Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477827
• Subject: NM_021542.4
• Aligned Length: 1519
• Identities: 1282
• Gaps: 35

Alignment

Query    1  ATGGTGGACCGGGGCCCTCTGCTCACCTCGGCCATCATCTTCTACCTGGCCATCGGGGCGGCGATCTTCGAAGT  74
            ||||||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTGGACCGGGGTCCTTTACTCACCTCGGCCATCATATTCTACCTGGCCATCGGGGCAGCGATCTTCGAAGT  74

Query   75  GCTGGAGGAGCCACACTGGAAGGAGGCCAAGAAAAACTACTACACACAGAAGCTGCATCTGCTCAAGGAGTTCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  GCTGGAGGAGCCACACTGGAAGGAGGCCAAGAAAAACTACTATACACAGAAACTGCATCTACTCAAGGAGTTTC  148

Query  149  CGTGCCTGGGTCAGGAGGGCCTGGACAAGATCCTAGAGGTGGTATCTGATGCTGCAGGA-CAGGGTGTGGCCAT  221
            ||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct  149  CGTGCCTGAGTCAGGAGGGACTGGACAAGATCCTACAGGTGGTGTCTGATGCTGC-GGATCAGGGTGTGGCCAT  221

Query  222  CACAGGGAACCAGACCTTCAACAACTGGAACTGGCCCAATGCAATGATTTTTGCAGCGACCGTCATTACCACCA  295
            |||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||
Sbjct  222  CACCGGGAACCAGACTTTCAACAACTGGAACTGGCCCAATGCAATGATTTTTGCTGCCACAGTCATCACCACCA  295

Query  296  TTGGATATGGCAATGTGGCTCCCAAGACCCCCGCCGGTCGCCTCTTCTGTGTTTTCTATGGTCTCTTCGGGGTG  369
            |.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct  296  TCGGTTATGGCAATGTGGCTCCCAAGACCCCAGCTGGGCGCCTCTTCTGTGTCTTCTACGGCCTCTTCGGGGTG  369

Query  370  CCGCTCTGCCTGACGTGGATCAGTGCCCTGGGCAAGTTCTTCGGGGGACGTGCCAAGAGACTAGGGCAGTTCCT  443
            |||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.||.|||||.||
Sbjct  370  CCGCTGTGCCTGACATGGATCAGTGCCCTGGGCAAGTTCTTCGGGGGACGTGCAAAGAGGTTGGGCCAGTTTCT  443

Query  444  TACCAAGAGAGGTGTGAGTCTGCGGAAGGCGCAGATCACGTGCACAGTCATCTTCATCGTGTGGGGCGTCCTAG  517
            |||||.||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  444  TACCAGGAGAGGAGTGAGCCTGAGGAAGGCTCAGATCACGTGTACAGCCATCTTCATCGTGTGGGGTGTCCTGG  517

Query  518  TCCACCTGGTGATCCCACCCTTCGTATTCATGGTGACTGAGGGGTGGAACTACATCGAGGGCCTCTACTACTCC  591
            ||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|..|||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  518  TCCATCTGGTGATCCCGCCCTTTGTGTTCATGGTGACAGAAGAATGGAACTACATTGAGGGCCTCTACTATTCC  591

Query  592  TTCATCACCATCTCCACCATCGGCTTCGGTGACTTTGTGGCCGGTGTGAACCCCAGCGCCAACTACCACGCCCT  665
            ||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  592  TTCATCACCATCTCCACCATTGGCTTTGGGGACTTTGTGGCCGGTGTGAACCCCAGTGCCAACTACCACGCCCT  665

Query  666  GTACCGCTACTTCGTGGAGCTCTGGATCTACTTGGGGCTGGCCTGGCTGTCCCTTTTTGTCAACTGGAAGGTGA  739
            .|||||.|||||.||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  666  ATACCGATACTTTGTGGAGCTTTGGATCTACCTGGGGCTGGCTTGGCTGTCCCTCTTTGTCAACTGGAAGGTGA  739

Query  740  GCATGTTTGTGGAAGTCCACAAAGCCATTAAGAAGCGGCGGCGGCGACGGAAGGAGTCCTTTGAGAGCTCCCCA  813
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  740  GCATGTTTGTGGAAGTACACAAAGCCATTAAAAAGAGGCGGCGGCGGCGCAAGGAATCCTTTGAGAGCTCTCCA  813

Query  814  CACTCCCGGAAGGCCCTGCAGGTGAAGGGGAGCACAGCCTCCAAGGACGTCAACATCTTCAGCTTTCTTTCCAA  887
            |||||||||||||||||.|||.||...||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  814  CACTCCCGGAAGGCCCTACAGATGGCTGGAAGTACAGCATCCAAGGACGTCAACATCTTCAGCTTCCTATCCAA  887

Query  888  GAAGGAAGAGACCTACAACGACCTCATCAAGCAGATCGGGAAGAAGGCCATGAAGACAAGCGGGGGTGGGGAGA  961
            .|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct  888  AAAGGAGGAGACCTACAATGACCTCATCAAACAGATTGGGAAGAAGGCAATGAAAACAAGTGGGGGAGGGGAGA  961

Query  962  CGGGCCCGGGCCC------AGGGCTGGGGCCTCAAGGCGGTGGGCT-CCCAGCACTGCCCCCTTCCCTGGTGCC  1028
            .||.|||.||.||      .||||||||.||||||||.|.|.|.|| ||||.|| |.||..|.|||||||..||
Sbjct  962  GGGTCCCAGGACCTGGACACGGGCTGGGACCTCAAGGGGATAGACTACCCACCA-TCCCTGCATCCCTGGCACC  1034

Query 1029  CCTGGTAGTCTACTCCAAGAACCGGGTGCCCACCTTGGAAGAGGTGTCACAGACACTGAGGAGCAAAGGCCACG  1102
            ..||||.|||||.||||||||.||||||||||.||||||||||||.||.|||||.||.|..|.|||.||.||.|
Sbjct 1035  TTTGGTGGTCTATTCCAAGAATCGGGTGCCCAGCTTGGAAGAGGTATCTCAGACTCTAAAAAACAAGGGACATG  1108

Query 1103  TATCAAGGTCCCCAGATGAGGAGGCTGTGGCACGGGCCCCTGAAGACAGCTCCCCTGCCCCCGAGGTGTTCATG  1176
            |.||||||.|.|..|.|||||||||||.|||||.||||||..|.||.||.|.||...||.|.||.|||||.||.
Sbjct 1109  TGTCAAGGCCACTTGGTGAGGAGGCTGGGGCACAGGCCCCCAAGGATAGTTACCAAACCTCTGAAGTGTTTATT  1182

Query 1177  AACCAGCTGGACCGCATCAGCGAGGAATGCGAGCCATGGGACGCCCAGGACTACCACCCACTCATCTTCCAGGA  1250
            |||||.||||||||.|||||.|||||..|.|||||.|||||.||||.||||||||||||.|||||||||||..|
Sbjct 1183  AACCAACTGGACCGTATCAGTGAGGAGGGAGAGCCGTGGGAAGCCCTGGACTACCACCCGCTCATCTTCCAAAA  1256

Query 1251  CGCCAGCATCACCTTCGTGAACACG--GAGGCTGGCCTCTCAGACGAGGAGACCTCCAAGTCCTCGCTAGAGGA  1322
            .||||.|||.|||||  ||||.|.|  ||..|.|||||||||||||||||||||||.|||||.||..|.|||||
Sbjct 1257  TGCCAACATTACCTT--TGAAAATGAAGAAACCGGCCTCTCAGACGAGGAGACCTCTAAGTCTTCTGTGGAGGA  1328

Query 1323  CAACTTG---GCAGGGGAGGAGAGCCCCCAGCAGGG------GGCTGAAGCCAAGGCGCCCCTG---AACATGG  1384
            ||||.||   .||..||||.||   ||..|.|||||      |||||      ||||.|||.||   |.||.||
Sbjct 1329  CAACCTGACCTCAAAGGAGCAG---CCTGAACAGGGACCCATGGCTG------AGGCACCCTTGAGCAGCACGG  1393

Query 1385  GCGAGTTCCCCTCCTCCTCCGAGTCCACCTTCACCAGCACTGAGTCTGAGCTCTCTGTGCCTTACGAACAGCTG  1458
            |.||.|||||.||.|||...||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1394  GTGAATTCCCTTCATCCGATGAGTCCACCTTCACCAGCACCGAGTCAGAGCTCTCCGTGCCTTACGAGCAGCTG  1467

Query 1459  ATGAATGAGTACAACAAGGCTAACAGCCCCAAGGGCACA  1497
            |||||.||.|||||||||||..|.|.|||||.||||||.
Sbjct 1468  ATGAACGAATACAACAAGGCAGATAACCCCAGGGGCACG  1506