Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477634
• Subject: NM_001323627.2
• Aligned Length: 1520
• Identities: 1361
• Gaps: 139

Alignment

Query    1  ATGTACAAGATGAACATCTGCAACAAGCCCTCCAACAAGACGGCCCCTGAGAAGAGTGTGTGGACGGCACCGGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTACAAGATGAACATCTGCAACAAGCCCTCCAACAAGACGGCCCCTGAGAAGAGTGTGTGGACGGCACCGGC  74

Query   75  ACAGCCCAGCGGACCCTCCCCTGAGCTGCAGGGCCAGCGATCCCGCCGGAATGGGTGGAGCTGGCCCCCTCACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACAGCCCAGCGGACCCTCCCCTGAGCTGCAGGGCCAGCGATCCCGCCGGAATGGGTGGAGCTGGCCCCCTCACC  148

Query  149  CGCTCCAGATTGTGGCCTGGCTGCTGTACCTCTTCTTTGCTGTGATCGGCTTTGGGATCCTTGTTCCCCTCCTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCTCCAGATTGTGGCCTGGCTGCTGTACCTCTTCTTTGCTGTGATCGGCTTTGGGATCCTTGTTCCCCTCCTG  222

Query  223  CCTCACCACTGGGTGCCCGCTGGCTACGCTTGCATGGGCGCCATCTTTGCTGGCCACCTTGTGGTGCACCTGAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTCACCACTGGGTGCCCGCTGGCTACGCTTGCATGGGCGCCATCTTTGCTGGCCACCTTGTGGTGCACCTGAC  296

Query  297  CGCCGTCTCCATCGATCCAGCAGATGCCAACGTGCGGGACAAGAGCTATGCGGGGCCCCTGCCCATCTTCAACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGCCGTCTCCATCGATCCAGCAGATGCCAACGTGCGGGACAAGAGCTATGCGGGGCCCCTGCCCATCTTCAACC  370

Query  371  GAAGCCAGCACGCACATGTCATTGAAGACCTGCACTGCAACTTGTGCAACGTGGATGTGAGCGCTCGCTCCAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAAGCCAGCACGCACATGTCATTGAAGACCTGCACTGCAACTTGTGCAACGTGGATGTGAGCGCTCGCTCCAAG  444

Query  445  CACTGCAGCGCCTGCAACAAGTGCGTGTGCGGTTTCGACCACCACTGCAAGTGGCTCAACAACTGTGTGGGCGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACTGCAGCGCCTGCAACAAGTGCGTGTGCGGTTTCGACCACCACTGCAAGTGGCTCAACAACTGTGTGGGCGA  518

Query  519  GCGGAACTACCGGCTCTTTCTACACAGTGTTGCATCCGCTTTACTGGGCGTCCTGCTCCTGGTGCTGGTGGCCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCGGAACTACCGGCTCTTTCTACACAGTGTTGCATCCGCTTTACTGGGCGTCCTGCTCCTGGTGCTGGTGGCCA  592

Query  593  CATATGTCTTCGTGGAGTTCTTTGTCAACCCCATGCGTCTGCGCACCAACCGACACTTTGAAGTCCTGAAGAAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CATATGTCTTCGTGGAGTTCTTTGTCAACCCCATGCGTCTGCGCACCAACCGACACTTTGAAGTCCTGAAGAAT  666

Query  667  CACACGGATGTGTGGTTCGTGTTCCTGCCTGCCGCCCCCGTGGAGACCCAGGCCCCTGCCATCCTGGCCCTGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CACACGGATGTGTGGTTCGTGTTCCTGCCTGCCGCCCCCGTGGAGACCCAGGCCCCTGCCATCCTGGCCCTGGC  740

Query  741  CGCCCTGCTCATCCTTCTGGGCCTCCTGTCCACAGCCCTCCTGGGGCACCTGCTCTGCTTCCACATTTATCTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGCCCTGCTCATCCTTCTGGGCCTCCTGTCCACAGCCCTCCTGGGGCACCTGCTCTGCTTCCACATTTATCTCA  814

Query  815  TGTGGCACAAGCTCACCACCTATGAGTACATCGTGCAGCACCGCCCACCACAGGAGGCCAAGGGGGTTCACAGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGTGGCACAAGCTCACCACCTATGAGTACATCGTGCAGCACCGCCCACCACAGGAGGCCAAGGGGGTTCACAGG  888

Query  889  GAGCTCGAGTCATGTCCTCCCAAGATGCGGCCCATTCAGGAGATGGAGTTCTACATGCGGACCTTCAGACATAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGCTCGAGTCATGTCCTCCCAAGATGCGGCCCATTCAGGAGATGGAGTTCTACATGCGGACCTTCAGACATAT  962

Query  963  GCGCCCAGAGCCCCCTGGCCAGGCCGGGCCAGCAGCAGTGAATGCCAAACACTCTCGCCCTGCCTCCCCGGATC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |.||||||.|..||
Sbjct  963  GCGCCCAGAGCCCCCTGGCCAGGCCGGGCCAGCAGCAGTGAATGCCAA------------TCCCTCCCAGTTTC  1024

Query 1037  ---CGACCCCAGG-TAGGAGGGACTGTGCTGGGCCTCCGGTCCAGGTGGAGTGGGATAGAAAGAAGCCTCTACC  1106
               |.||||..|| .|.|.||.|          |||||                       |..|.|||||.||
Sbjct 1025  TTGCCACCCGTGGCCAAGCGGAA----------CCTCC-----------------------ACCACCCTCTTCC  1065

Query 1107  CTGG---CGCTCGCCTCTGCTTCTTTTGGCGATGTGGGGCCCTCAGGCTCC--CCCGTGTCTCTGCAGAAAAAG  1175
            |..|   |.|||||| ||||.||                |||   ||.|||  |||         |||||||||
Sbjct 1066  CCAGACACTCTCGCC-CTGCCTC----------------CCC---GGATCCGACCC---------CAGAAAAAG  1110

Query 1176  AGGAAGAGGCGCGTGTATAAAGTGCGAACGTCTGAGACCTCGGATCCGGCGTCGGGGCCTAGGGCCCCCAGCCG  1249
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGGAAGAGGCGCGTGTATAAAGTGCGAACGTCTGAGACCTCGGATCCGGCGTCGGGGCCTAGGGCCCCCAGCCG  1184

Query 1250  CCGCTCCAGCTCGTCGACGGATTCCGCGGACGCCAGCCCTGTGCACGCCGCTGGCCCTGCCGGCGCCTACCACT  1323
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCGCTCCAGCTCGTCGACGGATTCCGCGGACGCCAGCCCTGTGCACGCCGCTGGCCCTGCCGGCGCCTACCACT  1258

Query 1324  CGGCGTCGGCAGAGTCCGTGGACGAGATTCCAGTGGCGCAGACGCGCCTGGGCAGCGCCGCTCTGGCCGCCCCG  1397
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGGCGTCGGCAGAGTCCGTGGACGAGATTCCAGTGGCGCAGACGCGCCTGGGCAGCGCCGCTCTGGCCGCCCCG  1332

Query 1398  CGGGGCCGGGGCCGACAGCCCACGCTGGCGCGGCAGGCGCGTGCGCCCGCCGTTTTCG----------------  1455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct 1333  CGGGGCCGGGGCCGACAGCCCACGCTGGCGCGGCAGGCGCGTGCGCCCGCCGTTTTCGTGAGCCCGAGCAGCGG  1406

Query 1456  ----------------------------------------  1455
                                                    
Sbjct 1407  CGAGCCCAGGGCGCCGGGCGGCCGGGAGGCTGGTCTGGCT  1446