  879

Query  883  ATCGGCAAGTACCTCATGTTCACCATGGTGCTGGTCACCTTCTCCATCGTCACCAGCGTCTGTGTGCTCAATGT  956
            ||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||..||.|||||.||||||||
Sbjct  880  ATTGGCAAGTACCTCTTGTTCACCATGGTGCTGGTCACCTTTTCCATCGTCACCACTGTGTGTGTCCTCAATGT  953

Query  957  GCACCACCGCTCGCCCAGCACCCACACCATGGCACCCTGGGTCAAGCGCTGCTTCCTGCACAAGCTGCCTACCT  1030
            |||||||||.||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||...||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  954  GCACCACCGTTCACCCAGCACTCACACCATGGCATCCTGGGTCAAGGAGTGCTTCCTGCACAAGCTGCCCACCT  1027

Query 1031  TCCTCTTCATGAAGCGCCCTGGCCCCGACAG-CAGCCCGGCCAGAGCCTTCCCGC---CCAGCAAGTCATG--C  1098
            ||||||||||||||||||||||.|..|| || ||||||.|||||.|   ||||.|   |||||.||  .||  |
Sbjct 1028  TCCTCTTCATGAAGCGCCCTGGTCTGGA-AGTCAGCCCCGCCAGGG---TCCCTCATTCCAGCCAG--CTGCAC  1095

Query 1099  GTGACCA-AGCCCGAGGCCACCGCCACCT------------CCACCAGCCCCTCCAACTTCTATGGGAACTCCA  1159
            .|||||| || |.||.||.||..||||||            |||.||||||.||||||.||||||||||.||||
Sbjct 1096  TTGACCACAG-CTGAAGCTACGTCCACCTCTGCCTTAGGCCCCAGCAGCCCATCCAACCTCTATGGGAATTCCA  1168

Query 1160  TGTACTTTGTGAACCCCGCCTCTGCAGCTTCCAAGTCTCCAGCCGGCT-CTACCCCGGTGGCTATCCCCAGGGA  1232
            ||||||||||||||||.|.|.||||..||.|.||||||.|||.|.||| |.||.|.|..||| .||||||||||
Sbjct 1169  TGTACTTTGTGAACCCTGTCCCTGCCACTCCTAAGTCTGCAGTCAGCTCCCACACGGCAGGC-CTCCCCAGGGA  1241

Query 1233  TTTCTGGCTGCGGTCCTCTGGGAGGTTCCGACAGGATGTGCAGGAGGCATTAGAAGGTGTCAGCTTCATCGCCC  1306
            |..|.|||||.|||||||||||||||||||.||.|||.|.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 1242  TGCCCGGCTGAGGTCCTCTGGGAGGTTCCGGCAAGATCTACAGGAAGCATTAGAGGGCGTCAGCTTCATCGCAC  1315

Query 1307  AGCACATGAAGAATGACGATGAAGACCAGAGTGTCGTTGAGGACTGGAAGTACGTGGCTATGGTGGTGGACCGG  1380
            ||||..||.|||.|||.|||..|||.|||||||||.|.|||||||||||.|.|||.||.|||||.||.|||||.
Sbjct 1316  AGCATTTGGAGAGTGATGATCGAGATCAGAGTGTCATCGAGGACTGGAAATTCGTCGCAATGGTCGTCGACCGC  1389

Query 1381  CTGTTCCTGTGGGTGTTCATGTTTGTGTGCGTCCTGGGCACTGTGGGGCTCTTCCTACCGCCCCTCTTCCAGAC  1454
            ||||||||||||||||||.||.|||||||..|.||||||||..|||||||||||||.||.|||||||||||||.
Sbjct 1390  CTGTTCCTGTGGGTGTTCGTGATTGTGTGTATTCTGGGCACCATGGGGCTCTTCCTGCCACCCCTCTTCCAGAT  1463

Query 1455  CCATGCAGCTTCTGAGGGGCCCTACGCTGCCCAGCGTGAC  1494
            |||.|||.|.||..||||.|.|                  
Sbjct 1464  CCACGCACCCTCCAAGGGCCTC------------------  1485