Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478116
• Subject: NM_153081.3
• Aligned Length: 1420
• Identities: 1135
• Gaps: 86

Alignment

Query    1  ATGCCAGCTCCCCAGCGGAAGCACAGGCGTGGAGGCTTCTCTCACAGATGTTTCCCCACCCCGCAGACGGCGAT  74
                                                                                    ||
Sbjct    1  ------------------------------------------------------------------------AT  2

Query   75  GACCCCCCAGCCCGCCGGACCCCCGGATGGGGGCTGGGGCTGGGTGGTGGCGGCCGCAGCCTTCGCGATAAACG  148
            |||||||.||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.||||
Sbjct    3  GACCCCCAAGCCGGCCGGACCCCCGGACGGGGGCTGGGGCTGGGTGGTGGCGGCCGCAGCATTCGCCGTGAACG  76

Query  149  GGCTGTCCTACGGGCTGCTGCGCTCGCTGGGCCTTGCCTTCCCTGACCTTGCCGAGCACTTTGACCGAAGCGCC  222
            ||||.|||||||||||..|.|||||.||||||||||||.||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct   77  GGCTCTCCTACGGGCTCTTACGCTCCCTGGGCCTTGCCCTCCCCGACCTCGCGGAGCACTTTGAACGAAGCGCC  150

Query  223  CAGGACACTGCGTGGATCAGCGCCCTGGCCCTGGCCGTGCAGCAGGCAGCCAGCCCTGTGGGCAGCGCCCTGAG  296
            |||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  151  CAGGACACTGCGTGGGTCAGCGCCCTGGCCTTGGCCGTGCAGCAGGCAGCCAGCCCAGTGGGCAGCGCCCTGAG  224

Query  297  CACGCGCTGGGGGGCCCGCCCCGTGGTGATGGTTGGGGGCGTCCTCGCCTCGCTGGGCTTCGTCTTCTCGGCTT  370
            |||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  225  CACTCGCTGGGGGGCACGCCCCGTGGTGATGGTTGGGGGAGTCCTAACCTCGCTTGGCTTGGTCTTCTCGGCTT  298

Query  371  TCGCC---AGCGATCTGCTGCATCTCTACCTCGGCCTGGGCCTCCTCGCTGGCTTTGGTTGGGCCCTGGTGTTC  441
            |||||   |||   ||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.
Sbjct  299  TCGCCCGAAGC---CTCCTGCACCTCTACCTCGGCCTGGGCCTCCTCGCTGGCTCTGGCTGGGCCCTGGTGTTT  369

Query  442  GCCCCCGCCCTAGGCACCCTCTCGCGTTACTTCTCCCGCCGTCGAGTCTTGGCGGTGGGGCTGGCGCTCACCGG  515
            |||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct  370  GCCCCAGCCCTGGGTACCCTCTCTCGGTACTTCTCCCGCCGTCGGGTCTTGGCGGTAGGGTTGGCGCTCACCGG  443

Query  516  CAACGGGGCCTCCTCGCTGCTCCTGGCGCCCGCCTTGCAGCTTCTTCTCGATACTTTCGGCTGGCGGGGCGCTC  589
            .||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||.|.||.||.||||||||||||||||||||.||..
Sbjct  444  TAATGGGGCATCCTCGCTGCTCCTGGCACCTGCCTTGCAGTTCCTCCTTGATACTTTCGGCTGGCGGGGTGCCT  517

Query  590  TGCTCCTCCTCGGCGCGATCACCCTCCACCTCACCCCCTGTGGCGCCCTGCTGCTACCCCTGGTCCTTCCTGGA  663
            ||||||||||.|||||..|||||||.||||||||.||||||||||||.||||...|||..|.|..||..||||.
Sbjct  518  TGCTCCTCCTTGGCGCTGTCACCCTTCACCTCACACCCTGTGGCGCCTTGCTAAGACCTTTAGCTCTCTCTGGT  591

Query  664  GACCCCCCAGCCCCACCGCGTAGTCCCCTAGCTGCCCTCGGCCTGAGTCTGTTCACACGCCGGGCCTTCTCAAT  737
            |||||.|..||||||||.||.|..||||||||||||||.|||||..|||||||||..|||||||||||.|||.|
Sbjct  592  GACCCGCTGGCCCCACCTCGCACCCCCCTAGCTGCCCTTGGCCTAGGTCTGTTCAAGCGCCGGGCCTTTTCAGT  665

Query  738  CTTTGCTCTAGGCACAGCCCTGGTTGGGGGCGGGTACTTCGTTCCTTACGTGCACTTGGCTCCCCACGCTTTAG  811
            |||||||.|.|||||.|||.||.|.||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||.|||.||.|||||||
Sbjct  666  CTTTGCTTTGGGCACCGCCTTGATCGGGGGCGGATACTTCGTCCCCTACGTTCATTTGGGTCCGCATGCTTTAG  739

Query  812  ACCGGGGCCTGGGGGGATACGGAGCAGCGCTGGTGGTGGCCGTGGCTGCGATGGGGGATGCGGGCGCCCGGCTG  885
            |.|..|||.||||.||.||.||.||||||.|.||||||||.||.|||||..||||.|||||..|.|||||..||
Sbjct  740  ATCAAGGCATGGGTGGTTATGGGGCAGCGTTAGTGGTGGCTGTCGCTGCAGTGGGAGATGCCTGTGCCCGATTG  813

Query  886  GTCTGCGGGTGGCTGGCAGACCAAGGCTGGGTGCCCCTCCCGCGGCTGCTGGCCGTATTCGGGGCTCTGACTGG  959
            |.|.||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||.||||..||.||.|||.||||||||||
Sbjct  814  GCCAGCGGATGGCTGGCAGACCAGGGCTGGGTGCCCCTTCCGAGGCTTCTGGTGGTGTTTGGGTCTCTGACTGG  887

Query  960  GCTGGGGCTGTGGGTGGTGGGGCTGGTGCCCGTGGTGGGCGGC-GAAGAGAGCTGGGGGGGTCCCCTGCTGGCC  1032
            |.|.|||.|....|...||||.||.||||||...||||| |.| ||.|||.|.|||||||.|||.|||||||||
Sbjct  888  GTTAGGGGTACTAGCAATGGGACTAGTGCCCACTGTGGG-GACAGAGGAGGGTTGGGGGGCTCCTCTGCTGGCC  960

Query 1033  GCGGCTGTGGCCTATGGGCTGAGCGCGGGGAGTTACGCCCCGCTGGTTTTCGGTGTACTCCCCGGGCTGGTGGG  1106
            ||.||||.||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  961  GCTGCTGGGGCCTATGGGCTGAGCGCTGGGAGTTATGCCCCACTGGTTTTCGGTGTGCTCCCGGGGCTGGTGGG  1034

Query 1107  CGTCGGAGGTGTGGTGCAGGCCACAGGGCTGGTGATGATGCTGATGAGCCTCGGGGGGCTCCTGGGCCCTCCCC  1180
            |.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1035  CATTGGAGGTGTGGTGCAGGCCACAGGGCTGGTGATGATGCTGATGAGCCTCGGGGGACTCCTGGGCCCTCCTC  1108

Query 1181  TGTCAGGCTTCCTAAGGGATGAGACAGGAGACTTCACCGCCTCTTTCCTCCTGTCTGGTTCTTTGATCCTCTCC  1254
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||..|||||||||||..|||...|.|||||.||||||||.
Sbjct 1109  TGTCAGGCTTCCTAAGGGATAAGACAGGAGACTTCAGTGCCTCTTTCCTGGTGTGCAGCTCTTTCATCCTCTCT  1182

Query 1255  GGCAGCTTCATCTACATAGGGTTGCCCAGGGCGCTGCCCTCCTGTGGTCCAGCCTCCCCTCCAGCCACGCCTCC  1328
            |||||.|||||||||||.|||.|||||||.||.||.||||||||..||||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1183  GGCAGTTTCATCTACATGGGGCTGCCCAGAGCCCTCCCCTCCTGCCGTCCAGCCTCACCTCCAGCAACCCCTCC  1256

Query 1329  CCCAGAGACGGGGGAGCTGCTTCCCGCTCCCCAGGCAGTCT---TGCTGTCCCCAGGAGGCCCTGGCTCCACTC  1399
            .|||||||..|||||||||||.||.|.|||.||   |||||   ||||.|||.||||.||..|||||||||..|
Sbjct 1257  ACCAGAGAGAGGGGAGCTGCTCCCAGTTCCACA---AGTCTCCCTGCTTTCCGCAGGGGGTACTGGCTCCATCC  1327

Query 1400  TGGACACCACTTGT  1413
            .|||.|||||||||
Sbjct 1328  GGGATACCACTTGT  1341