Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477823
- Subject:
- NM_172925.2
- Aligned Length:
- 1903
- Identities:
- 1656
- Gaps:
- 2
Alignment
Query 1 ATGGCACCCAAAAAGAAGATTGTCAAAAAGAACAAAGGAGATATCAATGAGATGACTATAATCGTAGAAGATAG 74
|||||||||||||||||||.|.||||.||||||||.|.|||.|||||.||||||||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1 ATGGCACCCAAAAAGAAGACTATCAAGAAGAACAAGGCAGAGATCAACGAGATGACCATCATTGTAGAAGACAG 74
Query 75 CCCCCTAAACAAACTGAATGCTTTGAATGGGCTCCTAGAGGGAGGCAATGGCCTTAGCTGCATTTCTTCTGAAC 148
||||||||.|||.|||||||||.|.||||||||.||.||||||.||||..||||||||||..|||||||.||||
Sbjct 75 CCCCCTAAGCAAGCTGAATGCTCTAAATGGGCTTCTGGAGGGAAGCAACAGCCTTAGCTGTGTTTCTTCCGAAC 148
Query 149 TAACAGATGCTTCTTATGGCCCCAACCTCTTGGAAGGTTTAAGTAAAATGCGGCAGGAGAACTTCTTATGTGAC 222
|||||||..||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||.|.||.||||.|||..||||||||
Sbjct 149 TAACAGACACTTCTTATGGCCCCAACCTCCTCGAAGGTTTAAGTAAAATGAGACAAGAGAGCTTTCTATGTGAC 222
Query 223 TTAGTCATTGGTACCAAAACCAAATCCTTTGATGTTCATAAGTCAGTCATGGCTTCATGCAGTGAGTATTTTTA 296
||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 223 TTGGTCATCGGTACCAAAACCAAGTCCTTTGATGTCCATAAGTCAGTGATGGCTTCATGCAGCGAGTACTTTTA 296
Query 297 CAACATCCTAAAAAAAGACCCGTCAATTCAGAGGGTGGATCTCAATGATATCTCACCACTAGGCCTGGCCACTG 370
.||||||||.|||||.||.|||||.|...|.|||||.||.||||||||||||.|.||..||||.||.|||||.|
Sbjct 297 TAACATCCTTAAAAACGATCCGTCCACGAAAAGGGTAGACCTCAATGATATCGCCCCTTTAGGGCTAGCCACAG 370
Query 371 TCATTGCATATGCCTACACTGGAAAGCTCACTCTCTCCTTGTATACAATAGGAAGCATTATTTCTGCTGCTGTT 444
|.||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 371 TGATCGCGTATGCTTACACGGGAAAGCTGACCCTTTCTTTATACACAATAGGAAGCATCATTTCTGCTGCTGTG 444
Query 445 TATCTTCAGATCCATACTCTTATAAAGATGTGCAGTGATTTTCTGATACGGGAGATGAGTGTTGAGAATTGCAT 518
||.||.||||||||.||.|||.|||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 445 TACCTCCAGATCCACACCCTTGTAAAGATGTGCAGCGATTTTCTGATCCGAGAGATCAGTGTGGAGAACTGCAT 518
Query 519 GTATGTTGTTAATATTGCTGAAACATACTCCCTAAAAAATGCAAAAGCAGCAGCCCAGAAATTTATTCGGGATA 592
|||.||.|||||.||||||||.||.|||..|.|.|||||.|||||.|||.|||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 519 GTACGTGGTTAACATTGCTGAGACCTACAGCTTGAAAAACGCAAAGGCAACAGCCCAGAAATTCATCCGGGATA 592
Query 593 ACTTCCTTGAATTTGCAGAATCGGATCAGTTTATGAAACTTACATTTGAACAAATTAATGAACTTCTTATAGAT 666
|||||.|.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||..|||||
Sbjct 593 ACTTCATCGAATTTGCAGAATCCGAACAATTTATGAAGCTTACGTTTGAACAGATTAACGAGCTTCTCGTAGAT 666
Query 667 GATGACTTACAGTTGCCTTCTGAGATAGTAGCATTCCAGATTGCAATGAAATGGTTAGAATTTGACCAAAAGAG 740
||.||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 GACGACTTACAATTGCCTTCTGAGCTTGTAGCATTCCAGATCGCAATGAAATGGTTAGAATTCGACCAAAAGAG 740
Query 741 AGTAAAATACGCTGCAGATCTTTTGAGCAATATTCGCTTTGGTACCATCTCTGCACAAGACCTGGTCAATTATG 814
|||.||..|.||.|||||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGTGAAGCATGCGGCAGATCTTCTAAGCAACATTCGCTTTGGTACCATCTCTGCACAAGACCTGGTCAATTATG 814
Query 815 TTCAATCCGTACCAAGAATGATGCAAGATGCTGATTGTCACAGACTTCTCGTAGATGCTATGAACTACCACTTG 888
|||||.|||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|.|||.||.||.|||||.||||||||.|||||.
Sbjct 815 TTCAAACCGTACCGAGGATGATGCAAGACGCTGATTGTCATAAACTGCTTGTGGATGCCATGAACTATCACTTA 888
Query 889 CTTCCATATCATCAAAACACATTGCAATCTAGGCGAACAAGAATCCGAGGTGGCTGCCGAGTCCTCGTCACTGT 962
||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||..||||.|||||||||||.||..|||||||
Sbjct 889 CTCCCTTATCATCAAAACACACTGCAATCTAGGCGCACAAGAATTAGAGGCGGCTGCCGAGTTCTGATCACTGT 962
Query 963 TGGGGGACGCCCAGGCCTTACTGAGAAGTCCCTTAGCAGAGACATCCTGTATAGAGACCCTGAAAATGGATGGA 1036
||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGGGGGACGCCCCGGCCTGACTGAGAAGTCCCTTAGTAGAGACATTTTATATAGAGACCCTGAAAATGGATGGA 1036
Query 1037 GCAAGCTTACGGAAATGCCAGCCAAAAGTTTTAATCAGTGTGTGGCTGTGATGGATGGATTTCTTTATGTAGCC 1110
||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1037 GCAAGCTTACAGAAATGCCAGCCAAGAGTTTTAATCAGTGTGTGGCTGTGATGGATGGATTCCTTTATGTAGCA 1110
Query 1111 GGTGGTGAAGACCAGAATGATGCAAGAAATCAAGCCAAGCATGCAGTCAGCAATTTCTGCAGATACGATCCCCG 1184
||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1111 GGTGGTGAGGACCAGAATGACGCCAGAAACCAAGCCAAGCACGCAGTCAGCAATTTCTGCAGGTACGATCCCCG 1184
Query 1185 CTTCAACACCTGGATACACCTGGCCAGCATGAACCAGAAGCGCACGCACTTCAGCCTGAGCGTGTTCAACGGGC 1258
|||||||||||||||.|||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTTCAACACCTGGATTCACTTGGGCAGCATGAACCAGAAGCGCACGCACTTCAGCCTGAGCGTGTTCAACGGGC 1258
Query 1259 TCGTGTACGCCGCGGGCGGCCGCAACGCAGAAGGAAGCCTGGCCTCGCTGGAGTGCTACGTGCCCTCCACCAAT 1332
|..|||||||.|.|||||||||.|||.|.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1259 TGCTGTACGCGGTGGGCGGCCGTAACTCCGAGGGCAGCCTGGCTTCGCTGGAGTGCTACGTGCCCTCCACCAAC 1332
Query 1333 CAGTGGCAGCCGAAGACGCCCCTGGAGGTGGCGCGCTGCTGCCACGCTAGCGCGGTCGCCGACGGCCGCGTGCT 1406
||.||||||||.||..||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||.|
Sbjct 1333 CAATGGCAGCCCAAAGCGCCGCTCGAGGTGGCGCGCTGCTGCCACGCCAGCGCCGTGGCCGACGGCCGCGTGAT 1406
Query 1407 GGTGACCGGAGGCTACATCGCCAACGCCTACTCGCGCTCTGTGTGCGCCTACGACCCGGCCAGCGACTCGTGGC 1480
.||||||||.||||||||||.||..||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||...||||.||||||
Sbjct 1407 CGTGACCGGCGGCTACATCGGCAGTGCGTACTCGCGCTCCGTGTGCGCCTACGACCCCGCGCTCGACGCGTGGC 1480
Query 1481 AGGAGCTGCCGAACCTCAGCACACCCCGGGGCTGGCACTGCGCGGTCACGCTGAGCGACAGAGTGTACGTGATG 1554
||||||||||..|.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||..|||||.|||||||..|||||||||||
Sbjct 1481 AGGAGCTGCCCCAGCTGAGCACGCCCCGAGGCTGGCACTGCGCGGTGGCGCTGGGCGACAGGCTGTACGTGATG 1554
Query 1555 GGCGGCAGCCAGCTGGGGCCGCGCGGGGAGCGCGTGGACGTGCTCACCGTGGAGTGCTACAGCCCCGCGACCG- 1627
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||.|||.||||| |.||
Sbjct 1555 GGGGGCAGCCAGCTGGGGCCGCGCGGGGAGCGCGTGGACGTGCTCACGGTGGAGAGCTTCAGTCCCGC-AGCGC 1627
Query 1628 GCCAGTGGAGCTACGCGGCGCCGCTGCAGGTGGGAGTGAGCACTGCGGGCGTCTCGGCGCTGCATGGCCGCGCC 1701
||||||||||||.||.|||||||||||..|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1628 GCCAGTGGAGCTTCGTGGCGCCGCTGCCCGTGGGCGTGAGCACGGCGGGTGTCTCGGCGCTGCACGGGCGAGCC 1701
Query 1702 TACCTGGTGGGGGGCTGGAACGAGGGCGAGAAGAAGTACAAGAAGTGCATCCAGTGCTTCAGCCCCGAGCTCAA 1775
||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1702 TACCTGCTGGGCGGCTGGAACGAGGGCGAGAAGAAGTACAAGAAATGCATCCAGTGCTTCAACCCCGAGCTCAA 1775
Query 1776 CGAGTGGACGGAGGACGACGAGCTACCCGAGGCCACTGTCGGCGTGTCCTGCTGCACCCTCTCGATGCCCAACA 1849
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||..|.||||||||||
Sbjct 1776 CGAGTGGACGGAGGACGACGAGCTGCCCGAGGCCACCGTGGGCGTGTCCTGCTGCACGCTGGCCATGCCCAACA 1849
Query 1850 ACGTGACTCGGGAATCCCGGGCCAGTTCGGTATCTTCTGTGCCAGTCAGTATC 1902
.||||.|.||.||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1850 GCGTGTCCCGAGAGTCACGGGCCAGCTCGGTGTCCTCCGTGCCGGTCAGTATC 1902