Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476514
- Subject:
- XR_001745491.1
- Aligned Length:
- 2428
- Identities:
- 1644
- Gaps:
- 771
Alignment
Query 1 ----------------------------------------------------------ATGACGCTGCGCGCGG 16
||||||||||||||||
Sbjct 1 CTTCGCGCATCTCCCAGGTTAGCTGCGTGTCCGGGTGCTAGGCTGCAGACCCGCCGCCATGACGCTGCGCGCGG 74
Query 17 CCGTCTTCGACCTTGACGGGGTGCTGGCGCTGCCAGCGGTGTTCGGCGTCCTCGGCCGCACGGAGGAGGCCCTG 90
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCGTCTTCGACCTTGACGGGGTGCTGGCGCTGCCAGCGGTGTTCGGCGTCCTCGGCCGCACGGAGGAGGCCCTG 148
Query 91 GCGCTGCCCAGAGGACTTCTGAATGATGCTTTCCAGAAAGGGGGACCAGAGGGTGCCACTACCCGGCTTATGAA 164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCGCTGCCCAGAGGACTTCTGAATGATGCTTTCCAGAAAGGGGGACCAGAGGGTGCCACTACCCGGCTTATGAA 222
Query 165 AGGAGAGATCACACTTTCCCAGTGGATACCACTCATGGAAGAAAACTGCAGGAAGTGCTCCGAGACCGCTAAAG 238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGGAGAGATCACACTTTCCCAGTGGATACCACTCATGGAAGAAAACTGCAGGAAGTGCTCCGAGACCGCTAAAG 296
Query 239 TCTGCCTCCCCAAGAATTTCTCCATAAAAGAAATCTTTGACAAGGCGATTTCAGCCAGAAAGATCAACCGCCCC 312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCTGCCTCCCCAAGAATTTCTCCATAAAAGAAATCTTTGACAAGGCGATTTCAGCCAGAAAGATCAACCGCCCC 370
Query 313 ATGCTCCAGGCAGCTCTCATGCTCAGGAAGAAAGGATTCACTACTGCCATCCTCACCAACACCTGGCTGGACGA 386
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATGCTCCAGGCAGCTCTCATGCTCAGGAAGAAAGGATTCACTACTGCCATCCTCACCAACACCTGGCTGGACGA 444
Query 387 CCGTGCTGAGAGAGATGGCCTGGCCCAGCTGATGTGTGAGCTGAAGATGCACTTTGACTTCCTGATAGAGTCGT 460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCGTGCTGAGAGAGATGGCCTGGCCCAGCTGATGTGTGAGCTGAAGATGCACTTTGACTTCCTGATAGAGTCGT 518
Query 461 GTCAGGTGGGAATGGTCAAACCTGAACCTCAGATCTACAAGTTTCTGCTGGACACCCTGAAGGCCAGCCCCAGT 534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTCAGGTGGGAATGGTCAAACCTGAACCTCAGATCTACAAGTTTCTGCTGGACACCCTGAAGGCCAGCCCCAGT 592
Query 535 GAGGTCGTTTTTTTGGATGACATCGGGGCTAATCTGAAGCCAGCCCGTGACTTGGGAATGGTCACCATCCTGGT 608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAGGTCGTTTTTTTGGATGACATCGGGGCTAATCTGAAGCCAGCCCGTGACTTGGGAATGGTCACCATCCTGGT 666
Query 609 CCAGGACACTGACACGGCCCTGAAAGAACTGGAGAAAGTGACCGGAATCCAGCTTCTCAATACCCCGGCCCCTC 682
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCAGGACACTGACACGGCCCTGAAAGAACTGGAGAAAGTGACCGGAATCCAGCTTCTCAATACCCCGGCCCCTC 740
Query 683 TGCCGACCTCTTGCAATCCAAGTGACATGAGCCATGGGTACGTGACAGTAAAGCCCAGGGTCCGTCTGCATTTT 756
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGCCGACCTCTTGCAATCCAAGTGACATGAGCCATGGGTACGTGACAGTAAAGCCCAGGGTCCGTCTGCATTTT 814
Query 757 GTGGAGCTGGGCTCCGGCCCTGCTGTGTGCCTCTGCCATGGATTTCCCGAGAGTTGGTATTCTTGGAGGTACCA 830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTGGAGCTGGGCTCCGGCCCTGCTGTGTGCCTCTGCCATGGATTTCCCGAGAGTTGGTATTCTTGGAGGTACCA 888
Query 831 GATCCCTGCTCTGGCCCAGGCAGGTTACCGGGTCCTAGCTATGGACATGAAAGGCTATGGAGAGTCATCTGCTC 904
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GATCCCTGCTCTGGCCCAGGCAGGTTACCGGGTCCTAGCTATGGACATGAAAGGCTATGGAGAGTCATCTGCTC 962
Query 905 CTCCCGAAATAGAAGAATATTGCATGGAAGTGTTATGTAAGGAGATGGTAACCTTCCTGGATAAACTGGGCCTC 978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTCCCGAAATAGAAGAATATTGCATGGAAGTGTTATGTAAGGAGATGGTAACCTTCCTGGATAAACTGGGCCTC 1036
Query 979 TCTCAAGCAGTGTTCATTGGCCATGACTGGGGTGGCATGCTGGTGTGGTACATGGCTCTCTTCTACCCCGAGAG 1052
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCTCAAGCAGTGTTCATTGGCCATGACTGGGGTGGCATGCTGGTGTGGTACATGGCTCTCTTCTACCCCGAGAG 1110
Query 1053 AGTGAGGGCGGTGGCCAGTTTGAATACTCCCTTCATACCAGCAAATCCCAACATGTCCCCTTTGGAGAGTATCA 1126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGTGAGGGCGGTGGCCAGTTTGAATACTCCCTTCATACCAGCAAATCCCAACATGTCCCCTTTGGAGAGTATCA 1184
Query 1127 AAGCCAACCCAGTATTTGATTACCAGCTCTACTTCCAAGAACCAGGAGTGGCTGAGGCTGAACTGGAACAGAAC 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAGCCAACCCAGTATTTGATTACCAGCTCTACTTCCAAGAACCAGGAGTGGCTGAGGCTGAACTGGAACAGAAC 1258
Query 1201 CTGAGTCGGACTTTCAAAAGCCTCTTCAGAGCAAGCGATGAGAGTGTTTTATCCATGCATAAAGTCTGTGAAGC 1274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTGAGTCGGACTTTCAAAAGCCTCTTCAGAGCAAGCGATGAGAGTGTTTTATCCATGCATAAAGTCTGTGAAGC 1332
Query 1275 GGGAGGACTTTTTGTAAATAGCCCAGAAGAGCCCAGCCTCAGCAGGATGGTCACTGAGGAGGAAATCCAGTTCT 1348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GGGAGGACTTTTTGTAAATAGCCCAGAAGAGCCCAGCCTCAGCAGGATGGTCACTGAGGAGGAAATCCAGTTCT 1406
Query 1349 ATGTGCAGCAGTTCAAGAAGTCTGGTTTCAGAGGTCCTCTAAACTGGTACCGAAACATGGAAAGGAACTGGAAG 1422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ATGTGCAGCAGTTCAAGAAGTCTGGTTTCAGAGGTCCTCTAAACTGGTACCGAAACATGGAAAGGAACTGGAAG 1480
Query 1423 TGGGCTTGCAAAAGCTTGGGACGGAAGATCCTGATTCCGGCCCTGATGGTCACGGCGGAGAAGGACTTCGTGCT 1496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGGGCTTGCAAAAGCTTGGGACGGAAGATCCTGATTCCGGCCCTGATGGTCACGGCGGAGAAGGACTTCGTGCT 1554
Query 1497 CGTTCCTCAGATGTCCCAGCACATGGAGGACTGGATTCCCCACCTGAAAAGGGGACACATTGAGGACTGTGGGC 1570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CGTTCCTCAGATGTCCCAGCACATGGAGGACTGGATTCCCCACCTGAAAAGGGGACACATTGAGGACTGTGGGC 1628
Query 1571 ACTGGACACAGATGGACAAG-----------CCAACCGAGGTGAATCAG--ATCCTCAT-------TAAGTGGC 1624
|||||||||||||||||||| ||.|.|| |.| .|||.||| .||||.||
Sbjct 1629 ACTGGACACAGATGGACAAGTCCTCGTTTCTCCCAGCG--------CTGCCCTCCCCATCTAAGCCCAAGTCGC 1694
Query 1625 TG-GA---------------TTCTG----ATGCCC------------------GGAAC---------CCA---- 1647
.| || ||.|| |.|||| ||||| |||
Sbjct 1695 CGTGAGCCCGCGCTGCCCCCTTGTGGCCAAAGCCCTCCCCAGCTCAGGAAACGGGAACGCTTGGCGGCCAGGCT 1768
Query 1648 -------------------CCGG----TGGTC------TCAAAGATG--------------------------- 1665
|||| ||.|| ||.||||.|
Sbjct 1769 GAGAGTCGGTGCGCGTGACCCGGCTTCTGCTCGCAGCATCCAAGAAGTTGCAATAACGTGGAAGGATGGGGAAC 1842
Query 1666 -------------------------------------------------------------------------- 1665
Sbjct 1843 GGCGCCTCCCTGGCTAGCGTGAAACTCAGCCACAGCACAAAATTGAGGCTGTTGGCCGTGAGCGGCTCTCAAAG 1916
Query 1666 -------------------------------------------------------------------------- 1665
Sbjct 1917 CTGAATTTGAGCCATGCTAAAATACTTACCTTGGACATAAGCTAAGCTTTAAGTTTGTTGTTTATAACTTCAAA 1990
Query 1666 -------------------------------------------------------------------------- 1665
Sbjct 1991 GAGAGACAAGGGACAGTGACTTAAGAATATTCTAAGCTATAAATTTACATGTGGACTTTGCTACACACCTGGGA 2064
Query 1666 -------------------------------------------------------------------------- 1665
Sbjct 2065 TGCAGCCAGATGAGTTTTGTTCCATTGCAGTACATCTGATGACCAGAATTCTATCAGAGAATGTTAATGAACGA 2138
Query 1666 -------------------------------------------------------------------------- 1665
Sbjct 2139 AAAGCCTGAGCTTTAAGACTGAGATTGGTACCACGGGTAGTCATGGCCACCTGCTGGCAGCGTAGGGTACTGCA 2212
Query 1666 -------------------------------------------------------------------------- 1665
Sbjct 2213 GCCCAGCTATGGTTCAGACTAAAAGCCGAGAAACGCCTGTGGTCCAGGGAAAGGTATGAAGATCATATAAACCG 2286
Query 1666 -------------------------------------------------------------------------- 1665
Sbjct 2287 GCGGTGGACAGGAAATGCCACAGTCAAGAAGATGCCCCTGGGATGCTGAGCTCTTACAACTCGAAATCAACAGC 2360
Query 1666 ------------------------------------------------------------ 1665
Sbjct 2361 TTTTACAAATAAAACCGCTGCAAAAGCAATAGCTCTTACAAATAAAACTGATAATTTGGA 2420
