Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478246
• Subject: NM_001310478.2
• Aligned Length: 1470
• Identities: 1303
• Gaps: 54

Alignment

Query    1  ATGGCTCAAGGATCCGGGGATCAAAGAGCAGTGGGGGTTGCTGACCCAGAGGAGAGTTCTCCAAACATGATCGT  74
            ||||||||.||.||||||||.||..|||||||||||.|.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGGCTCAGGGGTCCGGGGACCAGCGAGCAGTGGGGATCGCTGATCCAGAAGAGAGTTCTCCCAACATGATTGT  74

Query   75  TTACTGCAAAATTGAAGACATCATTACAAAGATGCAAGATGACAAGACAGGGGGTGTGCCCATCAGAACAGTCA  148
            .||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  CTACTGCAAAATTGAGGACATCATTACAAAGATGCAAGATGACAAGACAGGGGGTGTGCCCATCAGAACAGTTA  148

Query  149  AGAGCTTTCTCTCCAAAATCCCCAGTGTCGTCACAGGTACTGACATTGTGCAGTGGCTTATGAAGAACCTTTCC  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAGCTTTCTCTCCAAAATCCCCAGTGTCGTCACAGGTACTGACATTGTACAGTGGCTTATGAAGAACCTTTCC  222

Query  223  ATTGAGGACCCAGTTGAAGCAATACACTTGGGGAGCCTTATCGCTGCCCAGGGCTACATCTTTCCAATCTCAGA  296
            |||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  ATTGAGGACCCAGTTGAAGCAATACACCTGGGAAGCCTTATTGCCGCCCAGGGCTACATCTTCCCAATCTCAGA  296

Query  297  CCATGTTCTCACCATGAAGGATGATGGCACCTTTTATCGTTTCCAGGCTCCGTACTTCTGGCCTTCGAACTGCT  370
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  CCATGTTCTCACCATGAAGGACGATGGCACCTTTTACCGTTTCCAGGCTCCTTACTTCTGGCCTTCAAACTGCT  370

Query  371  GGGAACCTGAAAACACTGACTATGCCATCTATCTCTGTAAGAGGACAATGCAAAATAAAGCAAGGCTGGAACTG  444
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGAACCTGAAAACACGGACTATGCCATCTATCTCTGTAAGAGGACGATGCAGAACAAAGCAAGGCTGGAACTG  444

Query  445  GCAGATTATGAAGCAGAAAACTTAGCAAGACTCCAGAGGGCCTTTGCGAGGAAGTGGGAATTCATCTTTATGCA  518
            ||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCGACTACGAAGCAGAAAACTTAGCAAGACTCCAGAGGGCCTTTGCAAGGAAGTGGGAATTCATCTTTATGCA  518

Query  519  AGCAGAAGCACAAGTAAAGATTGACCGGAAAAAAGACAAGACAGAAAGGAAAATTTTGGATAGTCAAGAACGAG  592
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.|||||||.||||||||.|
Sbjct  519  AGCAGAAGCACAAGTGAAGATTGACCGGAAAAAGGATAAGACAGAAAGAAAAATTCTGGATAGCCAAGAACGGG  592

Query  593  CCTTTTGGGATGTCCACAGGCCTGTGCCAGGCTGTGTGAACACAACAGAAATGGATATCCGAAAATGTCGACGT  666
            ||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||
Sbjct  593  CCTTCTGGGATGTCCACAGGCCAGTGCCAGGCTGTGTGAACACAACAGAAATGGATATCAGAAAATGTCGGCGT  666

Query  667  TTGAAGAATCCACAAAAGGTTAAAAAGTCCGTGTATGGCGTGACTGAAGAGTCCCAGGCACAGAGCCCGGTGCA  740
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||.|||||.|||||||.||.|||||
Sbjct  667  TTGAAGAATCCACAAAAGGTTAAAAAGTCAGTATATGGTGTGACAGACGAGACCCAGTCACAGAGTCCAGTGCA  740

Query  741  TGTACTCAGCCAACCAATCAGGAAAACAACAAAAGAGGACATCCGGAAACAGATAACATTTTTGAACGCACAGA  814
            ..|||..|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  741  CATACCAAGCCAGCCAATCAGGAAAACTACAAAAGATGACATCCGAAAACAGATAACGTTTTTGAATGCACAGA  814

Query  815  TCGACAGACATTGTTTGAAAATGTCCAAAGTGGCTGAAAGTTTAATTGCCTACACGGAACAATATGTGGAATAT  888
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.
Sbjct  815  TTGACAGACATTGTTTGAAAATGTCCAAAGTGGCTGAAAGTTTAATCGCTTACACGGAGCAGTATGTGGAGTAC  888

Query  889  GACCCTTTGATAACACCAGCTGAGCCATCCAACCCTTGGATCAGCGATGACGTTGCTTTGTGGGACATAGAGAT  962
            |||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.|..|.||.||||||||||||||
Sbjct  889  GACCCATTCATAACACCAGCAGAGCCATCTAATCCTTGGATCAGCGATGACATCACCTTATGGGACATAGAGAT  962

Query  963  GAGCAAAGAGCCCAGCCAACAGCGAGTAAAAAGATGGGGCTTCTCTTTCGATGAGATATTGAAGGACCAGGTGG  1036
            ||||||||||||||||||.||||||||.||..|.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  963  GAGCAAAGAGCCCAGCCAGCAGCGAGTGAAGCGTTGGGGCTTCTCTTTTGATGAGATACTGAAGGACCAGGTGG  1036

Query 1037  GGCGGGACCAGTTTCTACGATTCCTGGAGTCCGAATTCAGTTCAGAAAACCTCAGGTTCTGGCTGGCTGTCCAA  1110
            |||||||||||||.||..|||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1037  GGCGGGACCAGTTCCTCAGATTCCTGGAGTCAGAATTCAGCTCAGAAAATCTCAGGTTCTGGCTGTCTGTCCAA  1110

Query 1111  GATCTTAAGAAACAACCCCTACAGGATGTGGCCAAGAGGGTAGAAGAAATCTGGCAAGAGTTTCTGGCTCCAGG  1184
            |||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1111  GATCTCAAGAAGCAACCTCTACAGGACGTGGCCAAGAGGGTGGAGGAAATCTGGCAAGAGTTTCTAGCTCCCGG  1184

Query 1185  GGCTCCAAGTGCAATCAACCTGGATTCTCACAGCTATGAGATAACCAGTCAAAATGTCAAAGATGGAGGGAGAT  1258
            .||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGCCCCAAGTGCAATCAACTTGGATTCTCACAGCTATGAGATAACCAGTCAGAATGTCAAAGATGGAGGGAGAT  1258

Query 1259  ATACATTTGAAGACGCCCAGGAGCACATCTACAAGCTGATGAAGAGTGACAGCTATGCCCGCTTCCTCCGGTCA  1332
            |.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1259  ACACATTTGAAGATGCCCAGGAGCACATCTACAAGCTGATGAAGAGTGACAGCTATGCCCGCTTCCTACGGTCC  1332

Query 1333  AATGCTTACCAGGATTTGCTGCTGGCCAAGAAGAA---------------------------------------  1367
            ||.||||||||||||.||.||||||||||||||||                                       
Sbjct 1333  AACGCTTACCAGGATCTGTTGCTGGCCAAGAAGAAGCCAGAAAGTGAGCAAGGTCGTAGGACTTCCCTAGAAAA  1406

Query 1368  ---------------GGGAAAGTCGCTGGCGGGCAAGCGCCTCACGGGCCTGATGCAGTCCTCC  1416
                           |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTTCACCCGCAGTGTGGGAAAGTCGCTGGCGGGCAAGCGCCTTACGGGCCTGATGCAGTCCTCC  1470