Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477826
- Subject:
- XM_017019743.1
- Aligned Length:
- 1671
- Identities:
- 1271
- Gaps:
- 399
Alignment
Query 1 ATGGACGACCTCGACGCCCTGCTGGCGGACTTGGAGTCTACCACCTCCCACATCTCCAAACGGCCTGTGTTCTT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GTCGGAGGAGACCCCCTACTCATACCCAACTGGAAACCACACATACCAGGAGATTGCCGTGCCACCCCCCGTCC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CCCCACCCCCGTCCAGCGAGGCCCTCAATGGCACAATCCTTGACCCCTTAGACCAGTGGCAGCCCAGCGGCTCC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CGATTCATCCACCAGCAGCCTCAGTCCTCATCACCTGTGTACGGCTCCAGTGCCAAAACTTCCAGTGTCTCCAA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CCCTCAGGACAGTGTTGGCTCTCCGTGCTCCCGAGTGGGTGAGGAGGAGCACGTCTACAGCTTCCCCAACAAGC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AGAAATCAGCTGAGCCTTCACCCACCGTAATGAGCACGTCCCTGGGCAGCAACCTTTCTGAACTCGACCGCCTG 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------ATGAGCACGTCCCTGGGCAGCAACCTTTCTGAACTCGACCGCCTG 45
Query 445 CTGCTGGAACTGAACGCTGTACAGCATAACCCGCCAGGCTTCCCTGCAGATGAGGCCAACTCAAGCCCCCCGCT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 46 CTGCTGGAACTGAACGCTGTACAGCATAACCCGCCAGGCTTCCCTGCAGATGAGGCCAACTCAAGCCCCCCGCT 119
Query 519 TCCTGGGGCCCTGAGCCCCCTCTATGGTGTCCCAGAGACTAACAGCCCCTTGGGAGGCAAAGCTGGGCCCCTGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 TCCTGGGGCCCTGAGCCCCCTCTATGGTGTCCCAGAGACTAACAGCCCCTTGGGAGGCAAAGCTGGGCCCCTGA 193
Query 593 CGAAAGAGAAGCCTAAGCGGAATGGGGGCCGGGGCCTGGAGGACGTGCGGCCCAGTGTGGAGAGTCTCTTGGAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 194 CGAAAGAGAAGCCTAAGCGGAATGGGGGCCGGGGCCTGGAGGACGTGCGGCCCAGTGTGGAGAGTCTCTTGGAT 267
Query 667 GAACTGGAGAGCTCCGTGCCCAGCCCCGTCCCTGCCATCACTGTGAACCAGGGCGAGATGAGCAGCCCGCAGCG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 268 GAACTGGAGAGCTCCGTGCCCAGCCCCGTCCCTGCCATCACTGTGAACCAGGGCGAGATGAGCAGCCCGCAGCG 341
Query 741 CGTCACCTCCACCCAACAGCAGACACGCATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGCTGGACGAGCTGATGGCTT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 342 CGTCACCTCCACCCAACAGCAGACACGCATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGCTGGACGAGCTGATGGCTT 415
Query 815 CGCTGTCGGATTTCAAGTTCATGGCCCAGGGGAAGACAGGGAGCAGCTCACCCCCTGGGGGGCCCCCGAAGCCC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 416 CGCTGTCGGATTTCAAGTTCATGGCCCAGGGGAAGACAGGGAGCAGCTCACCCCCTGGGGGGCCCCCGAAGCCC 489
Query 889 GGGAGCCAGCTGGACAGCATGCTGGGGAGCCTGCAGTCTGACCTGAACAAGCTGGGGGTCGCCACAGTCGCCAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 490 GGGAGCCAGCTGGACAGCATGCTGGGGAGCCTGCAGTCTGACCTGAACAAGCTGGGGGTCGCCACAGTCGCCAA 563
Query 963 AGGAGTCTGCGGGGCCTGCAAGAAGCCCATCGCCGGGCAGGTTGTGACCGCCATGGGGAAGACGTGGCACCCCG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 564 AGGAGTCTGCGGGGCCTGCAAGAAGCCCATCGCCGGGCAGGTTGTGACCGCCATGGGGAAGACGTGGCACCCCG 637
Query 1037 AGCACTTCGTCTGCACCCACTGCCAGGAGGAGATCGGATCCCGGAACTTCTTCGAGCGGGATGGACAGCCCTAC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 638 AGCACTTCGTCTGCACCCACTGCCAGGAGGAGATCGGATCCCGGAACTTCTTCGAGCGGGATGGACAGCCCTAC 711
Query 1111 TGTGAAAAGGACTACCACAACCTCTTCTCCCCGCGCTGCTACTACTGCAACGGCCCCATCCTGGATAAAGTGGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 712 TGTGAAAAGGACTACCACAACCTCTTCTCCCCGCGCTGCTACTACTGCAACGGCCCCATCCTGGATAAAGTGGT 785
Query 1185 GACAGCCCTTGACCGGACGTGGCACCCTGAACACTTCTTCTGTGCACAGTGTGGAGCCTTCTTTGGTCCCGAAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 786 GACAGCCCTTGACCGGACGTGGCACCCTGAACACTTCTTCTGTGCACAGTGTGGAGCCTTCTTTGGTCCCGAAG 859
Query 1259 GGTTCCACGAGAAGGACGGCAAGGCCTACTGTCGCAAGGACTACTTCGACATGTTCGCACCCAAGTGTGGCGGC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 860 GGTTCCACGAGAAGGACGGCAAGGCCTACTGTCGCAAGGACTACTTCGACATGTTCGCACCCAAGTGTGGCGGC 933
Query 1333 TGCGCCCGGGCCATCCTGGAGAACTATATCTCAGCCCTCAACACGCTGTGGCATCCTGAGTGCTTTGTGTGCCG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 934 TGCGCCCGGGCCATCCTGGAGAACTATATCTCAGCCCTCAACACGCTGTGGCATCCTGAGTGCTTTGTGTGCCG 1007
Query 1407 GGAATGCTTCACGCCATTCGTGAACGGCAGCTTCTTCGAGCACGACGGGCAGCCCTACTGTGAGGTGCACTACC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008 GGAATGCTTCACGCCATTCGTGAACGGCAGCTTCTTCGAGCACGACGGGCAGCCCTACTGTGAGGTGCACTACC 1081
Query 1481 ACGAGCGGCGCGGCTCGCTGTGTTCTGGCTGCCAGAAGCCCATCACCGGCCGCTGCATCACCGCCATGGCCAAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082 ACGAGCGGCGCGGCTCGCTGTGTTCTGGCTGCCAGAAGCCCATCACCGGCCGCTGCATCACCGCCATGGCCAAG 1155
Query 1555 AAGTTCCACCCCGAGCACTTCGTCTGTGCCTTCTGCCTCAAGCAGCTCAACAAGGGCACCTTCAAGGAGCAGAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1156 AAGTTCCACCCCGAGCACTTCGTCTGTGCCTTCTGCCTCAAGCAGCTCAACAAGGGCACCTTCAAGGAGCAGAA 1229
Query 1629 CGACAAGCCTTACTGTCAGAACTGCTTCCTCAGGCTCTTCTGC 1671
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1230 CGACAAGCCTTACTGTCAGAACTGCTTCCTCAAGCTCTTCTGC 1272