Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476912
- Subject:
- XM_017026192.1
- Aligned Length:
- 1588
- Identities:
- 1227
- Gaps:
- 233
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGAAGAAGGACCCAGCCTCCGATTGGCCACACTCTGTGTGTCTCTCTATCCTGCCAGCACCGAGGGCTCAT 74
Query 1 ----------------------------------ATGACCCCCATCGTCACAGTCCTGATCTGTCTCAGGCTGA 40
||||||||||||.||||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct 75 CCATCCACAGAGCAGGGCAGTGGGAGGAGACGCCATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGA 148
Query 41 GTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGACCCTCCCCAAGCCCACACTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTG 114
||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 GTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTG 222
Query 115 ATCACCCAGGGGAGTCCCGTGACCCTCTGGTGTCAGGGGATCCTGGAGACCCAGGAGTACCGTCTGTATAGAGA 188
|||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||..||.|||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 223 ATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGA 296
Query 189 AAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGATTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCA 262
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCA 370
Query 263 TCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTTCTACGGTAGCCACACTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGAC 336
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||.|||||||||||.|.||||||..|||||||
Sbjct 371 TCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTACTATGGTAGCGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGAC 444
Query 337 CCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCCTCTCAGCTCTACCCAGCCCTGTGGTGACCTC 410
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..||||||||.|||||||.|||
Sbjct 445 CCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTC 518
Query 411 AGGAGGGAACGTGACCCTCCATTGTGTCTCACAGGTGGCATTTGGCAGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAG 484
|||||||||.||.||||||||.||||.|||||||||||||||||...|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAG 592
Query 485 ATGAACACCCACAATGCCTGAACTCACAGCCCCGTACCCATGGGTGGTCCCGGGCCATCTTCTCTGTGGGCCCC 558
|||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.|||.|||||.||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 593 ATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCATGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCC 666
Query 559 GTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCCATGTGTGGTCTCTACC 632
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||
Sbjct 667 GTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACC 740
Query 633 CAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATAG 706
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 741 CAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCG 814
Query 707 TGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGTTTCTGATGTCAGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAG 780
|||||||||.|||||.||||||.||.|||||||..|||||||...|||||.||||||||||||||||||||||.
Sbjct 815 TGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGGCTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGAC 888
Query 781 GGAGAACGTGACTTCCTCCAGCTCCCTGGCCCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGG 854
||.||||||||||||||.||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGG 962
Query 855 CCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTCCGGTGCATACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCC 928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCC 1036
Query 929 CCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCCGTGGCAGACCCTTCATCTCGGTGCATCCGGGCCCC 1002
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.||||..||.|.||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037 CCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCC 1110
Query 1003 ACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGGGGCCGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAA 1076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||...|.|.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAA 1184
Query 1077 GGCGGGAGCAGCTGATGCCCCCCTCCGTCTCAGATCAATACACGAATATCCTAAGTACCAGGCTGAATTCCCTA 1150
||.|||.||||||||||.|||....|||||.|||||||...||.|||.||..||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1185 GGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCA 1258
Query 1151 TGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACTCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTG 1224
||.|||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||..||||||||.||||||||||||
Sbjct 1259 TGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTG 1332
Query 1225 TCTCACCCCAGTGACTCCCTGGAGCTCATGGTCTCAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGC-CCACCACAAAACAAGT 1297
.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|..|||.|..||.|||| ||.|.|| ||||.|.
Sbjct 1333 ACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGAC--AACAGGC 1404
Query 1298 CCGA-TTCCA-------AGGC----TGGAGCAGCTAACACCCTCAGCCCATCACAAAACAAGACTGCCTCACAC 1359
||.| .|||| |||| .|||.|||| ||||||.||| .||.|..||..|.
Sbjct 1405 CCCACCTCCACATCTGCAGGCCCTGAGGACCAGC-----CCCTCACCCC------------CACCGGGTCGGAT 1461
Query 1360 CCCCAGGATTACACAGTGGAGAATCTCATCCGCATGGGCATAGCTGGCTTGGTCCTGGTGGTCCTCGGGATTCT 1433
|||||| |||||.||.
Sbjct 1462 CCCCAG--------AGTGGTGAG--------------------------------------------------- 1476
Query 1434 GCTATTTGAGGCTCAGCACAGCCAGAGAAGCCTC 1467
Sbjct 1477 ---------------------------------- 1476