Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477129
- Subject:
- NM_146241.2
- Aligned Length:
- 3076
- Identities:
- 2771
- Gaps:
- 5
Alignment
Query 1 ATGGGGGAAGACGACGCCGCGCTTCGGGCTGGCAGCAGGGGGCTCTCCGACCCGTGGGCAGACTCAGTGGGAGT 74
|||||.|||||||||||||||||.|||||..||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1 ATGGGAGAAGACGACGCCGCGCTCCGGGCAAGCGGCAGGGGGCTCTCGGACCCGTGGGCTGACTCGGTGGGAGT 74
Query 75 GCGACCCCGCACCACGGAGCGCCACATCGCCGTACACAAGCGGCTTGTGCTGGCCTTCGCTGTGTCCCTCGTGG 148
|.||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.||||||||||||||||.||.||||||.||||||
Sbjct 75 GAGACCCCGCACCACGGAGCGCCACATCGCAGTGCACAAGAGGCTTGTGCTGGCCTTTGCCGTGTCCATCGTGG 148
Query 149 CATTGCTCGCGGTCACAATGCTCGCTGTGCTGCTCAGCCTGCGCTTCGACGAGTGCGGGGCGAG---TGCCACG 219
||.||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||||||.||||.|||||||||||.||.||||| .||.|.|
Sbjct 149 CACTGCTGGCTGTCACCATGCTGGCCGTCCTGCTCAGCTTGCGATTCGACGAGTGTGGAGCGAGCGCGGCGATG 222
Query 220 CCAGGCGCCGACGGTGGCCCCTCAGGCTTTCCGGAGCGCGGCGGCAACGGGAGCCTCCCTGGATCGGCCCGGCG 293
||.|||.||||||||||||.|...||.||.||.|||||||.|.|||||.|.|||.|.||.||.||.||||||||
Sbjct 223 CCTGGCACCGACGGTGGCCTCGGGGGTTTCCCCGAGCGCGACAGCAACAGCAGCTTTCCAGGTTCTGCCCGGCG 296
Query 294 CAACCACCACGCAGGCGGGGACTCCTGGCAGCCCGAG-GCGGGTGGGGTGGCCAGTCCGGGGACCACGTCGGCC 366
||||||||||||.||.|||||.||||..||||..||| || ||.|.|||||.||..|||||||||.||||.|||
Sbjct 297 CAACCACCACGCGGGTGGGGAATCCTCTCAGCGTGAGAGC-GGCGAGGTGGGCACCCCGGGGACCCCGTCTGCC 369
Query 367 CAGCCGCCGTCGGAGGAGGAGCGGGAGCCGTGGGAGCCGTGGACGCAGCTGCGCCTGTCGGGCCACCTGAAGCC 440
|||||||||||||||||.||||||||||.||||.||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 370 CAGCCGCCGTCGGAGGAAGAGCGGGAGCAGTGGCAGCCCTGGACACAGCTGCGCCTATCCGGCCACCTCAAGCC 443
Query 441 GCTGCACTACAATCTGATGCTCACCGCCTTCATGGAGAACTTCACCTTCTCCGGGGAGGTCAACGTGGAGATCG 514
|||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 GCTGCACTACAATTTGATGCTCACCGCTTTCATGGAGAACTTCACCTTCTCTGGGGAGGTCAACGTGGAGATCG 517
Query 515 CGTGCCGGAACGCCACCCGCTACGTAGTGCTGCACGCTTCCCGAGTGGCGGTGGAGAAAGTGCAGCTGGCCGAG 588
|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||..|.||.||.
Sbjct 518 CGTGCCGGAACGCCACCCGCTACGTGGTACTGCACGCCTCCCGAGTGGCGGTGGAGAAGGTGCAAGTAGCTGAA 591
Query 589 GACCGGGCGTTCGGGGCTGTCCCTGTAGCCGGTTTTTTCCTCTACCCGCAAACCCAGGTCTTAGTGGTGGTGCT 662
|||.|||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||..|
Sbjct 592 GACAGGGCGTTCGGGGCTGTCCCGGTTGCAGGCTTTTTCCTCTACCCACAAACGCAGGTCTTGGTGGTGGTATT 665
Query 663 GAATAGGACACTGGACGCGCAGAGGAATTACAATCTGAAGATTATCTACAACGCGCTCATCGAGAATGAGCTCC 736
|||.||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||..
Sbjct 666 GAACAGAACCCTGGACGCGCAGAGGCATTACAATCTGAAGATTATCTACAATGCCCTGATAGAGAACGAGCTTT 739
Query 737 TGGGCTTCTTCCGCAGCTCCTATGTGCTCCACGGGGAGAGAAGATTCCTTGGTGTTACTCAGTTTTCGCCTACA 810
||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 740 TGGGCTTCTTCCGCAGCTCCTACGTGATCCACGGGGAGAGAAGATTCCTTGGTGTTACTCAGTTTTCACCTACA 813
Query 811 CATGCCAGAAAGGCATTTCCTTGTTTTGATGAGCCAATCTACAAGGCTACTTTCAAAATCAGCATCAAGCATCA 884
||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 814 CATGCCAGGAAGGCGTTTCCGTGTTTCGATGAACCAATCTACAAGGCCACTTTCAAAATCAGCATCAAACATCA 887
Query 885 AGCAACCTATTTATCTTTATCTAATATGCCAGTGGAAACTTCCGTGTTTGAGGAAGATGGATGGGTTACGGATC 958
||||||||||||.|||.||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 888 AGCAACCTATTTGTCTCTATCCAACATGCCAGTGGAAACGTCTGTGTTCGAGGAAGATGGATGGGTGACAGATC 961
Query 959 ACTTTTCACAGACCCCTCTCATGTCCACATATTATTTAGCCTGGGCAATTTGCAACTTCACATACAGAGAAACT 1032
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 ACTTTTCACAGACCCCTCTCATGTCTACATATTATTTAGCCTGGGCGATTTGCAACTTCACATACAGAGAAACT 1035
Query 1033 ACCACCAAGAGTGGGGTTGTAGTACGATTATATGCAAGACCTGATGCTATCAGAAGAGGATCCGGGGACTATGC 1106
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 ACCACCAAGAGTGGGGTTGTAGTCCGATTATATGCGAGACCCGACGCTATCAGAAGAGGATCCGGGGACTATGC 1109
Query 1107 TCTCCATATAACAAAGAGATTAATAGAATTTTATGAAGACTACTTTAAAGTGCCCTATTCCTTGCCAAAACTAG 1180
||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1110 TCTCCACATTACAAAGAGATTAATAGAATTTTATGAAGACTACTTTAAAGTGCCCTATTCTTTGCCAAAACTAG 1183
Query 1181 ATCTTTTAGCTGTGCCTAAGCATCCGTATGCTGCTATGGAGAACTGGGGACTAAGTATTTTTGTGGAACAAAGA 1254
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 ATCTTTTAGCTGTGCCTAAGCATCCTTATGCTGCTATGGAGAACTGGGGACTAAGTATTTTTGTGGAACAAAGA 1257
Query 1255 ATACTGCTGGATCCCAGTGTTTCATCTATTTCTTATTTGCTGGATGTCACCATGGTCATTGTTCATGAGATATG 1328
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1258 ATACTGCTGGATCCCAGTGTGTCATCTATTTCTTATTTGCTGGATGTCACCATGGTCATTGTTCATGAAATATG 1331
Query 1329 TCACCAGTGGTTTGGTGACCTTGTGACGCCTGTGTGGTGGGAAGACGTGTGGCTGAAGGAAGGGTTTGCTCACT 1402
|||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 1332 TCACCAGTGGTTTGGTGACCTTGTGACTCCAGTTTGGTGGGAAGATGTGTGGTTGAAGGAAGGCTTTGCTCACT 1405
Query 1403 ACTTTGAATTTGTTGGTACAGACTACCTCTATCCTGGCTGGAACATGGAAAAGCAGAGGTTTCTGACCGATGTT 1476
|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1406 ACTTTGAATTTGTGGGTACAGACTACCTCTACCCTGCCTGGAACATGGAGAAGCAGAGATTTCTGACAGATGTT 1479
Query 1477 CTGCATGAAGTGATGCTGCTGGACGGTTTGGCCAGTTCCCATCCAGTATCACAGGAAGTGCTGCAGGCAACAGA 1550
|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 1480 CTGCATGAAGTGATGCTACTTGATGGCTTGGCCAGTTCCCATCCAGTATCACAGGAAGTGCTACGGGCAACAGA 1553
Query 1551 TATTGACAGGGTGTTTGACTGGATCGCATATAAAAAGGGTGCTGCTTTAATAAGAATGCTGGCTAATTTTATGG 1624
|||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 TATTGACAGAGTGTTCGACTGGATCGCATACAAAAAGGGTGCTGCTCTAATTAGAATGCTGGCTAATTTTATGG 1627
Query 1625 GCCATTCAGTTTTCCAGAGGGGTTTGCAAGATTATTTAACCATTCATAAGTATGGTAATGCAGCCAGAAATGAT 1698
|.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1628 GTCATTCAGTTTTTCAGAGGGGATTGCAAGATTATTTAACCATTCACAAGTATGGCAATGCAGCCAGAAATGAT 1701
Query 1699 CTCTGGAATACATTATCGGAGGCTTTAAAAAGAAATGGGAAATATGTAAATATACAAGAAGTAATGGATCAGTG 1772
|||||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702 CTCTGGAATACATTATCAGAGGCTTTAAGAAGGAATGGAAAATACGTGAACATACAAGAAGTAATGGATCAGTG 1775
Query 1773 GACACTCCAGATGGGTTATCCTGTTATCACCATCTTGGGAAACACAACAGCAGAAAATAGAATAATAATTACCC 1846
||||||.||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||.||.|||||||||||||||.|.||.||||
Sbjct 1776 GACACTGCAGATGGGATATCCTGTTATCACTATCCTGGGAAACACGACGGCAGAAAATAGAATACTTATCACCC 1849
Query 1847 AACAGCATTTTATCTATGATATCAGTGCTAAAACTAAAGCACTTAAACTTCAGAATAACAGTTACCTGTGGCAG 1920
||||||||||.||.|||||.||..||||||||||||||||||||.|||||||.||.|.||||||||||||||||
Sbjct 1850 AACAGCATTTCATTTATGACATTGGTGCTAAAACTAAAGCACTTCAACTTCAAAACAGCAGTTACCTGTGGCAG 1923
Query 1921 ATTCCATTAACTATTGTGGTAGGAAATAGAAGCCATGTGTCTTCAGAAGCAATTATTTGGGTGTCTAACAAATC 1994
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924 ATTCCATTAACCATTGTGGTAGGAAATAGAAGCCATGTGTCTTCAGAAGCAATTATTTGGGTGTCTAACAAATC 1997
Query 1995 AGAGCACCACAGAATAACTTATTTGGACAAAGGAAGCTGGCTGCTGGGGAACATCAATCAAACTGGCTATTTTA 2068
|||.||.|||||||||.|.||.||.||||.||||||||||.|.||.|||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1998 AGAACATCACAGAATAGCGTACTTAGACAGAGGAAGCTGGATCCTTGGGAACATCAATCAAACCGGCTACTTTA 2071
Query 2069 GAGTCAACTATGACCTAAGGAACTGGAGATTATTAATTGATCAATTAATCCGGAATCATGAGGTTCTTTCTGTC 2142
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||.||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 2072 GAGTCAACTATGACCTAAGGAACTGGAGATTACTAATCGATCAGTTAATCAGGAACCACGAGGTACTTTCTGTC 2145
Query 2143 AGTAACCGAGCGGGCTTGATCGATGATGCCTTCAGCCTAGCCAGGGCTGGCTATTTGCCTCAGAATATTCCTCT 2216
||||||||.||||..|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 2146 AGTAACCGCGCGGCTTTGATCGATGATGCCTTCAGCCTGGCCAGGGCAGGCTATTTGCCTCAGAATATCCCCCT 2219
Query 2217 GGAGATTATCAGATACCTGTCTGAGGAGAAGGATTTTCTTCCTTGGCATGCTGCCAGCCGAGCTCTTTATCCTC 2290
.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 AGAGATCATCAGATACCTGTCTGAGGAAAAGGATTTTCTTCCTTGGCACGCTGCCAGCCGAGCTCTTTATCCTC 2293
Query 2291 TAGATAAATTACTGGACCGCATGGAAAACTACAACATTTTCAATGAATATATTTTAAAGCAAGTTGCAACAACA 2364
|.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct 2294 TGGATAAATTACTGGACCGCATGGAGAACTACAATATCTTCAATGAATATATTCTAAAACAAGTTGCAACAACA 2367
Query 2365 TATATCAAGCTTGGGTGGCCGAAAAATAATTTTAATGGATCTCTTGTTCAAGCATCCTACCAACATGAAGAACT 2438
||.|||||||||||.|||||.|.||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 2368 TACATCAAGCTTGGATGGCCAAGAAATAACTTCAATGGATCTCTCGTTCAAGCCTCCTACCAACATGAGGAGCT 2441
Query 2439 ACGTAGAGAAGTTATAATGCTGGCCTGCAGTTTTGGCAACAAGCACTGTCACCAACAGGCATCAACACTTATTT 2512
|||.||.|||||.||||||.||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2442 ACGGAGGGAAGTGATAATGTTGGCATGTAGTTTTGGGAACAAGCACTGTCACCAGCAGGCATCAACACTTATTT 2515
Query 2513 CAGATTGGATTTCCAGCAACAGGAACAGAATACCACTAAATGTTAGAGACATCGTATACTGTACAGGAGTGTCA 2586
||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2516 CAGACTGGATTTCCAGCAACAGAAACAGAATACCCCTGAATGTTAGAGACATCGTCTACTGCACAGGAGTGTCA 2589
Query 2587 CTACTGGATGAGGATGTCTGGGAATTCATATGGATGAAATTCCATTCCACCACAGCAGTTTCTGAGAAGAAAAT 2660
||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 2590 CTGCTGGATGAGGATGTCTGGGAGTTTATCTGGATGAAATTCCACTCTACCACTGCAGTTTCTGAGAAAAAGAT 2663
Query 2661 ATTATTGGAAGCCTTAACTTGCAGTGATGACAGGAATTTATTAAACAGGCTTCTAAATCTGTCACTGAATTCTG 2734
|.|..||||.||..||||||||||.|||||||||||||||||||..|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2664 ACTGCTGGAGGCTCTAACTTGCAGCGATGACAGGAATTTATTAAGTAGGCTTCTAAATCTGTCTCTGAATTCTG 2737
Query 2735 AGGTGGTGCTGGATCAAGATGCAATTGATGTCATAATCCATGTAGCTCGAAATCCACATGGTCGAGACCTTGCC 2808
||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||..|||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2738 AGGTGGTGTTGGATCAAGATGCAATTGATGTAATTATCCACGTAGCCAGAAATCCACATGGCCGAGACCTTGCC 2811
Query 2809 TGGAAGTTTTTCAGGGATAAATGGAAGATATTAAATACCAGGTATGGAGAAGCATTGTTTATGAATTCCAAACT 2882
||||||||||||||.||.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2812 TGGAAGTTTTTCAGAGACAAATGGAAAATACTAAATACCAGGTATGGAGAAGCACTGTTTATGAATTCCAAACT 2885
Query 2883 CATCAGTGGTGTCACAGAATTTCTTAATACTGAAGGTGAACTCAAAGAGCTCAAGAACTTCATGAAAAACTATG 2956
.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||...|||||
Sbjct 2886 TATCAGTGGAGTTACAGAATTTCTTAATACAGAAGGTGAACTTAAAGAGCTAAAGAATTTCATGAAGTCCTATG 2959
Query 2957 ATGGGGTAGCTGCTGCTTCTTTCTCACGAGCTGTGGAAACTGTCGAAGCCAATGTGCGCTGGAAAATGCTTTAC 3030
||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|.|||||
Sbjct 2960 ATGGGGTAGCCTCTGCTTCTTTCTCACGAGCTGTGGAAACTGTGGAAGCCAATGTGCGCTGGAAAAGGTTTTAC 3033
Query 3031 CAAGACGAGCTTTTCCAATGGTTAGGAAAAGCTCTAAGACAC 3072
|||||.|||||||||||.|||.|.||||||||..|.||||||
Sbjct 3034 CAAGATGAGCTTTTCCAGTGGCTGGGAAAAGCCATGAGACAC 3075