Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476234
• Subject: XM_011529768.2
• Aligned Length: 1440
• Identities: 1209
• Gaps: 231

Alignment

Query    1  ATGGCTTCAGACAGCATATTTGAGTCATTTCCTTCGTACCCACAGTGCTTCATGAGAGAATGCATACTTGGAAT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
Sbjct    1  ATGGCTTCAGACAGCATATTTGAGTCATTTCCTTCGTACCCACAGTGCTTCATGAGA-----------------  57

Query   75  GAATCCTTCTAGAGACGTCCACGATGCCAGCACGAGCCGCCGCTTCACGCCGCCTTCCACCGCGCTGAGCCCAG  148
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   58  ----------------------GATGCCAGCACGAGCCGCCGCTTCACGCCGCCTTCCACCGCGCTGAGCCCAG  109

Query  149  GCAAGATGAGCGAGGCGTTGCCGCTGGGCGCCCCGGACGCCGGCGCTGCCCTGGCCGGCAAGCTGAGGAGCGGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  110  GCAAGATGAGCGAGGCGTTGCCGCTGGGCGCCCCGGACGCCGGCGCTGCCCTGGCCGGCAAGCTGAGGAGCGGC  183

Query  223  GACCGCAGCATGGTGGAGGTGCTGGCCGACCACCCGGGCGAGCTGGTGCGCACCGACAGCCCCAACTTCCTCTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  184  GACCGCAGCATGGTGGAGGTGCTGGCCGACCACCCGGGCGAGCTGGTGCGCACCGACAGCCCCAACTTCCTCTG  257

Query  297  CTCCGTGCTGCCTACGCACTGGCGCTGCAACAAGACCCTGCCCATCGCTTTCAAGGTGGTGGCCCTAGGGGATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  258  CTCCGTGCTGCCTACGCACTGGCGCTGCAACAAGACCCTGCCCATCGCTTTCAAGGTGGTGGCCCTAGGGGATG  331

Query  371  TTCCAGATGGCACTCTGGTCACTGTGATGGCTGGCAATGATGAAAACTACTCGGCTGAGCTGAGAAATGCTACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  332  TTCCAGATGGCACTCTGGTCACTGTGATGGCTGGCAATGATGAAAACTACTCGGCTGAGCTGAGAAATGCTACC  405

Query  445  GCAGCCATGAAGAACCAGGTTGCAAGATTTAATGACCTCAGGTTTGTCGGTCGAAGTGGAAGAGGGAAAAGCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  406  GCAGCCATGAAGAACCAGGTTGCAAGATTTAATGACCTCAGGTTTGTCGGTCGAAGTGGAAGAGGGAAAAGCTT  479

Query  519  CACTCTGACCATCACTGTCTTCACAAACCCACCGCAAGTCGCCACCTACCACAGAGCCATCAAAATCACAGTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  480  CACTCTGACCATCACTGTCTTCACAAACCCACCGCAAGTCGCCACCTACCACAGAGCCATCAAAATCACAGTGG  553

Query  593  ATGGGCCCCGAGAACCTCGAAGACATCGGCAGAAACTAGATGATCAGACCAAGCCCGGGAGCTTGTCCTTTTCC  666
            |||||||||||||||||||||                                                     
Sbjct  554  ATGGGCCCCGAGAACCTCGAA-----------------------------------------------------  574

Query  667  GAGCGGCTCAGTGAACTGGAGCAGCTGCGGCGCACAGCCATGAGGGTCAGCCCACACCACCCAGCCCCCACGCC  740
                                                                                      
Sbjct  575  --------------------------------------------------------------------------  574

Query  741  CAACCCTCGTGCCTCCCTGAACCACTCCACTGCCTTTAACCCTCAGCCTCAGAGTCAGATGCAGGATACAAGGC  814
                                                                             |||||||||
Sbjct  575  -----------------------------------------------------------------ATACAAGGC  583

Query  815  AGATCCAACCATCCCCACCGTGGTCCTACGATCAGTCCTACCAATACCTGGGATCCATTGCCTCTCCTTCTGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  584  AGATCCAACCATCCCCACCGTGGTCCTACGATCAGTCCTACCAATACCTGGGATCCATTGCCTCTCCTTCTGTG  657

Query  889  CACCCAGCAACGCCCATTTCACCTGGACGTGCCAGCGGCATGACAACCCTCTCTGCAGAACTTTCCAGTCGACT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  658  CACCCAGCAACGCCCATTTCACCTGGACGTGCCAGCGGCATGACAACCCTCTCTGCAGAACTTTCCAGTCGACT  731

Query  963  CTCAACGGCACCCGACCTGACAGCGTTCAGCGACCCGCGCCAGTTCCCCGCGCTGCCCTCCATCTCCGACCCCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  732  CTCAACGGCACCCGACCTGACAGCGTTCAGCGACCCGCGCCAGTTCCCCGCGCTGCCCTCCATCTCCGACCCCC  805

Query 1037  GCATGCACTATCCAGGCGCCTTCACCTACTCCCCGACGCCGGTCACCTCGGGCATCGGCATCGGCATGTCGGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  806  GCATGCACTATCCAGGCGCCTTCACCTACTCCCCGACGCCGGTCACCTCGGGCATCGGCATCGGCATGTCGGCC  879

Query 1111  ATGGGCTCGGCCACGCGCTACCACACCTACCTGCCGCCGCCCTACCCCGGCTCGTCGCAAGCGCAGGGAGGCCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  880  ATGGGCTCGGCCACGCGCTACCACACCTACCTGCCGCCGCCCTACCCCGGCTCGTCGCAAGCGCAGGGAGGCCC  953

Query 1185  GTTCCAAGCCAGCTCGCCCTCCTACCACCTGTACTACGGCGCCTCGGCCGGCTCCTACCAGTTCTCCATGGTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  954  GTTCCAAGCCAGCTCGCCCTCCTACCACCTGTACTACGGCGCCTCGGCCGGCTCCTACCAGTTCTCCATGGTGG  1027

Query 1259  GCGGCGAGCGCTCGCCGCCGCGCATCCTGCCGCCCTGCACCAACGCCTCCACCGGCTCCGCGCTGCTCAACCCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028  GCGGCGAGCGCTCGCCGCCGCGCATCCTGCCGCCCTGCACCAACGCCTCCACCGGCTCCGCGCTGCTCAACCCC  1101

Query 1333  AGCCTCCCGAACCAGAGCGACGTGGTGGAGGCCGAGGGCAGCCACAGCAACTCCCCCACCAACATGGCGCCCTC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102  AGCCTCCCGAACCAGAGCGACGTGGTGGAGGCCGAGGGCAGCCACAGCAACTCCCCCACCAACATGGCGCCCTC  1175

Query 1407  CGCGCGCCTGGAGGAGGCCGTGTGGAGGCCCTAC  1440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176  CGCGCGCCTGGAGGAGGCCGTGTGGAGGCCCTAC  1209