Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477544
- Subject:
- NM_001163940.2
- Aligned Length:
- 2541
- Identities:
- 2439
- Gaps:
- 102
Alignment
Query 1 ATGGCGAAGCCCCTGACGGACCAGGAGAAGCGGCGGCAGATCAGCATCCGCGGCATCGTGGGCGTGGAGAACGT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGAAGCCCCTGACGGACCAGGAGAAGCGGCGGCAGATCAGCATCCGCGGCATCGTGGGCGTGGAGAACGT 74
Query 75 GGCAGAGCTGAAGAAGAGTTTCAACCGGCACCTGCACTTCACGCTGGTCAAGGACCGCAACGTGGCCACCACCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGCAGAGCTGAAGAAGAGTTTCAACCGGCACCTGCACTTCACGCTGGTCAAGGACCGCAACGTGGCCACCACCC 148
Query 149 GCGACTACTACTTCGCGCTGGCGCACACGGTGCGCGACCACCTGGTGGGGCGCTGGATCCGCACGCAGCAGCAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCGACTACTACTTCGCGCTGGCGCACACGGTGCGCGACCACCTGGTGGGGCGCTGGATCCGCACGCAGCAGCAC 222
Query 223 TACTACGACAAGTGCCCCAAGAGGGTATATTACCTCTCTCTGGAATTTTACATGGGCCGAACATTACAGAACAC 296
|||||||||||||||||||
Sbjct 223 TACTACGACAAGTGCCCCA------------------------------------------------------- 241
Query 297 CATGATCAACCTCGGTCTGCAAAATGCCTGTGATGAGGCCATTTACCAGCTTGGATTGGATATAGAAGAGTTAG 370
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 242 -----------------------------------------------AGCTTGGATTGGATATAGAAGAGTTAG 268
Query 371 AAGAAATTGAAGAAGATGCTGGACTTGGCAATGGTGGTCTTGGGAGACTTGCTGCCTGCTTCTTGGATTCCATG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 269 AAGAAATTGAAGAAGATGCTGGACTTGGCAATGGTGGTCTTGGGAGACTTGCTGCCTGCTTCTTGGATTCCATG 342
Query 445 GCAACCCTGGGACTTGCAGCCTATGGATACGGCATTCGGTATGAATATGGGATTTTCAATCAGAAGATCCGAGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 343 GCAACCCTGGGACTTGCAGCCTATGGATACGGCATTCGGTATGAATATGGGATTTTCAATCAGAAGATCCGAGA 416
Query 519 TGGATGGCAGGTAGAAGAAGCAGATGATTGGCTCAGATATGGAAACCCTTGGGAGAAGTCCCGCCCAGAATTCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 417 TGGATGGCAGGTAGAAGAAGCAGATGATTGGCTCAGATATGGAAACCCTTGGGAGAAGTCCCGCCCAGAATTCA 490
Query 593 TGCTGCCTGTGCACTTCTATGGAAAAGTAGAACACACCAACACCGGGACCAAGTGGATTGACACTCAAGTGGTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 491 TGCTGCCTGTGCACTTCTATGGAAAAGTAGAACACACCAACACCGGGACCAAGTGGATTGACACTCAAGTGGTC 564
Query 667 CTGGCTCTGCCATATGACACCCCCGTGCCCGGCTACATGAATAACACTGTCAACACCATGCGCCTCTGGTCTGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 565 CTGGCTCTGCCATATGACACCCCCGTGCCCGGCTACATGAATAACACTGTCAACACCATGCGCCTCTGGTCTGC 638
Query 741 TCGGGCACCAAATGACTTTAACCTCAGAGACTTTAATGTTGGAGACTACATTCAGGCTGTGCTGGACCGAAACC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 639 TCGGGCACCAAATGACTTTAACCTCAGAGACTTTAATGTTGGAGACTACATTCAGGCTGTGCTGGACCGAAACC 712
Query 815 TGGCCGAGAACATCTCCCGGGTCCTCTATCCCAATGACAATTTTTTTGAAGGGAAGGAGCTAAGATTGAAGCAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 713 TGGCCGAGAACATCTCCCGGGTCCTCTATCCCAATGACAATTTTTTTGAAGGGAAGGAGCTAAGATTGAAGCAG 786
Query 889 GAATACTTTGTGGTGGCTGCAACCTTGCAAGATATCATCCGCCGTTTCAAAGCCTCCAAGTTTGGCTCCACCCG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 787 GAATACTTTGTGGTGGCTGCAACCTTGCAAGATATCATCCGCCGTTTCAAAGCCTCCAAGTTTGGCTCCACCCG 860
Query 963 TGGTGCAGGAACTGTGTTTGATGCCTTCCCGGATCAGGTGGCCATCCAGCTGAATGACACTCACCCTGCACTCG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 861 TGGTGCAGGAACTGTGTTTGATGCCTTCCCGGATCAGGTGGCCATCCAGCTGAATGACACTCACCCTGCACTCG 934
Query 1037 CGATCCCTGAGCTGATGAGGATTTTTGTGGATATTGAAAAACTGCCCTGGTCCAAGGCATGGGAGCTCACCCAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 935 CGATCCCTGAGCTGATGAGGATTTTTGTGGATATTGAAAAACTGCCCTGGTCCAAGGCATGGGAGCTCACCCAG 1008
Query 1111 AAGACCTTCGCCTACACCAACCACACAGTGCTCCCGGAAGCCCTGGAGCGCTGGCCCGTGGACCTGGTGGAGAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009 AAGACCTTCGCCTACACCAACCACACAGTGCTCCCGGAAGCCCTGGAGCGCTGGCCCGTGGACCTGGTGGAGAA 1082
Query 1185 GCTGCTCCCTCGACATTTGGAAATCATTTATGAGATAAATCAGAAGCATTTAGATAGAATTGTGGCCTTGTTTC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083 GCTGCTCCCTCGACATTTGGAAATCATTTATGAGATAAATCAGAAGCATTTAGATAGAATTGTGGCCTTGTTTC 1156
Query 1259 CTAAAGATGTGGACCGTCTGAGAAGGATGTCTCTGATAGAAGAGGAAGGAAGCAAAAGGATCAACATGGCCCAT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157 CTAAAGATGTGGACCGTCTGAGAAGGATGTCTCTGATAGAAGAGGAAGGAAGCAAAAGGATCAACATGGCCCAT 1230
Query 1333 CTCTGCATTGTCGGTTCCCATGCTGTGAATGGCGTGGCTAAAATCCACTCAGACATCGTGAAGACTAAAGTATT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231 CTCTGCATTGTCGGTTCCCATGCTGTGAATGGCGTGGCTAAAATCCACTCAGACATCGTGAAGACTAAAGTATT 1304
Query 1407 CAAGGACTTCAGTGAGCTAGAACCTGACAAGTTTCAGAATAAAACCAATGGGATCACTCCAAGGCGCTGGCTCC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305 CAAGGACTTCAGTGAGCTAGAACCTGACAAGTTTCAGAATAAAACCAATGGGATCACTCCAAGGCGCTGGCTCC 1378
Query 1481 TACTCTGCAACCCAGGACTTGCAGAGCTCATAGCAGAGAAAATTGGAGAAGACTATGTGAAAGACCTGAGCCAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 TACTCTGCAACCCAGGACTTGCAGAGCTCATAGCAGAGAAAATTGGAGAAGACTATGTGAAAGACCTGAGCCAG 1452
Query 1555 CTGACGAAGCTCCACAGCTTCCTGGGTGATGATGTCTTCCTCCGGGAACTCGCCAAGGTGAAGCAGGAGAATAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1453 CTGACGAAGCTCCACAGCTTCCTGGGTGATGATGTCTTCCTCCGGGAACTCGCCAAGGTGAAGCAGGAGAATAA 1526
Query 1629 GCTGAAGTTTTCTCAGTTCCTGGAGACGGAGTACAAAGTGAAGATCAACCCATCCTCCATGTTTGATGTCCAGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1527 GCTGAAGTTTTCTCAGTTCCTGGAGACGGAGTACAAAGTGAAGATCAACCCATCCTCCATGTTTGATGTCCAGG 1600
Query 1703 TGAAGAGGATACATGAGTACAAGCGACAGCTCTTGAACTGTCTGCATGTGATCACGATGTACAACCGCATTAAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1601 TGAAGAGGATACATGAGTACAAGCGACAGCTCTTGAACTGTCTGCATGTGATCACGATGTACAACCGCATTAAG 1674
Query 1777 AAAGACCCTAAGAAGTTATTCGTGCCAAGGACAGTTATCATTGGTGGTAAAGCTGCCCCAGGATATCACATGGC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675 AAAGACCCTAAGAAGTTATTCGTGCCAAGGACAGTTATCATTGGTGGTAAAGCTGCCCCAGGATATCACATGGC 1748
Query 1851 CAAAATGATCATAAAGCTGATCACTTCAGTGGCAGATGTGGTGAACAATGACCCTATGGTTGGAAGCAAGTTGA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1749 CAAAATGATCATAAAGCTGATCACTTCAGTGGCAGATGTGGTGAACAATGACCCTATGGTTGGAAGCAAGTTGA 1822
Query 1925 AAGTCATCTTCTTGGAGAACTACAGAGTATCTCTTGCTGAAAAAGTCATTCCAGCCACAGATCTGTCAGAGCAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1823 AAGTCATCTTCTTGGAGAACTACAGAGTATCTCTTGCTGAAAAAGTCATTCCAGCCACAGATCTGTCAGAGCAG 1896
Query 1999 ATTTCCACTGCAGGCACCGAAGCCTCGGGGACAGGCAATATGAAGTTCATGCTAAATGGGGCCCTAACTATCGG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1897 ATTTCCACTGCAGGCACCGAAGCCTCGGGGACAGGCAATATGAAGTTCATGCTAAATGGGGCCCTAACTATCGG 1970
Query 2073 GACCATGGATGGGGCCAATGTGGAAATGGCAGAAGAAGCTGGGGAAGAGAACCTGTTCATCTTTGGCATGAGGA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1971 GACCATGGATGGGGCCAATGTGGAAATGGCAGAAGAAGCTGGGGAAGAGAACCTGTTCATCTTTGGCATGAGGA 2044
Query 2147 TAGATGATGTGGCTGCTTTGGACAAGAAAGGGTACGAGGCAAAAGAATACTATGAGGCACTTCCAGAGCTGAAG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2045 TAGATGATGTGGCTGCTTTGGACAAGAAAGGGTACGAGGCAAAAGAATACTATGAGGCACTTCCAGAGCTGAAG 2118
Query 2221 CTGGTCATTGATCAAATTGACAATGGCTTTTTTTCTCCCAAGCAGCCTGACCTCTTCAAAGATATCATCAACAT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2119 CTGGTCATTGATCAAATTGACAATGGCTTTTTTTCTCCCAAGCAGCCTGACCTCTTCAAAGATATCATCAACAT 2192
Query 2295 GCTATTTTATCATGACAGGTTTAAAGTCTTTGCAGACTACGAAGCCTATGTCAAGTGTCAAGATAAAGTGAGTC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2193 GCTATTTTATCATGACAGGTTTAAAGTCTTTGCAGACTACGAAGCCTATGTCAAGTGTCAAGATAAAGTGAGTC 2266
Query 2369 AGCTGTACATGAATCCAAAGGCCTGGAACACAATGGTACTCAAAAACATAGCTGCCTCGGGGAAATTCTCCAGT 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2267 AGCTGTACATGAATCCAAAGGCCTGGAACACAATGGTACTCAAAAACATAGCTGCCTCGGGGAAATTCTCCAGT 2340
Query 2443 GACCGAACAATTAAAGAATATGCCCAAAACATCTGGAACGTGGAACCTTCAGATCTAAAGATTTCTCTATCCAA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2341 GACCGAACAATTAAAGAATATGCCCAAAACATCTGGAACGTGGAACCTTCAGATCTAAAGATTTCTCTATCCAA 2414
Query 2517 TGAATCTAACAAAGTCAATGGAAAT 2541
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2415 TGAATCTAACAAAGTCAATGGAAAT 2439