Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478244
• Subject: XM_017316811.1
• Aligned Length: 1315
• Identities: 937
• Gaps: 281

Alignment

Query    1  ---------------ATGGAGAAAAAGAAAATG----GTAACTC-----AGGGTAACCAGGAGCCGACAACAAC  50
                           |||||..|         |    |.|||.|     ||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGTCATCAGATTCCATGGACCA---------GCCCAGGAACCCCTGCGAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAAC  65

Query   51  TCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGT  124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct   66  TCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAAT  139

Query  125  ATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAA  198
            ||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |
Sbjct  140  ATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-A  212

Query  199  GCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCAC  268
            ||| ||.||.||.|||||.|||||.||||||||||..||.|||||||||||.||   |||||||||||||||||
Sbjct  213  GCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCAC  286

Query  269  AGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCAT  342
            ||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||
Sbjct  287  AGACAGACGGACAACAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACAT  360

Query  343  GTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGG---------------------  395
            ||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct  361  GTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGA  434

Query  396  ---------------------------------GGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAG  436
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  435  TGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGCTCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAG  508

Query  437  ACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGT  510
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  509  ACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGG  582

Query  511  GTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATA  584
            ||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  583  GTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTA  656

Query  585  TGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTAT  658
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|
Sbjct  657  TGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGT  730

Query  659  CAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCTACT  720
            ||||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||            |||||||||||||||||||.|||
Sbjct  731  CAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACATCCCTCTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCAACT  804

Query  721  GCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCG  794
            |||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  805  GCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCG  878

Query  795  AGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCT  868
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  879  AGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCT  952

Query  869  AT---GGTG--GATATG---------CAGCCTA------------------------------CAGATATGCAC  898
            ||   |.||  ||.|||         ||..|||                              |.||||| .||
Sbjct  953  ATTCAGCTGAAGAAATGTTAACATCTCACTCTAAATCTCTCAGTGGAGTCTCTGTTCCCTTCTCTGATAT-AAC  1025

Query  899  AGCCT--GCTACTGC--------------AACCGCA-----------GCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAGCC  945
            || .|  |.||||||              ||   ||           ||||..|||       |.|.||    .
Sbjct 1026  AG-ATGGGTTACTGCTTGTTATAATTATTAA---CATTGTGGTATGGGCCAGGGCT-------CGGGTG----G  1084

Query  946  GC-----TTAC------------------AGTGAC----GGTTATGGCAGGG--TGT--ACACA---GCCGAC-  984
            ||     ||||                  ||.|||    .||||.||.|.||  |||  ||.||   |..||| 
Sbjct 1085  GCAAGATTTACTCCTCCTTTGGGCTGGGGAGGGACCAGTTGTTAGGGTATGGAATGTTAACTCAAGTGGTGACT  1158

Query  985  --------CC---CTACCATGCCCTTGCCCCTGC-CGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTA---TA  1043
                    ||   .|||||.|.|.|||...|||| ||||  ||| |.|.|||..||||||       ||   .|
Sbjct 1159  GACTGTTTCCGTAATACCAGGTCGTTGTGGCTGCACGCT--CTA-GTAATTGAGGCTGTG-------TACTTCA  1222

Query 1044  CCGAG---GTGGCTACAG-----------CCGATTTGCCCCCTAC------------  1074
            |||||   |||| ||.||           |||.|.|   |||.|.            
Sbjct 1223  CCGAGCTTGTGG-TAGAGCCTAGGGCAAACCGCTGT---CCCAAGAGAATGCTGGGA  1275