Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477687
• Subject: NM_001038607.2
• Aligned Length: 2896
• Identities: 2555
• Gaps: 20

Alignment

Query    1  ATGACCATGGCTGGGGGCGATAGGGGACTAGTGGCCCCTCAAAACACGTTTCTGGAGAATATTGTTCGGCGGTC  74
            ||||||||||||||.|||....||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGACCATGGCTGGCGGCCGGCGGGGACTAGTGGCCCCGCAGAACACGTTTCTGGAGAACATCGTGCGGCGGTC  74

Query   75  CAATGATACTAATTTTGTGTTGGGGAATGCTCAGATAGTGGACTGGCCTATTGTGTACAGCAATGATGGATTTT  148
            |||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  CAACGACACTAATTTTGTGTTGGGGAATGCCCAGATAGTCGACTGGCCCATCGTGTACAGCAATGATGGATTCT  148

Query  149  GCAAGCTGTCTGGCTATCACAGGGCAGAAGTGATGCAAAAAAGCAGCACCTGCAGTTTTATGTATGGGGAGCTG  222
            ||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  GCAAGCTGTCTGGCTACCACCGGGCAGAAGTGATGCAGAAAAGCAGCGCCTGCAGTTTTATGTATGGAGAGCTG  222

Query  223  ACTGATAAAGACACGATTGAAAAAGTGCGGCAAACATTTGAGAACTATGAGATGAATTCCTTTGAAATTCTGAT  296
            |||||.||.|||||..|||||||.||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  ACTGACAAGGACACAGTTGAAAAGGTTCGCCAGACCTTTGAGAACTACGAGATGAATTCCTTCGAAATTCTGAT  296

Query  297  GTACAAGAAGAACAGGACACCTGTGTGGTTCTTTGTGAAAATTGCTCCAATTCGAAACGAACAGGATAAAGTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||..|.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTACAAGAAGAACAGGACACCTGTGTGGTTTTTTGTGAAGATCGCTCCGATCAGGAACGAACAGGATAAAGTGG  370

Query  371  TTTTATTTCTTTGCACTTTCAGTGACATAACAGCTTTCAAACAGCCAATTGAGGATGATTCATGTAAAGGCTGG  444
            |..|.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||
Sbjct  371  TCCTGTTCCTTTGCACTTTCAGCGACATAACTGCATTCAAGCAGCCCATCGAGGACGACTCCTGCAAAGGTTGG  444

Query  445  GGGAAGTTTGCTCGGCTGACAAGAGCACTGACAAGCAGCAGGGGTGTCCTGCAGCAGCTGGCTCCAAGCGTGCA  518
            |||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||
Sbjct  445  GGGAAGTTTGCCCGACTGACCAGAGCTCTGACAAGCAGCAGGGGAGTCCTGCAGCAGCTGGCCCCCAGTGTACA  518

Query  519  AAAAGGCGAGAATGTCCACAAGCACTCCCGCCTGGCAGAGGTCCTACAGCTGGGCTCAGACATCCTTCCCCAGT  592
            .||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAGGGTGAGAATGTTCACAAGCACTCGCGCCTGGCAGAGGTCCTGCAGCTGGGTTCAGACATCCTTCCCCAGT  592

Query  593  ACAAGCAAGAGGCACCAAAGACTCCCCCTCACATCATCTTACATTATTGTGTTTTTAAGACCACGTGGGATTGG  666
            |||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAAGCAAGAGGCGCCAAAGACACCCCCTCACATCATCCTACACTACTGTGTCTTTAAGACCACGTGGGATTGG  666

Query  667  ATCATCTTGATCTTGACCTTCTATACAGCCATCTTGGTCCCTTATAATGTCTCCTTCAAAACCAGGCAGAATAA  740
            ||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCATCTTGATCCTGACCTTCTACACAGCCATCTTGGTCCCTTACAACGTCTCCTTTAAAACCAGGCAGAATAA  740

Query  741  TGTGGCCTGGCTGGTTGTTGATAGCATCGTGGATGTTATCTTTTTGGTGGACATTGTGCTCAATTTTCATACCA  814
            |||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|.||||||||.||||
Sbjct  741  TGTGGCCTGGCTGGTGGTGGACAGCATCGTGGATGTCATCTTTTTGGTGGACATTGTTTTGAATTTTCACACCA  814

Query  815  CCTTTGTTGGACCAGCAGGGGAGGTGATTTCTGACCCCAAACTTATCCGCATGAACTACCTGAAGACGTGGTTT  888
            |||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCTTTGTCGGGCCAGCGGGGGAAGTGATATCTGACCCCAAACTTATCCGCATGAACTACCTGAAGACGTGGTTT  888

Query  889  GTGATTGACCTTCTGTCCTGTTTGCCATATGATGTCATCAACGCTTTTGAGAACGTGGATGAGGGCATCAGCAG  962
            |||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGATCGACCTTCTGTCCTGTTTGCCGTATGACGTCATCAACGCTTTTGAGAACGTGGATGAGGGCATCAGCAG  962

Query  963  CCTGTTCAGCTCTCTAAAAGTTGTCCGGCTGCTCCGTCTTGGGCGAGTGGCCCGTAAGCTGGACCACTACATTG  1036
            |||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|
Sbjct  963  CCTGTTCAGTTCTCTGAAAGTTGTGCGGCTGCTCCGTCTCGGGCGAGTGGCCCGCAAACTGGATCATTACATCG  1036

Query 1037  AATATGGAGCTGCTGTGCTGGTCCTGCTGGTGTGTGTGTTTGGGCTGGCTGCACACTGGATGGCCTGCATCTGG  1110
            |.||||||||.||.||.|||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGTATGGAGCCGCGGTACTGGTCCTGTTGGTGTGCGTGTTTGGGCTTGCTGCCCACTGGATGGCCTGCATCTGG  1110

Query 1111  TACAGCATTGGGGACTATGAGATCTTTGACGAGGACACCAAGACAATCCGCAACAACAGCTGGCTGTACCAACT  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111  TACAGCATTGGGGACTATGAGATCTTTGATGAAGACACCAAGACCATCCGCAACAACAGCTGGCTCTACCAACT  1184

Query 1185  AGCGATGGACATTGGCACCCCTTACCAGTTTAATGGGTCTGGCTCAGGGAAGTGGGAAGGTGGTCCCAGCAAGA  1258
            .||..|||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1185  GGCATTGGACATCGGCACTCCATACCAGTTTAATGGGTCTGGTTCAGGGAAGTGGGAAGGTGGGCCAAGCAAGA  1258

Query 1259  ATTCTGTCTACATCTCCTCGTTGTATTTCACAATGACCAGCCTCACCAGTGTGGGCTTTGGGAACATCGCCCCA  1332
            |.||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1259  ACTCTGTCTACATCTCCTCGCTGTACTTCACCATGACAAGTCTCACCAGTGTGGGCTTTGGTAACATTGCCCCA  1332

Query 1333  TCCACAGACATTGAGAAGATCTTTGCAGTGGCCATCATGATGATTGGCTCACTTCTCTATGCCACCATCTTCGG  1406
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1333  TCCACAGACATCGAGAAGATCTTCGCAGTGGCCATCATGATGATTGGCTCTCTTCTGTATGCCACCATCTTTGG  1406

Query 1407  GAATGTGACGACTATTTTCCAACAGATGTATGCCAACACCAACAGATACCATGAGATGCTCAACAGTGTTCGGG  1480
            |||.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1407  GAACGTGACAACCATTTTCCAGCAGATGTACGCCAACACCAACAGGTACCACGAGATGCTCAACAGTGTCCGGG  1480

Query 1481  ACTTCCTGAAGCTCTACCAGGTGCCAAAAGGATTGAGTGAGCGAGTAATGGATTATATTGTGTCCACTTGGTCC  1554
            |.|||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1481  ATTTCCTGAAGCTCTACCAGGTGCCCAAAGGGCTGAGTGAGCGGGTCATGGACTACATTGTGTCCACCTGGTCC  1554

Query 1555  ATGTCCAGAGGCATTGACACAGAGAAGGTCCTGCAGATCTGCCCCAAGGACATGAGAGCCGACATCTGCGTGCA  1628
            ||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||
Sbjct 1555  ATGTCCCGAGGCATCGACACAGAGAAGGTCCTGCAGATCTGCCCCAAGGACATGCGAGCCGACATTTGCGTGCA  1628

Query 1629  CCTGAACCGCAAGGTGTTCAAGGAGCACCCGGCCTTCCGGCTGGCCAGTGATGGCTGCCTCCGGGCACTGGCCA  1702
            ||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||..|||||||.|||||||||||.|||||..||||||
Sbjct 1629  CCTGAACCGCAAAGTGTTCAAAGAACACCCTGCCTTTCGATTGGCCAGCGATGGCTGCCTGCGGGCCTTGGCCA  1702

Query 1703  TGGAGTTCCAGACGGTGCACTGTGCCCCAGGGGACCTCATCTACCATGCAGGAGAGAGCGTTGACAGCCTCTGC  1776
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1703  TGGAGTTCCAGACAGTGCACTGTGCCCCAGGGGACCTCATCTATCATGCTGGAGAGAGTGTGGACAGCCTCTGC  1776

Query 1777  TTTGTGGTTTCTGGCTCCCTGGAGGTGATCCAAGATGATGAGGTGGTGGCCATTCTAGGAAAAGGAGACGTGTT  1850
            ||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1777  TTCGTGGTCTCAGGCTCCCTGGAGGTGATCCAGGATGACGAGGTGGTGGCCATCCTAGGGAAAGGAGACGTGTT  1850

Query 1851  TGGAGATGTGTTCTGGAAGGAAGCCACCCTTGCCCAGTCCTGTGCCAATGTTAGGGCCTTGACCTACTGTGATC  1924
            |||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.|
Sbjct 1851  TGGGGATGTTTTCTGGAAGGAAGCTACCCTTGCACAGTCCTGTGCTAATGTCCGGGCCTTGACCTACTGTGACC  1924

Query 1925  TGCATGTGATCAAGCGGGATGCCCTGCAGAAAGTGCTGGAATTCTACACGGCCTTCTCCCATTCCTTCTCCCGG  1998
            ||||.|||||||||.||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1925  TGCACGTGATCAAGAGGGACGCCCTTCAGAAAGTGCTAGAATTCTACACAGCCTTCTCCCACTCCTTCTCCCGG  1998

Query 1999  AACCTGATTCTGACGTACAACTTGAGGAAGAGGATTGTGTTCCGGAAGATCAGCGACGTGAAACGTGAAGAGGA  2072
            |||||||||||.||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1999  AACCTGATTCTCACCTACAACCTGAGGAAGAGGATTGTGTTCCGGAAGATCAGCGACGTGAAACGAGAAGAGGA  2072

Query 2073  AGAACGCATGAAACGAAAGAATGAGGCCCCCCTGATCTTGCCCCCGGACCACCCTGTCCGGCGCCTCTTCCAGA  2146
            .||..|.||||||||.|||||.|||||||||||.|||.||||.||.||||||||.|||.|..|.||||||||.|
Sbjct 2073  GGAGAGGATGAAACGGAAGAACGAGGCCCCCCTTATCCTGCCTCCTGACCACCCCGTCAGAAGACTCTTCCAAA  2146

Query 2147  GATTCCGACAGCAGAAAGAGGCCAGGCTGGCAGCTGAGAGAGGGGGCCGGGACCTGGATGACCTAGATGTGGAG  2220
            |.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 2147  GGTTCCGCCAGCAGAAAGAAGCCAGGCTGGCAGCCGAGAGAGGGGGCCGGGACCTGGATGACCTGGATGTAGAA  2220

Query 2221  AAGGGCAATGTCCTTACAGAGCATGCCTCCGCCAACCACAGCCTCGTGAAGGCCAGCGTGGTCACCGTGCGTGA  2294
            ||||||||||.|||.||.||.|||.||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 2221  AAGGGCAATGCCCTCACGGACCATACCTCAGCCAACCACAGCCTGGTGAAGGCCAGTGTGGTCACGGTGCGTGA  2294

Query 2295  GAGTCCTGCCACGCCCGTATCCTTCCAGGCAGCCTCCACCTCCGGGGTGCCAGACCACGCAAAGCTACAGGCGC  2368
            |||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||.||||||||....||.||||||||||.|||||.||.||.|
Sbjct 2295  GAGCCCCGCCACGCCTGTGTCCTTCCAGGCGGCCACCACCTCCACCATGTCAGACCACGCCAAGCTGCATGCCC  2368

Query 2369  CAGGGTCCGAGTGCCTGGGCCCCAANTNGNTTGGGGGC----------GATTGTGCCAAGCGCAAAAGCTGGGC  2432
            |.||.||.||||||||.||.|||||          |||          ||...|||||||||||||.|||||||
Sbjct 2369  CCGGATCTGAGTGCCTAGGTCCCAA----------GGCAGTCAGCTGTGACCCTGCCAAGCGCAAAGGCTGGGC  2432

Query 2433  CCGCTTCAAAGATGCTTGCGGGAAGAGTGAGGACTGGAACAAGGTGTCCAAGGCTGAGTCGATGGAGACACTTC  2506
            |||.|||||||||||.||.||.|||.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 2433  CCGTTTCAAAGATGCCTGTGGAAAGGGTGAGGATTGGAACAAGGTGTCCAAGGCAGAGTCCATGGAGACGCTGC  2506

Query 2507  CCGAGAGGACAAAAGCGTCAGGCGAGGCCACACTGAAGAAGACAGACTCGTGTGACAGTGGCATCACCAAGAGC  2580
            |||||||||||||.||..|.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 2507  CCGAGAGGACAAAGGCACCGGGTGAGGCCACGCTGAAGAAGACAGACTCCTGTGACAGCGGAATCACCAAGAGC  2580

Query 2581  GACTTGCGCCTGGACAACGTGGGTGAGGCCAGGAGTCCCCAGGATCGGAGTCCCATCCTGGCAGAGGTCAAGCA  2654
            |||.|||||.|||||||.|||||||||.||||||||||.|||||.|||||.||||||.||||.|||||||||||
Sbjct 2581  GACCTGCGCTTGGACAATGTGGGTGAGACCAGGAGTCCTCAGGACCGGAGCCCCATCTTGGCTGAGGTCAAGCA  2654

Query 2655  TTCGTTCTACCCCATCCCTGAGCAGACGCTGCAGGCCACAGTCCTGGAGGTGAGGCACGAGCTGAAGGAGGACA  2728
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||...|.||||||||||||||.|
Sbjct 2655  TTCTTTCTACCCCATCCCTGAGCAGACGCTGCAGGCCACAGTGCTGGAGGTGAAATATGAGCTGAAGGAGGATA  2728

Query 2729  TCAAGGCCTTAAACGCCAAAATGACCAATATTGAGAAACAGCTCTCTGAGATACTCAGGATATTAACTTCCAGA  2802
            ||||||||||.||.||||||||||||...||||||||.|||||.||||||||||||||||||.|||..||||||
Sbjct 2729  TCAAGGCCTTGAATGCCAAAATGACCTCCATTGAGAAGCAGCTGTCTGAGATACTCAGGATACTAATGTCCAGA  2802

Query 2803  AGATCCTCTCAGTCTCCTCAGGAGTTGTTTGAAATATCGAGGCCACAGTCCCCAGAATCAGAGAGAGACATTTT  2876
            .|.|||.|.||.||||||||||||..|..|||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 2803  GGGTCCGCCCAATCTCCTCAGGAGACGGGTGAGATCTCCAGGCCCCAGTCCCCAGAGTCAGACAGAGACATTTT  2876

Query 2877  TGGAGCCAGC  2886
            ||||||.|||
Sbjct 2877  TGGAGCAAGC  2886