Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477881
• Subject: XM_006499591.3
• Aligned Length: 978
• Identities: 886
• Gaps: 0

Alignment

Query   1  ATGGCTTCAAAGGTCTCCTGTTTGTATGTTTTGACAGTTGTGTGCTGGGCCAGCGCTCTCTGGTACTTGAGTAT  74
           ||||||||||||||||||||..|.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct   1  ATGGCTTCAAAGGTCTCCTGCCTCTATGTATTGACCGTTGTGTGCTGGGCCAGCGCTCTCTGGTACTTGAGCAT  74

Query  75  AACTCGCCCTACTTCTTCTTACACTGGCTCCAAACCATTCAGCCACCTAACAGTTGCCAGGAAAAACTTCACCT  148
           |||..|.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  AACCAGACCTACTTCATCCTACACTGGCTCCAAGCCGTTCAGTCACCTAACAGTTGCCAGGAAAAACTTCACCT  148

Query 149  TTGGCAACATAAGAACTCGACCTATCAACCCACATTCTTTTGAATTTCTTATCAACGAGCCCAATAAATGTGAG  222
           |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.|||
Sbjct 149  TTGGCAACATAAGAACTCGACCTATAAACCCACATTCTTTTGAATTTCTGATAAATGAGCCCAACAAGTGCGAG  222

Query 223  AAAAACATTCCTTTTCTTGTTATCCTCATCAGCACCACTCACAAGGAATTTGATGCCCGTCAGGCAATCAGAGA  296
           |||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|.||
Sbjct 223  AAAAACATTCCTTTTCTCGTGATCCTCATTAGCACCACACACAAGGAATTTGATGCCCGCCAGGCAATCCGGGA  296

Query 297  GACGTGGGGGGATGAGAACAACTTTAAGGGGATCAAGATAGCCACCCTGTTCCTCCTGGGCAAGAATGCTGATC  370
           |||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 297  GACATGGGGGGATGAAAACAACTTCAAAGGGATCAAGATAGCCACACTTTTCCTCCTGGGCAAAAATGCTGATC  370

Query 371  CTGTTCTCAATCAGATGGTGGAGCAAGAGAGCCAAATCTTCCATGATATCATCGTGGAGGACTTTATTGACTCC  444
           |||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 371  CTGTTCTGAACCAGATGGTGGAGCAAGAGAGCCAGATCTTCCATGACATCATCGTGGAGGACTTCATTGACTCC  444

Query 445  TACCATAACCTTACCCTCAAAACATTAATGGGGATGAGATGGGTGGCCACTTTTTGTTCAAAAGCCAAGTATGT  518
           |||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 445  TACCACAATCTCACCCTCAAAACCTTAATGGGGATGAGATGGGTTGCCACTTTCTGTTCAAAAGCCAAGTACGT  518

Query 519  CATGAAAACAGACAGCGACATTTTTGTAAACATGGACAATCTTATTTATAAATTACTGAAACCCTCCACCAAGC  592
           |||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||
Sbjct 519  CATGAAAACCGACAGTGACATTTTTGTGAACATGGACAACCTTATTTATAAACTCCTGAAACCCTCTACCAAGC  592

Query 593  CACGAAGAAGGTATTTTACTGGCTATGTCATTAATGGAGGACCGATTCGGGATGTCCGCAGTAAGTGGTATATG  666
           ||.|||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.||..||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  CAAGAAGAAGGTATTTCACTGGTTACGTCATCAACGGCGGGCCAATCAGGGATGTCCGCAGTAAGTGGTATATG  666

Query 667  CCCAGGGATTTGTACCCAGACAGTAACTACCCACCTTTCTGTTCGGGGACTGGCTACATCTTTTCAGCCGATGT  740
           ||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 667  CCTAGAGATTTGTACCCTGACAGCAACTACCCACCGTTCTGTTCAGGGACTGGCTATATCTTTTCCGCTGATGT  740

Query 741  AGCTGAACTCATTTACAAGACCTCACTCCACACAAGGCTGCTTCACCTTGAAGACGTATATGTGGGACTGTGTC  814
           .|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 741  GGCTGAACTCATTTACAAGACCTCGCTCCACACCAGGCTGCTTCATCTTGAAGATGTGTACGTGGGACTGTGTC  814

Query 815  TTCGAAAGCTGGGCATACATCCTTTCCAGAACAGTGGCTTCAATCACTGGAAAATGGCCTACAGTTTGTGTAGG  888
           ||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 815  TTCGAAAGCTTGGCATCCATCCTTTCCAGAATAGTGGCTTCAATCACTGGAAAATGGCCTACAGTTTGTGTCGG  888

Query 889  TATCGCCGAGTTATCACTGTGCATCAGATCTCTCCAGAAGAAATGCACAGAATCTGGAATGACATGTCAAGCAA  962
           ||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889  TACCGCCGCGTCATCACTGTCCACCAGATCTCTCCAGAAGAAATGCACAGAATCTGGAATGACATGTCAAGCAA  962

Query 963  GAAACATCTCAGATGT  978
           |||.|||||.||||||
Sbjct 963  GAAGCATCTGAGATGT  978