Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476912
• Subject: XM_017026187.1
• Aligned Length: 2046
• Identities: 1290
• Gaps: 618

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------ATGACCCCCATCGTCACAGTCCT  23
                                                               ||||||||||||.||||.|||||
Sbjct    1  ATGCACCGAGGGCTCATCCATCCACAGAGCAGGGCAGTGGGAGGAGACGCCATGACCCCCATCCTCACGGTCCT  74

Query   24  GATCTGTCTCAGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGACCCTCCCCAAGCCCACACTCTGGG  97
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  GATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGG  148

Query   98  CTGAGCCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCCGTGACCCTCTGGTGTCAGGGGATCCTGGAGACCCAGGAG  171
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||..||.|||||||||||||
Sbjct  149  CTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAG  222

Query  172  TACCGTCTGTATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGATTGTGAAGAAGGGCCA  245
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  223  TACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCA  296

Query  246  GTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTTCTACGGTAGCCACACTGCAGGCT  319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||.|||||||||||.
Sbjct  297  GTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTACTATGGTAGCGACACTGCAGGCC  370

Query  320  GGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCCTCTCAGCTCTACCC  393
            |.||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||
Sbjct  371  GCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCCTCTCAGCCCAGCCC  444

Query  394  AGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAACGTGACCCTCCATTGTGTCTCACAGGTGGCATTTGGCAGCTTCATTCT  467
            |||||.|||||||.||||||||||||.||.||||||||.||||.|||||||||||||||||...||||||||||
Sbjct  445  AGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCT  518

Query  468  GTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCACAGCCCCGTACCCATGGGTGGTCCCGGGCCA  541
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.|||.|||||.||||||.||||
Sbjct  519  GTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCATGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCA  592

Query  542  TCTTCTCTGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCC  615
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCC  666

Query  616  CATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGT  689
            .|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGT  740

Query  690  GCAGCCAGGTCCTATAGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGTTTCTGATGTCAGCTACGACAGAT  763
            |||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|||||||..|||||||...|||||.||||||
Sbjct  741  GCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGGCTCTGATGCTGGCTACAACAGAT  814

Query  764  TTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCTCCCTGGCCCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAG  837
            ||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAG  888

Query  838  GCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTCCGGTGCATACAACCTCTC  911
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||
Sbjct  889  GCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTC  962

Query  912  CTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCCGTGGCAGACCCTTCATCT  985
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.||||..||.|.|||
Sbjct  963  CTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCT  1036

Query  986  CGGTGCATCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGGGGCCGTTCCAC  1059
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||...|.|.||.
Sbjct 1037  CGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAA  1110

Query 1060  ACTTTCCTTCTGACCAAGGCGGGAGCAGCTGATGCCCCCCTCCGTCTCAGATCAATACACGAATATCCTAAGTA  1133
            |||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||....|||||.|||||||...||.|||.||..||.||
Sbjct 1111  ACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATA  1184

Query 1134  CCAGGCTGAATTCCCTATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACTCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACTCAGCT  1207
            |||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 1185  CCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCT  1258

Query 1208  CCAACCCCTACCTGCTGTCTCACCCCAGTGACTCCCTGGAGCTCATGGTCTCAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGC  1281
            ||||.||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|..|||.|..||.||||
Sbjct 1259  CCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGC  1332

Query 1282  -CCACCACAAAACAAGTCCGA-TTCCA-------AGGC----TGGAGCAGCTAACACCCTCAGCCCATCACAAA  1342
             ||.|.||  ||||.|.||.| .||||       ||||    .|||.||||     ||||||.|||        
Sbjct 1333  TCCCCGAC--AACAGGCCCCACCTCCACATCTGCAGGCCCTGAGGACCAGC-----CCCTCACCCC--------  1391

Query 1343  ACAAGACTGCCTCACACCCCCAGGATTACACAGTGGAGAATCT-------CATCCG--------CATGGGCATA  1401
                .||.|..||..|.||||||        |||||    |||       ||.|.|        .||.||||| 
Sbjct 1392  ----CACCGGGTCGGATCCCCAG--------AGTGG----TCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGATCGGCAT-  1448

Query 1402  GCTGGCTTGG---------TCCTGGTGGTCCTC-----------------------------------------  1425
                 |||||         ||||..||.|||||                                         
Sbjct 1449  -----CTTGGTGGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCATCCTCCGACATCGACGTCA  1517

Query 1426  GGG---ATTCT--------------------GCT-ATTT-------------GAGGCT-------CAG----CA  1451
            |||   |..||                    ||| ||||             |.||||       |||    ||
Sbjct 1518  GGGCAAACACTGGACATCGACCCAGAGAAAGGCTGATTTCCAACATCCTGCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCA  1591

Query 1452  CAGCCAGAGAAGCCTC----------------------------------------------------------  1467
            |||.|||||  ||||.                                                          
Sbjct 1592  CAGACAGAG--GCCTGCAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGCCGATGCCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGA  1663

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1664  AGCACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTCGGCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTG  1737

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1738  ACGTATGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATT  1811

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1812  CCTGGACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCC  1885

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1886  AGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAA  1959

Query 1468  ------------------------------------------------  1467
                                                            
Sbjct 1960  GGGCCCTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  2007