Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477588
- Subject:
- NM_001256497.3
- Aligned Length:
- 1606
- Identities:
- 1424
- Gaps:
- 98
Alignment
Query 1 ATGGCTCTCATCCCAGACTTGGCCATGGAAACCTGGCTTCTCCTGGCTGTCAGCCTGGTGCTCCTCTATCTATA 74
||||.||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATCTCATCCCAAACTTGGCCGTGGAAACCTGGCTTCTCCTGGCTGTCAGCCTGATACTCCTCTATCTATA 74
Query 75 TGGAACCCATTCACATGGACTTTTTAAGAAGCTTGGAATTCCAGGGCCCACACCTCTGCCTTTTTTGGGAAATA 148
||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 75 TGGAACCCGTACACATGGACTTTTTAAGAAGCTTGGAATTCCAGGGCCCACACCTCTGCCTTTTTTGGGAAATG 148
Query 149 TTTTGTCCTACCATAAGGGCTTTTGTATGTTTGACATGGAATGTCATAAAAAGTATGGAAAAGTGTGGGGCTTT 222
.||||||||.||.||||||||.|||.|.||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||.|||||..||
Sbjct 149 CTTTGTCCTTCCGTAAGGGCTATTGGACGTTTGACATGGAATGTTATAAAAAGTATAGAAAAGTCTGGGGTATT 222
Query 223 TATGATGGTCAACAGCCTGTGCTGGCTATCACAGATCCTGACATGATCAAAACAGTGCTAGTGAAAGAATGTTA 296
|||||..|||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TATGACTGTCAACAGCCTATGCTGGCTATCACAGATCCCGACATGATCAAAACAGTGCTAGTGAAAGAATGTTA 296
Query 297 TTCTGTCTTCACAAACCGGAGGCCTTTTGGTCCAGTGGGATTTATGAAAAGTGCCATCTCTATAGCTGAGGATG 370
|||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTCTGTCTTCACAAACCGGAGGCCTTTCGGGCCAGTGGGATTTATGAAAAATGCCATCTCTATAGCTGAGGATG 370
Query 371 AAGAATGGAAGAGATTACGATCATTGCTGTCTCCAACCTTCACCAGTGGAAAACTCAAGGAGATGGTCCCTATC 444
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGAATGGAAGAGAATACGATCATTGCTGTCTCCAACATTCACCAGCGGAAAACTCAAGGAGATGGTCCCTATC 444
Query 445 ATTGCCCAGTATGGAGATGTGTTGGTGAGAAATCTGAGGCGGGAAGCAGAGACAGGCAAGCCTGTCACCTTGAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATTGCCCAGTATGGAGATGTGTTGGTGAGAAATCTGAGGCGGGAAGCAGAGACAGGCAAGCCTGTCACCTTGAA 518
Query 519 AGACGTCTTTGGGGCCTACAGCATGGATGTGATCACTAGCACATCATTTGGAGTGAACATCGACTCTCTCAACA 592
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 519 ACACGTCTTTGGGGCCTACAGCATGGATGTGATCACTAGCACATCATTTGGAGTGAGCATCGACTCTCTCAACA 592
Query 593 ATCCACAAGACCCCTTTGTGGAAAACACCAAGAAGCTTTTAAGATTTGATTTTTTGGATCCATTCTTTCTCTCA 666
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||...||.|||||||||.||||||||
Sbjct 593 ATCCACAAGACCCCTTTGTGGAAAACACCAAGAAGCTTTTAAGATTTAATCCATTAGATCCATTCGTTCTCTCA 666
Query 667 ATAACAGTCTTTCCATTCCTCATCCCAATTCTTGAAGTATTAAATATCTGTGTGTTTCCAAGAGAAGTTACAAA 740
||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||||..|||||||||||||.||||||.||.
Sbjct 667 ATAAAAGTCTTTCCATTCCTTACCCCAATTCTTGAAGCATTAAATATCACTGTGTTTCCAAGAAAAGTTATAAG 740
Query 741 TTTTTTAAGAAAATCTGTAAAAAGGATGAAAGAAAGTCGCCTCGAAGATACACAAAAGCACCGAGTGGATTTCC 814
||||.|||.|||||||||||||..|||.||||||.||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTTCTAACAAAATCTGTAAAACAGATAAAAGAAGGTCGCCTCAAAGAGACACAAAAGCACCGAGTGGATTTCC 814
Query 815 TTCAGCTGATGATTGACTCTCAGAATTCAAAAGAAACTGAGTCCCACAAAGCTCTGTCCGATCTGGAGCTCGTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 815 TTCAGCTGATGATTGACTCTCAGAATTCAAAAGACTCTGAGACCCACAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGCTCATG 888
Query 889 GCCCAATCAATTATCTTTATTTTTGCTGGCTATGAAACCACGAGCAGTGTTCTCTCCTTCATTATGTATGAACT 962
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 889 GCCCAATCAATTATCTTTATTTTTGCTGGCTATGAAACCACGAGCAGTGTTCTCTCCTTCATTATATATGAACT 962
Query 963 GGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAGGAGGAAATTGATGCAGTTTTACCCAATAAGGCACCACCCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAAGTGCAGAAGGAAATTGATACAGTTTTACCCAATAAGGCACCACCCA 1036
Query 1037 CCTATGATACTGTGCTACAGATGGAGTATCTTGACATGGTGGTGAATGAAACGCTCAGATTATTCCCAATTGCT 1110
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||
Sbjct 1037 CCTATGATACTGTGCTACAGTTGGAGTATCTTGACATGGTGGTGAATGAAACACTCAGATTATTCCCAGTTGCT 1110
Query 1111 ATGAGACTTGAGAGGGTCTGCAAAAAAGATGTTGAGATCAATGGGATGTTCATTCCCAAAGGGGTGGTGGTGAT 1184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATGAGACTTGAGAGGGTCTGCAAAAAAGATGTTGAAATCAATGGGATGTTTATTCCCAAAGGGGTGGTGGTGAT 1184
Query 1185 GATTCCAAGCTATGCTCTTCACCGTGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCCTCCCTGAAAGATTCA 1258
||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1185 GATTCCAAGCTATGTTCTTCATCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCCTCCCTGAAAGGTTCA 1258
Query 1259 GCAAGAAGAACAAGGACAACATAGATCCTTACATATACACACCCTTTGGAAGTGGACCCAGAAACTGCATTGGC 1332
|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GTAAAAAGAACAAGGACAACATAGATCCTTACATATACACACCCTTTGGAAGTGGACCCAGAAACTGCATTGGC 1332
Query 1333 ATGAGGTTTGCTCTCATGAACATGAAACTTGCTCTAATCAGAGTCCTTCAGAACTTCTCCTTCAAACCTTGTAA 1406
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATGAGGTTTGCTCTCGTGAACATGAAACTTGCTCTAGTCAGAGTCCTTCAGAACTTCTCCTTCAAACCTTGTAA 1406
Query 1407 AGAAACACAGATCCCCCTGAAATTAAGCTTAGGAGGACTTCTTCAACCAGAAAAACCCGTTGTTCTAAAGGTTG 1480
|||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 1407 AGAAACACAGATCCCCCTGAAATTACGCTTTGGAGGACTTCTTCTAACAGAAAAACCCATTGTTCTAAAGGCTG 1480
Query 1481 AGTCAAGGGATGGCACC---GTAAG---TGGAGCC--------------------------------------- 1509
||||||||||||..||| || || |||||||
Sbjct 1481 AGTCAAGGGATGAGACCTTTGT-AGATATGGAGCCCATTCACATGGACTTTTTAAGAAGCTTGGCATTCCAGGG 1553
Query 1510 ---------------------------------------------------- 1509
Sbjct 1554 CCCACACCTCTGCTTTTTTTGGGAACTACTTTGTCCTACCATCAGATCCCGC 1605