Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476821
• Subject: XM_011530905.2
• Aligned Length: 2058
• Identities: 1686
• Gaps: 372

Alignment

Query    1  ATGAAGCCACCATTTCTTTTGGCCCTTGTGGTCTGTTCTGTAGTCAGCACAAATCTGAAGATGGTGTCAAAGAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AAATTCTGTGGATGGCTGCATTGACTGGTCAGTGGATCTCAAGACATACATGGCTTTGGCAGGTGAACCAGTCC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GAGTGAAATGTGCCCTTTTCTACAGTTATATTCGTACCAACTATAGCACGGCCCAGAGCACTGGGCTCAGGCTT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ATGTGGTACAAAAACAAAGGTGATTTGGAAGAGCCCATCATCTTTTCAGAGGTCAGGATGAGCAAAGAGGAAGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TTCAATATGGTTTCACTCAGCTGAGGCACAAGACAGTGGATTCTACACTTGTGTTTTAAGAAACTCAACATATT  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  GCATGAAGGTGTCAATGTCCTTGACTGTTGCAGAGAATGAATCAGGCCTGTGCTACAACAGCAGGATCCGCTAT  444
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --ATGAAGGTGTCAATGTCCTTGACTGTTGCAGAGAATGAATCAGGCCTGTGCTACAACAGCAGGATCCGCTAT  72

Query  445  TTAGAAAAATCTGAAGTCACTAAAAGAAAGGAGATCTCCTGTCCAGACATGGATGACTTTAAAAAGTCCGATCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   73  TTAGAAAAATCTGAAGTCACTAAAAGAAAGGAGATCTCCTGTCCAGACATGGATGACTTTAAAAAGTCCGATCA  146

Query  519  GGAGCCTGATGTTGTGTGGTATAAGGAATGCAAGCCAAAAATGTGGAGAAGCATAATAATACAGAAAGGAAATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  147  GGAGCCTGATGTTGTGTGGTATAAGGAATGCAAGCCAAAAATGTGGAGAAGCATAATAATACAGAAAGGAAATG  220

Query  593  CTCTTCTGATCCAAGAAGTTCAAGAAGAAGATGGAGGAAATTACACATGTGAACTTAAATATGAAGGAAAACTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  221  CTCTTCTGATCCAAGAAGTTCAAGAAGAAGATGGAGGAAATTACACATGTGAACTTAAATATGAAGGAAAACTT  294

Query  667  GTAAGACGAACAACTGAATTGAAAGTTACAGCTTTACTCACAGACAAGCCTCCCAAGCCATTGTTCCCCATGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  GTAAGACGAACAACTGAATTGAAAGTTACAGCTTTACTCACAGACAAGCCTCCCAAGCCATTGTTCCCCATGGA  368

Query  741  GAATCAGCCAAGTGTTATAGATGTCCAGCTGGGTAAGCCTCTGAACATCCCCTGCAAAGCATTCTTCGGATTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  GAATCAGCCAAGTGTTATAGATGTCCAGCTGGGTAAGCCTCTGAACATCCCCTGCAAAGCATTCTTCGGATTCA  442

Query  815  GTGGAGAGTCTGGGCCAATGATCTACTGGATGAAAGGAGAAAAGTTTATTGAAGAACTGGCAGGTCACATTAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  GTGGAGAGTCTGGGCCAATGATCTACTGGATGAAAGGAGAAAAGTTTATTGAAGAACTGGCAGGTCACATTAGA  516

Query  889  GAAGGTGAAATAAGGCTTCTCAAAGAGCATCTTGGAGAAAAAGAAGTTGAATTGGCACTCATCTTTGACTCAGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  GAAGGTGAAATAAGGCTTCTCAAAGAGCATCTTGGAGAAAAAGAAGTTGAATTGGCACTCATCTTTGACTCAGT  590

Query  963  TGTGGAAGCTGACCTGGCGAATTATACCTGCCATGTTGAAAACCGAAATGGACGGAAACATGCCAGTGTTTTGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  TGTGGAAGCTGACCTGGCGAATTATACCTGCCATGTTGAAAACCGAAATGGACGGAAACATGCCAGTGTTTTGC  664

Query 1037  TGCGTAAAAAGGATTTAATCTATAAAATTGAGCTTGCAGGGGGCCTGGGAGCAATCTTCCTCCTCCTTGTACTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  TGCGTAAAAAGGATTTAATCTATAAAATTGAGCTTGCAGGGGGCCTGGGAGCAATCTTCCTCCTCCTTGTACTG  738

Query 1111  CTGGTGGTCATTTACAAATGCTACAACATTGAATTGATGCTCTTCTACAGGCAGCACTTTGGAGCTGATGAAAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  CTGGTGGTCATTTACAAATGCTACAACATTGAATTGATGCTCTTCTACAGGCAGCACTTTGGAGCTGATGAAAC  812

Query 1185  TAATGATGACAACAAGGAATATGATGCCTATCTCTCTTACACAAAAGTGGACCAAGATACTTTAGACTGTGACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  TAATGATGACAACAAGGAATATGATGCCTATCTCTCTTACACAAAAGTGGACCAAGATACTTTAGACTGTGACA  886

Query 1259  ATCCTGAAGAAGAGCAGTTTGCTCTTGAAGTACTGCCAGATGTCCTGGAAAAACACTATGGATATAAACTCTTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  ATCCTGAAGAAGAGCAGTTTGCTCTTGAAGTACTGCCAGATGTCCTGGAAAAACACTATGGATATAAACTCTTC  960

Query 1333  ATCCCAGAAAGAGACCTGATTCCAAGTGGAACATACATGGAAGATCTCACAAGATATGTTGAACAAAGCAGAAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  ATCCCAGAAAGAGACCTGATTCCAAGTGGAACATACATGGAAGATCTCACAAGATATGTTGAACAAAGCAGAAG  1034

Query 1407  ACTTATTATCGTGCTAACTCCAGACTATATTCTCAGACGGGGATGGAGTATTTTCGAACTGGAAAGCAGACTCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  ACTTATTATCGTGCTAACTCCAGACTATATTCTCAGACGGGGATGGAGTATTTTCGAACTGGAAAGCAGACTCC  1108

Query 1481  ATAACATGCTAGTCAGTGGAGAAATCAAAGTGATTTTGATTGAGTGTACAGAATTAAAAGGGAAAGTGAATTGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  ATAACATGCTAGTCAGTGGAGAAATCAAAGTGATTTTGATTGAGTGTACAGAATTAAAAGGGAAAGTGAATTGC  1182

Query 1555  CAGGAAGTGGAATCACTAAAGCGTAGCATCAAACTTCTGTCCCTGATCAAGTGGAAGGGATCCAAAAGCAGCAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  CAGGAAGTGGAATCACTAAAGCGTAGCATCAAACTTCTGTCCCTGATCAAGTGGAAGGGATCCAAAAGCAGCAA  1256

Query 1629  ATTAAATTCTAAGTTTTGGAAGCACTTAGTATATGAAATGCCCATCAAGAAAAAAGAAATGCTACCTCGGTGCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257  ATTAAATTCTAAGTTTTGGAAGCACTTAGTATATGAAATGCCCATCAAGAAAAAAGAAATGCTACCTCGGTGCC  1330

Query 1703  ATGTTCTGGACTCCGCAGAACAAGGACTTTTTGGAGAACTCCAGCCTATACCCTCTATTGCCATGACCAGTACT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331  ATGTTCTGGACTCCGCAGAACAAGGACTTTTTGGAGAACTCCAGCCTATACCCTCTATTGCCATGACCAGTACT  1404

Query 1777  TCAGCCACTCTGGTGTCATCTCAGGCTGATCTCCCTGAATTCCACCCTTCAGATTCAATGCAAATCAGGCACTG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405  TCAGCCACTCTGGTGTCATCTCAGGCTGATCTCCCTGAATTCCACCCTTCAGATTCAATGCAAATCAGGCACTG  1478

Query 1851  TTGCAGAGGTTATAAACATGAGATACCAGCCACGACCTTGCCAGTACCTTCCTTAGGCAACCACCATACTTATT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479  TTGCAGAGGTTATAAACATGAGATACCAGCCACGACCTTGCCAGTACCTTCCTTAGGCAACCACCATACTTATT  1552

Query 1925  GTAACCTGCCTCTGACGCTACTCAACGGACAGCTACCCCTTAATAACACCCTGAAAGATACCCAGGAATTTCAC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553  GTAACCTGCCTCTGACGCTACTCAACGGACAGCTACCCCTTAATAACACCCTGAAAGATACCCAGGAATTTCAC  1626

Query 1999  AGGAACAGTTCTTTGCTGCCTTTATCCTCCAAAGAGCTTAGCTTTACCAGTGATATTTGG  2058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627  AGGAACAGTTCTTTGCTGCCTTTATCCTCCAAAGAGCTTAGCTTTACCAGTGATATTTGG  1686