Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477195
• Subject: NM_001270409.1
• Aligned Length: 1674
• Identities: 1569
• Gaps: 105

Alignment

Query    1  ATGCACCGCGGCGGGCAGCCTTTGAAAAAGCGGCGCGGCTCGTTCAAGATGGCGGAGCTCGACCAGTTGCCTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCACCGCGGCGGGCAGCCTTTGAAAAAGCGGCGCGGCTCGTTCAAGATGGCGGAGCTCGACCAGTTGCCTGA  74

Query   75  CGAGAGCTCTTCAGCAAAAGCCCTTGTCAGTTTAAAAGAAGGAAGCTTATCTAACACGTGGAATGAAAAGTACA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGAGAGCTCTTCAGCAAAAGCCCTTGTCAGTTTAAAAGAAGGAAGCTTATCTAACACGTGGAATGAAAAGTACA  148

Query  149  GTTCTTTACAGAAAACACCTGTTTGGAAAGGCAGGAATACAAGCTCTGCTGTGGAAATGCCTTTCAGAAATTCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct  149  GTTCTTTACAGAAAACACCTGTTTGGAAAGGCAGGAATACAAGCTCTGCTGTGGAAAT----------------  206

Query  223  AAACGAAGTCGACTTTTTTCTGATGAAGATGATAGGCAAATAAATACAAGGTCACCTAAAAGAAACCAGAGGGT  296
                                                                                      
Sbjct  207  --------------------------------------------------------------------------  206

Query  297  TGCAATGGTTCCACAGAAATTTACAGCAACAATGTCAACACCAGATAAGAAAGCTTCACAGAAGATTGGTTTTC  370
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  207  ---------------GAAATTTACAGCAACAATGTCAACACCAGATAAGAAAGCTTCACAGAAGATTGGTTTTC  265

Query  371  GATTACGTAATCTGCTCAAGCTTCCTAAAGCACATAAATGGTGTATATACGAGTGGTTCTATTCAAATATAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  266  GATTACGTAATCTGCTCAAGCTTCCTAAAGCACATAAATGGTGTATATACGAGTGGTTCTATTCAAATATAGAT  339

Query  445  AAACCACTTTTTGAAGGTGATAATGACTTCTGTGTATGTCTAAAGGAATCTTTTCCTAATTTGAAAACAAGAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  340  AAACCACTTTTTGAAGGTGATAATGACTTCTGTGTATGTCTAAAGGAATCTTTTCCTAATTTGAAAACAAGAAA  413

Query  519  GTTAACAAGAGTAGAATGGGGAAAAATTCGGCGGCTTATGGGAAAACCACGGAGATGTTCTTCTGCATTTTTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  414  GTTAACAAGAGTAGAATGGGGAAAAATTCGGCGGCTTATGGGAAAACCACGGAGATGTTCTTCTGCATTTTTTG  487

Query  593  AGGAAGAGAGATCAGCATTAAAACAGAAACGGCAGAAAATAAGGCTCTTACAACAAAGGAAAGTTGCAGATGTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  488  AGGAAGAGAGATCAGCATTAAAACAGAAACGGCAGAAAATAAGGCTCTTACAACAAAGGAAAGTTGCAGATGTT  561

Query  667  TCACAATTCAAAGATCTCCCAGATGAAATTCCTTTGCCTCTGGTTATTGGAACGAAAGTTACAGCACGATTACG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  562  TCACAATTCAAAGATCTCCCAGATGAAATTCCTTTGCCTCTGGTTATTGGAACGAAAGTTACAGCACGATTACG  635

Query  741  TGGTGTTCATGATGGTTTGTTCACTGGACAAATAGATGCTGTGGATACTCTTAATGCTACTTATAGAGTAACTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  636  TGGTGTTCATGATGGTTTGTTCACTGGACAAATAGATGCTGTGGATACTCTTAATGCTACTTATAGAGTAACTT  709

Query  815  TTGATAGGACAGGGCTTGGAACCCATACCATCCCTGACTATGAAGTTCTCAGTAATGAACCTCATGAGACAATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  TTGATAGGACAGGGCTTGGAACCCATACCATCCCTGACTATGAAGTTCTCAGTAATGAACCTCATGAGACAATG  783

Query  889  CCAATTGCTGCCTTTGGACAAAAACAGCGGCCTTCTCGATTTTTTATGACCCCACCACGGTTACATTATACTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  784  CCAATTGCTGCCTTTGGACAAAAACAGCGGCCTTCTCGATTTTTTATGACCCCACCACGGTTACATTATACTCC  857

Query  963  TCCTCTCCAGTCACCAATTATAGATAATGATCCTTTATTAGGACAGTCGCCGTGGAGAAGTAAAATTTCTGGCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  858  TCCTCTCCAGTCACCAATTATAGATAATGATCCTTTATTAGGACAGTCGCCGTGGAGAAGTAAAATTTCTGGCT  931

Query 1037  CTGACACTGAAACATTAGGTGGTTTTCCAGTAGAATTTCTTATCCAAGTGACCAGATTATCAAAAATTCTCATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  932  CTGACACTGAAACATTAGGTGGTTTTCCAGTAGAATTTCTTATCCAAGTGACCAGATTATCAAAAATTCTCATG  1005

Query 1111  ATTAAAAAGGAACATATCAAGAAATTAAGGGAAATGAACACAGAAGCAGAAAAATTGAAATCATATTCCATGCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006  ATTAAAAAGGAACATATCAAGAAATTAAGGGAAATGAACACAGAAGCAGAAAAATTGAAATCATATTCCATGCC  1079

Query 1185  CATCAGCATTGAATTTCAGCGGAGATATGCAACAATTGTTCTGGAGCTTGAACAGCTGAACAAGGACCTAAACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080  CATCAGCATTGAATTTCAGCGGAGATATGCAACAATTGTTCTGGAGCTTGAACAGCTGAACAAGGACCTAAACA  1153

Query 1259  AAGTTTTGCATAAAGTTCAACAGTATTGCTATGAGCTTGCTCCAGACCAGGGGCTCCAGCCTGCAGATCAGCCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154  AAGTTTTGCATAAAGTTCAACAGTATTGCTATGAGCTTGCTCCAGACCAGGGGCTCCAGCCTGCAGATCAGCCA  1227

Query 1333  ACAGATATGAGACGCAGGTGTGAGGAAGAAGCACAGGAAATTGTTCGGCATGCAAATTCCTCAACAGGACAGCC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1228  ACAGATATGAGACGCAGGTGTGAGGAAGAAGCACAGGAAATTGTTCGGCATGCAAATTCCTCAACAGGACAGCC  1301

Query 1407  CTGCGTTGAAAATGAAAATCTGACAGACTTAATTTCCAGGCTTACAGCTATTTTGTTACAAATTAAGTGTCTAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1302  CTGCGTTGAAAATGAAAATCTGACAGACTTAATTTCCAGGCTTACAGCTATTTTGTTACAAATTAAGTGTCTAG  1375

Query 1481  CAGAAGGAGGAGACCTGAATTCCTTTGAATTCAAATCACTTACAGACTCATTAAATGATATCAAGAGTACAATA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1376  CAGAAGGAGGAGACCTGAATTCCTTTGAATTCAAATCACTTACAGACTCATTAAATGATATCAAGAGTACAATA  1449

Query 1555  GACGCTTCTAATATCAGTTGCTTTCAGAATAATGTAGAAATCCATGTTGCACATATTCAGAGTGGCCTGAGCCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1450  GACGCTTCTAATATCAGTTGCTTTCAGAATAATGTAGAAATCCATGTTGCACATATTCAGAGTGGCCTGAGCCA  1523

Query 1629  GATGGGAAACTTACATGCCTTTGCAGCAAATAACACCAACAGAGAC  1674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1524  GATGGGAAACTTACATGCCTTTGCAGCAAATAACACCAACAGAGAC  1569