Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477744
- Subject:
- NM_001347144.1
- Aligned Length:
- 1200
- Identities:
- 980
- Gaps:
- 60
Alignment
Query 1 ATGCTGGCCCGGAGGAAGCCGATGCTGCCGGCGCTCACCATCAACCCTACCATCGCCGAGGGCCCGTCCCCAAC 74
|||||||||||||||||||||.||.|.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1 ATGCTGGCCCGGAGGAAGCCGGTGTTACCGGCACTCACTATCAACCCTACCATCGCCGAGGGCCCGTCCCCCAC 74
Query 75 CAGCGAGGGCGCCTCCGAGGCAAACCTGGTGGACCTGCAGAAGAAGCTGGAGGAGCTGGAACTTGACGAGCAGC 148
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 75 CAGCGAGGGCGCCTCTGAGGCAAACCTGGTGGACCTCCAGAAGAAGCTGGAAGAGCTGGACCTGGATGAGCAGC 148
Query 149 A---GAAGCGGCTGGAAGCCTTTCTCACCCAGAAAGCCAAGGTCGGCGAACTCAAAGACGATGACTTCGAAAGG 219
| ||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct 149 AAAGGAAGCGGCTGGAGGCCTTCCTTACCCAGAAGGCTAAGGTCGGTGAGCTCAAGGACGACGACTTTGAGAGG 222
Query 220 ACCTCAGAGCTGGACGCGGGCAACGGCGGGGTGGTCACCAAAGTCCAGCACAGACCCTCGGGCCTCATCATGGC 293
|.|||||||||||..||.|||||.|||||.|||||||||||.|.||.|||.||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 223 ATCTCAGAGCTGGGTGCCGGCAATGGCGGAGTGGTCACCAAGGCCCGGCATAGGCCGTCAGGCCTCATCATGGC 296
Query 294 CAGGAAGCTGATCCACCTTGAGATCAAGCCGGCCATCCGGAACCAGATCATCCGCGAGCACCAGGTCCTGCACG 367
|||.||||||||||||||.||||||||.||||||.|.||.||||||||||||||.||||..|||||.|||||||
Sbjct 297 CAGAAAGCTGATCCACCTGGAGATCAAACCGGCCGTGCGCAACCAGATCATCCGGGAGCTGCAGGTGCTGCACG 370
Query 368 AGTGCAACTCACCGTACATCGTGGGCTTCTACGGGGCCTTCTACTGTGACAGGGAGATCAGCATCTGCATGGAG 441
||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||.|.|||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGTGCAACTCGCCCTACATCGTGGGCTTCTATGGGGCCTTCTACAGCGACGGCGAGATCAGCATCTGCATGGAG 444
Query 442 CACATGGATGGCGGCTCCCTGGACCAGGGGCTGAAAGAGGCCAAGAGGATTCCCGAGGACATCCTGGGGAAAGT 515
|||||||||||.|||||.||||||||||..|||||.|||||||||.|||||||.||.||||||.|||||||.||
Sbjct 445 CACATGGATGGTGGCTCACTGGACCAGGTACTGAAGGAGGCCAAGCGGATTCCTGAAGACATCTTGGGGAAGGT 518
Query 516 CAGCATTGCGGTTCTCCGGGGCTTGGCGTACCTCCGAGAGAAGCACCAGATCATGCACCGAAATGTGAAGCCCT 589
||||||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 519 CAGCATTGCGGTGCTCCGGGGCCTGGCCTACCTCCGAGAGAAGCACCAGATCATGCACAGAGATGTGAAGCCCT 592
Query 590 CCAACATCCTCGTGAACTCTAGAGGGGAGATCAAGCTGTGTGACTTCGGGGTGAGCGGCCAGCTCATCGACTCC 663
||||||||||.|||||||||.|.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 593 CCAACATCCTGGTGAACTCTCGCGGGGAGATTAAGCTGTGTGACTTCGGGGTGAGCGGCCAGCTGATCGACTCC 666
Query 664 ATGGCCAACTCCTTCATGGGCACGCGCTCCTACATGGCTCCGGAGCGGTTGCAGGGCACACATTACTCGGTGCA 737
|||||||||||.||..|.||.|||||||||||||||.|.||.||||||.||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 667 ATGGCCAACTCGTTTGTAGGGACGCGCTCCTACATGTCCCCAGAGCGGCTGCAGGGCACCCACTACTCTGTGCA 740
Query 738 GTCGGTCATCTGGAGCATGGACCTGTCCCTGGTGGAGCTGGCCATCGAAAGGTACCCCATCCCCCCGCCCGACG 811
|||||.||||||||||||||..|||||.|||||||||||||||||||..|||||.|||||.|||||.||.||.|
Sbjct 741 GTCGGACATCTGGAGCATGGGGCTGTCGCTGGTGGAGCTGGCCATCGGGAGGTATCCCATTCCCCCACCTGATG 814
Query 812 CCAAGGAGCTGGAGGCCATCTTTGGCCAGCCCGTGGTCGACAGGGAAGAAGGAGAGCCTCACAGCATCTCCTCT 885
|||||||.||.|||||||.||||||||.|||.|||||.|||.|||.|||.|||||.||.||.||..|||||.|.
Sbjct 815 CCAAGGAACTAGAGGCCAGCTTTGGCCGGCCTGTGGTGGACGGGGCAGACGGAGAACCCCATAGTGTCTCCCCG 888
Query 886 TGGCCAGGGTCCCCCGGGCGCCCCAACAGCGGTTACGGGATGGACAGCCTGCCCGCCATGGCCATCTTCGAACT 959
.||||..||.||||.||.|||||||.|||.|||.|.|||||||||||||..||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 889 AGGCCCAGGCCCCCTGGACGCCCCATCAGTGGTCATGGGATGGACAGCCGACCGGCCATGGCCATCTTTGAGCT 962
Query 960 GCTGGACTATATTGTGAAAGAGCCGCCTCCTAAGCTGCCCAACGGTGTGTTCACCCCCGACTTCCAGGAGTTTG 1033
|||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||||..||||||||||.|.|.||||||||||||||||
Sbjct 963 GCTGGACTACATAGTGAACGAGCCACCTCCCAAGCTGCCCAGTGGTGTGTTCAGCTCAGACTTCCAGGAGTTTG 1036
Query 1034 TCAATAAATGCCTCATCAAAAACCCAACGGAGCGGGCGGACCTAAAGATGCTCACAAACCACGCCTTCATCAAG 1107
|.||||||||.|||||.||.||||||.|.|||||.||.||.||.|||.||||.|..||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGAATAAATGTCTCATTAAGAACCCAGCAGAGCGAGCAGATCTGAAGCTGCTGATGAACCACGCCTTCATCAAG 1110
Query 1108 CGGTCCGAGGTGAAAGAAGCGGATTTTGCCTGC----------------------------------------- 1140
||.||.||||.|.|.||||.|||.||.|||.||
Sbjct 1111 CGCTCTGAGGGGGAGGAAGTGGACTTCGCCGGCTGGCTGTGCAGAACCCTGCGGCTGAAGCAGCCCAGCACACC 1184
Query 1141 ---------------- 1140
Sbjct 1185 CACGCGGACTGCAGTG 1200