Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477726
• Subject: XM_006511551.2
• Aligned Length: 1096
• Identities: 955
• Gaps: 4

Alignment

Query    1  ATGCATCTAAGGCGAGTTAGAACCATGCCCCGACACAGCCAGTCCCTGACAATGGCACCATACTCATCTGTAAG  74
            |||||||||||||||||.|..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||
Sbjct    1  ATGCATCTAAGGCGAGTGAAGACCATGCCCCGACACAGCCAGTCCCTGACCATGGCGCCGTACTCTTCTGTGAG  74

Query   75  CCTCGTGGAGCAGCTGGAAGACAGGATCCTCTGCCATGAGAAAACCACCGCCGCCCTCGTAGAGCACGCCTTTC  148
            .||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.|
Sbjct   75  TCTGGTGGAGCAGCTGGAAGACAGGATCCTCTGTCATGAGAAAACCACAGCAGCACTGGTGGAGCATGCCTTCC  148

Query  149  GGATTAAAGATGACATTGTCAACAGTTTGCAGAAAATGCAAAACAAAGGGGGAGGTGACCGCTTGGCCAGGCTT  222
            |.||.|||||||||||.||||.||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  149  GCATCAAAGATGACATCGTCAGCAGTTTGCAGAAGATGCAGAATAAAGGGGGAGGTGACCGCTTAGCCAGGCTG  222

Query  223  TTCTTGGAGGAGCATATCAGAAACATAACTGCCATAGTGAAGCAACTTAATCGGGATATCGAGGTACTCCAGGA  296
            ||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  223  TTCTTGGAAGAGCATATCAGAAACATAACCGCCATTGTGAAGCAACTGAATCGGGATATTGAGGTTCTCCAGGA  296

Query  297  GCAGATTCGTGCTCGGGACAACATTAGCTATGGAACTAATTCTGCCTTAAAGACCCTGGAGATGCGCCAGCTCT  370
            ||||||.|||||..||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGATCCGTGCCAGGGACAACATCAGCTATGGAACTAATTCTGCCTTAAAGACGCTGGAGATGCGCCAGCTCT  370

Query  371  CCGGTTTGGGAGATCTTCGAGGAAGAGTGGCAAGATGTGATGCCAGCATAGCTAGACTTTCTGCAGAGCACAAA  444
            |.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.
Sbjct  371  CTGGCTTGGGAGATCTCCGAGGAAGAGTTGCAAGGTGCGACGCCAGCATAGCCAGGCTCTCTGCCGAGCATAAG  444

Query  445  ACGACCTATGAGGGGCTCCAGCACTTGAACAAAGAACAGCAGGCTGCCAAACTTATCTTGGAAACGAAAATCAA  518
            .|||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.||||||||
Sbjct  445  TCGACCTACGAGGGACTCCAGCACTTGAACAAGGAACAGCAAGCAGCCAAGCTTATCCTGGAAACAAAAATCAA  518

Query  519  AGATGCAGAGGGACAGATTTCTCAGCTTTTGAACAGAGTGGACTTGTCAATATCAGAGCAGAGCACCAAACTGA  592
            |||.|||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGACGCAGAAGGACAGATTTCTCAGCTTTTGAGCAGAGTGGACTTGTCCATCTCAGAGCAGAGCACCAAACTGA  592

Query  593  AGATGTCTCACAGAGACAGTAACCACCAGCTTCAGCTTTTGGACACTAAATTTAAAGGTACAGTTGAGGAACTC  666
            |||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct  593  AGATGTCCCACAGGGACAGCAACCACCAGCTCCAGCTCCTGGACACTAAATTTAAAGGCACCGTTGAAGAGCTC  666

Query  667  AGTAACCAGATATTATCTGCACGGAGTTGGTTGCAACAGGAACAAGAACGGATAGAAAAAAGAGCTTTTACAGA  740
            ||.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||.|||||.||.||||||| |.|||||.|||.|.||||
Sbjct  667  AGCAACCAGATTTTGTCTGCACGGAGTTGGCTGCAACAAGAACAGGAGCGGATAG-AGAAAGAACTTCTGCAGA  739

Query  741  AAATTGATCAGCTTTCCTTGATTGTTAAGGAAAACAGTGGAGCCAGTGAAAGGGATATGGAGAAGAAGCTCAGC  814
            ||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||..|.||||||||.||||||
Sbjct  740  AAATAGACCATCTCTCCTTGATTGTTAAGGAAAACAGTGGAGCCAATGAAAGAGACGTAGAGAAGAAACTCAGC  813

Query  815  CAGATGTCAGCCAGGCTTGACAAAATAGAAGAGGGTCAAAAGAAGACTTTTGATGGTCAGAGAACAAGGCAAGA  888
            ||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.||||.||.|..|||.||.|||||   ||.||..||
Sbjct  814  CAGATGTCGGCCAGGCTTGACAAAATCGAAGAGAGTCAGAAGAGGAATGCTGAAGGACAGAG---AAAGCCGGA  884

Query  889  AGAGGAGAAGATGCACGGGCGAATCACCAAGCTGGAGTTACAGATGAACCAGAACATCAAGGAAATGAAAGCAG  962
            .|||||||||.||||||||||.||||.||||||||||.|||||||||...||.||||.|||||.||||||||.|
Sbjct  885  CGAGGAGAAGGTGCACGGGCGGATCAGCAAGCTGGAGCTACAGATGACGGAGGACATGAAGGAGATGAAAGCGG  958

Query  963  AAGTTAATGCTGGGTTTACAGCCGTCTATGAAAGCATAGGATCCATCAGGCAAGTTCTCGAGGCCAAGATGAAG  1036
            |.||||||||.|||||..|||||.|||||||.||||||||.|||.||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  959  AGGTTAATGCCGGGTTCTCAGCCATCTATGAGAGCATAGGGTCCCTCAGACAAGTGCTGGAGGCCAAGATGAAG  1032

Query 1037  CTGGACAGGGACCAGCTACAGAAGCAAATCCAGCTGATGCAGAAGCCAGAGACCCCCATG  1096
            ||||||||||||||.||.||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1033  CTGGACAGGGACCAACTTCAGAAGCAGATCCAGCAGATGCAGAAGCCAGAGACCGCCATG  1092