Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475999
• Subject: XM_011521190.2
• Aligned Length: 1494
• Identities: 1272
• Gaps: 222

Alignment

Query    1  ATGAGGCGCGCGCCTTCCCTGGTCCTTTTCTTCCTGGTCGCCCTTTGCGGGCGCGGGAACTGCCGCGTGGCCAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGCGGAGGAAAAGCTGATGGACGACCTTCTGAACAAAACCCGTTACAATAACCTGATCCGCCCAGCCACCAGCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCTCACAGCTCATCTCCATCAAGCTGCAGCTCTCCCTGGCCCAGCTTATCAGCGTGAATGAGCGAGAGCAGATC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ATGACCACCAATGTCTGGCTGAAACAGGAATGGACTGATTACCGCCTGACCTGGAACAGCTCCCGCTACGAGGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCACCAATGTCTGGCTGAAACAGGAATGGACTGATTACCGCCTGACCTGGAACAGCTCCCGCTACGAGGG  74

Query  297  TGTGAACATCCTGAGGATCCCTGCAAAGCGCATCTGGTTGCCTGACATCGTGCTTTACAACAACGCCGACGGGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTGAACATCCTGAGGATCCCTGCAAAGCGCATCTGGTTGCCTGACATCGTGCTTTACAACAACGCCGACGGGA  148

Query  371  CCTATGAGGTGTCTGTCTACACCAACTTGATAGTCCGGTCCAACGGCAGCGTCCTGTGGCTGCCCCCTGCCATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTATGAGGTGTCTGTCTACACCAACTTGATAGTCCGGTCCAACGGCAGCGTCCTGTGGCTGCCCCCTGCCATC  222

Query  445  TACAAGAGCGCCTGCAAGATTGAGGTGAAGTACTTTCCCTTCGACCAGCAGAACTGCACCCTCAAGTTCCGCTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TACAAGAGCGCCTGCAAGATTGAGGTGAAGTACTTTCCCTTCGACCAGCAGAACTGCACCCTCAAGTTCCGCTC  296

Query  519  CTGGACCTATGACCACACGGAGATAGACATGGTCCTCATGACGCCCACAGCCAGCATGGATGACTTTACTCCCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTGGACCTATGACCACACGGAGATAGACATGGTCCTCATGACGCCCACAGCCAGCATGGATGACTTTACTCCCA  370

Query  593  GTGGTGAGTGGGACATAGTGGCCCTCCCAGGGAGAAGGACAGTGAACCCACAAGACCCCAGCTACGTGGACGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTGGTGAGTGGGACATAGTGGCCCTCCCAGGGAGAAGGACAGTGAACCCACAAGACCCCAGCTACGTGGACGTG  444

Query  667  ACTTACGACTTCATCATCAAGCGCAAGCCTCTGTTCTACACCATCAACCTCATCATCCCCTGCGTGCTCACCAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACTTACGACTTCATCATCAAGCGCAAGCCTCTGTTCTACACCATCAACCTCATCATCCCCTGCGTGCTCACCAC  518

Query  741  CTTGCTGGCCATCCTCGTCTTCTACCTGCCATCCGACTGCGGCGAGAAGATGACACTGTGCATCTCAGTGCTGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTGCTGGCCATCCTCGTCTTCTACCTGCCATCCGACTGCGGCGAGAAGATGACACTGTGCATCTCAGTGCTGC  592

Query  815  TGGCACTGACATTCTTCCTGCTGCTCATCTCCAAGATCGTGCCACCCACCTCCCTCGATGTGCCTCTCATCGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGCACTGACATTCTTCCTGCTGCTCATCTCCAAGATCGTGCCACCCACCTCCCTCGATGTGCCTCTCATCGGC  666

Query  889  AAGTACCTCATGTTCACCATGGTGCTGGTCACCTTCTCCATCGTCACCAGCGTCTGTGTGCTCAATGTGCACCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGTACCTCATGTTCACCATGGTGCTGGTCACCTTCTCCATCGTCACCAGCGTCTGTGTGCTCAATGTGCACCA  740

Query  963  CCGCTCGCCCAGCACCCACACCATGGCACCCTGGGTCAAGCGCTGCTTCCTGCACAAGCTGCCTACCTTCCTCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCGCTCGCCCAGCACCCACACCATGGCACCCTGGGTCAAGCGCTGCTTCCTGCACAAGCTGCCTACCTTCCTCT  814

Query 1037  TCATGAAGCGCCCTGGCCCCGACAGCAGCCCGGCCAGAGCCTTCCCGCCCAGCAAGTCATGCGTGACCAAGCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCATGAAGCGCCCTGGCCCCGACAGCAGCCCGGCCAGAGCCTTCCCGCCCAGCAAGTCATGCGTGACCAAGCCC  888

Query 1111  GAGGCCACCGCCACCTCCACCAGCCCCTCCAACTTCTATGGGAACTCCATGTACTTTGTGAACCCCGCCTCTGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGGCCACCGCCACCTCCACCAGCCCCTCCAACTTCTATGGGAACTCCATGTACTTTGTGAACCCCGCCTCTGC  962

Query 1185  AGCTTCCAAGTCTCCAGCCGGCTCTACCCCGGTGGCTATCCCCAGGGATTTCTGGCTGCGGTCCTCTGGGAGGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGCTTCCAAGTCTCCAGCCGGCTCTACCCCGGTGGCTATCCCCAGGGATTTCTGGCTGCGGTCCTCTGGGAGGT  1036

Query 1259  TCCGACAGGATGTGCAGGAGGCATTAGAAGGTGTCAGCTTCATCGCCCAGCACATGAAGAATGACGATGAAGAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCCGACAGGATGTGCAGGAGGCATTAGAAGGTGTCAGCTTCATCGCCCAGCACATGAAGAATGACGATGAAGAC  1110

Query 1333  CAGAGTGTCGTTGAGGACTGGAAGTACGTGGCTATGGTGGTGGACCGGCTGTTCCTGTGGGTGTTCATGTTTGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGAGTGTCGTTGAGGACTGGAAGTACGTGGCTATGGTGGTGGACCGGCTGTTCCTGTGGGTGTTCATGTTTGT  1184

Query 1407  GTGCGTCCTGGGCACTGTGGGGCTCTTCCTACCGCCCCTCTTCCAGACCCATGCAGCTTCTGAGGGGCCCTACG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTGCGTCCTGGGCACTGTGGGGCTCTTCCTACCGCCCCTCTTCCAGACCCATGCAGCTTCTGAGGGGCCCTACG  1258

Query 1481  CTGCCCAGCGTGAC  1494
            ||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGCCCAGCGTGAC  1272