Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477588
• Subject: NM_001291830.2
• Aligned Length: 1524
• Identities: 1311
• Gaps: 63

Alignment

Query    1  ATGGCTCTCATCCCAGACTTGGCCATGGAAACCTGGCTT-CTCCTG--------GCTGTCAGCCTGGTGCTCCT  65
                                    |||.||       || ||..||        |||||.|         |..|
Sbjct    1  ------------------------ATGCAA-------TTACTGATGTTGGAGTTGCTGTTA---------TTAT  34

Query   66  CTATC-TATATGGAACCCATTCACATGGACTTTTTAAGAAGCTTGGAATTCCAGGGCCCACACCTCTGCCTTTT  138
            .|||| |||||||.||||.|.||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct   35  TTATCGTATATGGGACCCGTACACATGGACTTTTTAAGAGACTGGGAATTCCAGGGCCCACACCTCTGCCTTTG  108

Query  139  TTGGGAAATATTTTGTCCTACCATAAGGGCTTTTGTATGTTTGACATGGAATGTCATAAAAAGTATGGAAAAGT  212
            |||||||||.||||||||||.|.|.||||..|.||.|..|||||||..||.||..|||||||||||||||||.|
Sbjct  109  TTGGGAAATGTTTTGTCCTATCGTCAGGGTCTCTGGAAATTTGACACAGAGTGCTATAAAAAGTATGGAAAAAT  182

Query  213  GTGGGGCTTTTATGATGGTCAACAGCCTGTGCTGGCTATCACAGATCCTGACATGATCAAAACAGTGCTAGTGA  286
            ||||||....|||||.|||||||..|||||||||||.|||||||||||.|||.||||||.||||||||||||||
Sbjct  183  GTGGGGAACGTATGAAGGTCAACTCCCTGTGCTGGCCATCACAGATCCCGACGTGATCAGAACAGTGCTAGTGA  256

Query  287  AAGAATGTTATTCTGTCTTCACAAACCGGAGGCCTTTTGGTCCAGTGGGATTTATGAAAAGTGCCATCTCTATA  360
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  257  AAGAATGTTATTCTGTCTTCACAAATCGAAGGTCTTTAGGCCCAGTGGGATTTATGAAAAGTGCCATCTCTTTA  330

Query  361  GCTGAGGATGAAGAATGGAAGAGATTACGATCATTGCTGTCTCCAACCTTCACCAGTGGAAAACTCAAGGAGAT  434
            ||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  331  GCTGAGGATGAAGAATGGAAGAGAATACGGTCATTGCTGTCTCCAACCTTCACCAGCGGAAAACTCAAGGAGAT  404

Query  435  GGTCCCTATCATTGCCCAGTATGGAGATGTGTTGGTGAGAAATCTGAGGCGGGAAGCAGAGACAGGCAAGCCTG  508
            |.||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  405  GTTCCCCATCATTGCCCAGTATGGAGATGTATTGGTGAGAAACTTGAGGCGGGAAGCAGAGAAAGGCAAGCCTG  478

Query  509  TCACCTTGAAAGACGTCTTTGGGGCCTACAGCATGGATGTGATCACTAGCACATCATTTGGAGTGAACATCGAC  582
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479  TCACCTTGAAAGACATCTTTGGGGCCTACAGCATGGATGTGATTACTGGCACATCATTTGGAGTGAACATCGAC  552

Query  583  TCTCTCAACAATCCACAAGACCCCTTTGTGGAAAACACCAAGAAGCTTTTAAGATTTGATTTTTTGGATCCATT  656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||.||||||.|..|||.|||||.|||.||.||||||||
Sbjct  553  TCTCTCAACAATCCACAAGACCCCTTTGTGGAGAGCACTAAGAAGTTCCTAAAATTTGGTTTCTTAGATCCATT  626

Query  657  CTTTCTCTCAATAACAGTCTTTCCATTCCTCATCCCAATTCTTGAAGTATTAAATATCTGTGTGTTTCCAAGAG  730
            .|||||||||||||.|.|||||||||||||.|.||||.||.||||||.|||||||.|||.|.|||||||||   
Sbjct  627  ATTTCTCTCAATAATACTCTTTCCATTCCTTACCCCAGTTTTTGAAGCATTAAATGTCTCTCTGTTTCCAA---  697

Query  731  AAGTTAC---AAATTTTTTAAGAAAATCTGTAAAAAGGATGAAAGAAAGTCGCCTCGAAGATACACAAAAGCAC  801
            |||.|||   ||||||||||||.|||||||||||.||.|||||..|||||||||||.|.||.|.||||||||||
Sbjct  698  AAGATACCATAAATTTTTTAAGTAAATCTGTAAACAGAATGAAGAAAAGTCGCCTCAACGACAAACAAAAGCAC  771

Query  802  CGAGTGGATTTCCTTCAGCTGATGATTGACTCTCAGAATTCAAAAGAAACTGAGTCCCACAAAGCTCTGTCCGA  875
            |||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  772  CGACTAGATTTCCTTCAGCTGATGATTGACTCCCAGAATTCGAAAGAAACTGAGTCCCACAAAGCTCTGTCTGA  845

Query  876  TCTGGAGCTCGTGGCCCAATCAATTATCTTTATTTTTGCTGGCTATGAAACCACGAGCAGTGTTCTCTCCTTCA  949
            |||||||||||..|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  846  TCTGGAGCTCGCAGCCCAGTCAATAATCTTCATTTTTGCTGGCTATGAAACCACCAGCAGTGTTCTTTCCTTCA  919

Query  950  TTATGTATGAACTGGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAGGAGGAAATTGATGCAGTTTTACCCAAT  1023
            .|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  920  CTTTATATGAACTGGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAAAAGGAGATTGATGCAGTTTTGCCCAAT  993

Query 1024  AAGGCACCACCCACCTATGATACTGTGCTACAGATGGAGTATCTTGACATGGTGGTGAATGAAACGCTCAGATT  1097
            |||||||||||.|||||||||.|.|||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  994  AAGGCACCACCTACCTATGATGCCGTGGTACAGATGGAGTACCTTGACATGGTGGTGAATGAAACACTCAGATT  1067

Query 1098  ATTCCCAATTGCTATGAGACTTGAGAGGGTCTGCAAAAAAGATGTTGAGATCAATGGGATGTTCATTCCCAAAG  1171
            |||||||.|||||||.||||||||||||...|||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||
Sbjct 1068  ATTCCCAGTTGCTATTAGACTTGAGAGGACTTGCAAGAAAGATGTTGAAATCAATGGGGTATTCATTCCCAAAG  1141

Query 1172  GGGTGGTGGTGATGATTCCAAGCTATGCTCTTCACCGTGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCCTC  1245
            ||....|||||.|||||||||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|
Sbjct 1142  GGTCAATGGTGGTGATTCCAACTTATGCTCTTCACCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGGAGTTCCGC  1215

Query 1246  CCTGAAAGATTCAGCAAGAAGAACAAGGACAACATAGATCCTTACATATACACACCCTTTGGAAGTGGACCCAG  1319
            ||||||||.|||||.||||||   |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1216  CCTGAAAGGTTCAGTAAGAAG---AAGGACAGCATAGATCCTTACATATACACACCCTTTGGAACTGGACCCAG  1286

Query 1320  AAACTGCATTGGCATGAGGTTTGCTCTCATGAACATGAAACTTGCTCTAATCAGAGTCCTTCAGAACTTCTCCT  1393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1287  AAACTGCATTGGCATGAGGTTTGCTCTCATGAACATGAAACTTGCTCTAATCAGAGTCCTTCAGAACTTCTCCT  1360

Query 1394  TCAAACCTTGTAAAGAAACACAGATCCCCCTGAAATTAAGCTTAGG--AGGACTTCTTCAACCAGAAAAACCCG  1465
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|  |.|  |||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1361  TCAAACCTTGTAAAGAAACACAGATCCCCTTGAAATTAGAC--ACGCAAGGACTTCTTCAACCAGAAAAACCCA  1432

Query 1466  TTGTTCTAAAGGTTGAGTCAAGGGATGGCACCGTAAGTGGAGCC  1509
            |||||||||||||.||.|||||.|||||.|||.|||||||||..
Sbjct 1433  TTGTTCTAAAGGTGGATTCAAGAGATGGAACCCTAAGTGGAGAA  1476