Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476623
• Subject: NM_177474.5
• Aligned Length: 1950
• Identities: 1672
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ---ATGGAAGTTAAAGGGAAAAAGCAATTCACAGGAAAGAATACAAAGACAGCACAAGAAAAAAACAGATTTCA  71
               ||||||||.||||||||.||..|.||.||||||||||.|.||.|||||.||||||.|||.||.|.||||||
Sbjct    1  ATGATGGAAGTCAAAGGGAAGAAAAAGTTTACAGGAAAGAGTCCACAGACATCACAAGGAAAGAATAAATTTCA  74

Query   72  TAAAAATAGTGATTCTGGTTCTTCAAAGACATTTCCAACAAGGAAAGTTGCTAAAGAAGGTGGACCTAAAGTCA  145
            |||.||.|||||.|||.||||||||||||||||.|   |||||||||.||.|||.|||||.|||||||||||||
Sbjct   75  TAAGAACAGTGAGTCTAGTTCTTCAAAGACATTCC---CAAGGAAAGCTGTTAAGGAAGGCGGACCTAAAGTCA  145

Query  146  CATCTAGGAACTTTGAGAAAAGTATCACAAAACTTGGGAAAAAGGGTGTAAAGCAGTTCAAGAATAAGCAGCAA  219
            ||||||.|||||||||||||.||..||||||||.|||.||.||.|||||.||||||||||||||.||||..|||
Sbjct  146  CATCTAAGAACTTTGAGAAAGGTGCCACAAAACCTGGCAAGAAAGGTGTGAAGCAGTTCAAGAACAAGCCACAA  219

Query  220  GGGGACAAATCACCAAAGAACAAATTCCAGCCGGCAAATAAATTCAACAAGAAGAGAAAATTCCAGCCAGATGG  293
            ||||.||||..|||.|||.|||||||.|||..||||||||||||||.|||||||.|.|||||||||||||||||
Sbjct  220  GGGGGCAAAGGACCGAAGGACAAATTTCAGAAGGCAAATAAATTCAGCAAGAAGCGGAAATTCCAGCCAGATGG  293

Query  294  TAGAAGCGATGAATCAGCAGCCAAGAAGCCCAAATGGGATGACTTCAAAAAGAAGAAGAAAGAACTGAAGCAAA  367
            |..|||.||||||||||.|||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  294  TGAAAGTGATGAATCAGGAGCCAAGAAACCCAAGTGGGATGACTTCAAAAAGAAGAAGAAAGAGCTGAAGCAGA  367

Query  368  GCAGACAACTCAGTGATAAAACCAACTATGACATTGTTGTTCGGGCAAAGCAGATGTGGGAGATTTTAAGAAGA  441
            ||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||..||.||||||
Sbjct  368  GCAGGCAGCTCAGTGACAAGACCAACTATGACATCGTGGTTCGAGCAAAGCACATTTGGGAGAGCTTGAGAAGA  441

Query  442  AAAGACTGTGACAAAGAAAAAAGAGTAAAGTTAATGAGTGATTTGCAGAAGTTGATTCAAGGGAAAATTAAAAC  515
            |||||.||||||||.||||||.|.||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  AAAGATTGTGACAAGGAAAAACGGGTGAAGCTCATGAGTGATTTGCAGAAGTTGATTCAAGGGAAAATTAAAAC  515

Query  516  TATTGCATTTGCACACGATTCAACTCGTGTGATCCAGTGTTACATTCAGTATGGTAATGAAGAACAGAGAAAAC  589
            |||.||.||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.|.||||||||||||.||.||.||.|||||.||.|
Sbjct  516  TATCGCCTTTGCACATGACTCGACGCGCGTGATCCAGTGCTTCATTCAGTATGGGAACGAGGAGCAGAGGAAGC  589

Query  590  AGGCTTTTGAAGAATTGCGAGATGATTTGGTTGAGTTAAGTAAAGCCAAATATTCGAGAAATATTGTTAAGAAA  663
            |||||||..||||.||||.||..||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  590  AGGCTTTCCAAGAGTTGCAAGGCGACTTGGTTGAATTAAGTAAAGCCAAATATTCCAGGAATATCGTTAAGAAA  663

Query  664  TTTCTCATGTATGGAAGTAAACCACAGATTGCAGAGATAATCAGAAGTTTTAAAGGCCACGTGAGGAAGATGCT  737
            ||||||||||||||||||||.|||||..||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  664  TTTCTCATGTATGGAAGTAAGCCACAAGTTGCGGAGATAATCAGAAGTTTTAAAGGTCATGTGAGGAAGATGCT  737

Query  738  GCGGCATGCGGAAGCATCAGCCATCGTGGAGTACGCATACAATGACAAAGCCATTTTGGAGCAGAGGAACATGC  811
            |||||||.||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  738  GCGGCATTCGGAGGCATCGGCCATTGTGGAGTACGCATACAACGACAAAGCCATTTTGGAACAGAGGAACATGC  811

Query  812  TGACGGAAGAGCTCTATGGGAACACATTTCAGCTTTACAAGTCAGCAGATCACCCAACTCTGGACAAAGTGTTA  885
            ||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.|.
Sbjct  812  TGACAGAGGAGCTCTATGGGAACACGTTTCAGCTTTACAAGTCAGCAGATCACCCAACGCTGGACAAGGTGCTG  885

Query  886  GAGTTACAGCCAGAAAAATTAGAACTTATTATGGATGAAATGAAACAGATTCTAACTCCAATGGCCCAAAAGGA  959
            |||.|.|||||||.|||..||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct  886  GAGCTGCAGCCAGCAAAGCTAGAGCTTATCATGGACGAGATGAAGCAGATTCTGACACCGATGGCCCAAAAGGA  959

Query  960  AGCTGTGATTAAGCACTCATTGGTGCATAAAGTATTCTTGGACTTTTTTACCTATGCACCCCCCAAA-CTCAGA  1032
            |||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||| ||| ||
Sbjct  960  AGCTGTGATTAAGCACTCACTCGTTCATAAAGTATTCTTGGACTTTTTTACCTACGCACCCCCAAAACCTC-GA  1032

Query 1033  TCAGAAATGATTGAAGCCATCCGCGAAGCGGTGGTCTACCTGGCACACACACACGATGGCGCCAGAGTGGCCAT  1106
            ||||||.|.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  TCAGAACTAATTGAAGCCATCCGGGAAGCAGTGGTGTACCTGGCCCACACACACGATGGCGCCAGAGTGGCCAT  1106

Query 1107  GCACTGCCTGTGGCATGGCACGCCCAAGGACAGGAAAGTGATTGTGAAAACAATGAAGACTTATGTTGAAAAGG  1180
            |||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1107  GCACTGCCTGTGGCACGGCACACCCAAGGACAGGAAAGTGATCGTGAAAACGATGAAGACGTATGTGGAGAAGG  1180

Query 1181  TGGCTAATGGCCAATACTCCCATTTGGTTTTACTGGCGGCATTTGATTGTATTGATGATACTAAGCTTGTGAAG  1254
            |.||.||||||||.|||||.||.||||||.|.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181  TTGCCAATGGCCAGTACTCTCACTTGGTTCTCCTGGCAGCGTTTGACTGTATTGATGATACTAAGCTTGTGAAG  1254

Query 1255  CAGATAATCATATCAGAAATTATCAGTTCATTGCCTAGCATAGTAAATGACAAATATGGAAGGAAGGTCCTATT  1328
            ||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1255  CAGATAATCATATCAGAAATCATCAGTTCCTTGCCCAGCATAGTTAATGACAAATACGGAAGGAAAGTCCTCTT  1328

Query 1329  GTACTTACTAAGCCCCAGAGATCCTGCACATACAGTACGAGAAATCATTGAAGTTCTGCAAAAAGGAGATGGAA  1402
            ||||||..|.|||||||||||.||.||.||.||.||.|..||..||||.||..|||||||.||.||.|||||.|
Sbjct 1329  GTACTTGATGAGCCCCAGAGACCCCGCCCACACGGTGCCCGAGCTCATCGAGCTTCTGCAGAAGGGTGATGGCA  1402

Query 1403  ATGCACACAGTAAGAAAGATACAGAGGTCCGCAGACGGGAGCTCCTAGAATCCATTTCTCCAGCTTTGTTAAGC  1476
            |.||.|||||.|||||.||.||.|...|||||.|.||.||||||.|.||.|||||.||||||||||||.|.|||
Sbjct 1403  ACGCGCACAGCAAGAAGGACACTGCAATCCGCCGGCGTGAGCTCTTGGAGTCCATCTCTCCAGCTTTGCTGAGC  1476

Query 1477  TACCTGCAAGAACACGCCCAAGAAGTGGTGCTAGATAAGTCTGCGTGTGTGTTGGTGTCTGACATTCTGGGATC  1550
            ||||||||||.||||.|.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||||||
Sbjct 1477  TACCTGCAAGGACACACTCAAGAGGTGGTGCTGGATAAGTCTGCATGTGTGCTGGTGTCTGACATGCTGGGATC  1550

Query 1551  TGCCACTGGAGACGTTCAGCCTACCATGAATGCCATCGCCAGCTTGGCAGCAACAGGACTGCATCCTGGTGGCA  1624
            |||.||||||||.|||||||||.|.|||.|||||||||||||.|||||||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 1551  TGCTACTGGAGATGTTCAGCCTGCTATGGATGCCATCGCCAGTTTGGCAGCAGCAGAACTGCATCCTGGTGGCA  1624

Query 1625  AGGACGGAGAGCTTCACATTGCAGAACATCCTGCAGGACATCTAGTTCTGAAGTGGTTAATAGAGCAAGATAAA  1698
            ||||||||||||||||..||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||.||||||||||||||
Sbjct 1625  AGGACGGAGAGCTTCATGTTGCTGAGCATCCTGCAGGACATCTGGTTCTCAAATGGTTACTAGAGCAAGATAAA  1698

Query 1699  AAGATGAAAGAAAATGGGAGAGAAGGTTGTTTTGCAAAAACACTTGTAGAGCATGTTGGTATGAAGAACCTGAA  1772
            |||||||||||||..||.|..||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||.||
Sbjct 1699  AAGATGAAAGAAAGCGGAAAGGAAGGTTGTTTTGCAAAAACCCTTGTAGAGCGTGTTGGTATGAAGAACCTCAA  1772

Query 1773  GTCCTGGGCTAGTGTAAATCGAGGTGCCATTATTCTTTCTAGCCTCCTCCAGAGTTGTGACCTGGAAGTTGCAA  1846
            |||||||||.||..|.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||..|||||||.||
Sbjct 1773  GTCCTGGGCCAGCATCAACCGAGGTGCCATTATTCTTTCCAGCCTTCTTCAGAGTTGTGACCAAGAAGTTGTAA  1846

Query 1847  ACAAAGTCAAAGCTGCACTGAAAAGCTTGATTCCTACATTGGAAAAAACCAAAAGCACCAGCAAAGGAATAGAA  1920
            ||||||||||||.||.|||||||..|.||||||||||.||||||||||.||||||||.|||||.|||.||..|.
Sbjct 1847  ACAAAGTCAAAGGTGGACTGAAACCCCTGATTCCTACCTTGGAAAAAAACAAAAGCAGCAGCAGAGGCATCCAG  1920

Query 1921  ATTCTACTTGAAAAACTGA--GCACA  1944
            |..||.|||||.||.||||  ||.  
Sbjct 1921  ACCCTGCTTGAGAAGCTGACTGCG--  1944