Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478246
- Subject:
- XM_006516070.3
- Aligned Length:
- 1428
- Identities:
- 989
- Gaps:
- 336
Alignment
Query 1 ATGGCTCAAGGATCCGGGGATCAAAGAGCAGTGGGGGTTGCTGACCCAGAGGAGAGTTCTCCAAACATGATCGT 74
||||||||.||.||||||||.||..|||||||||||.|.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1 ATGGCTCAGGGGTCCGGGGACCAGCGAGCAGTGGGGATCGCTGATCCAGAAGAGAGTTCTCCCAACATGATTGT 74
Query 75 TTACTGCAAAATTGAAGACATCATTACAAAGATGCAAGATGACAAGACAGGGGGTGTGCCCATCAGAACAGTCA 148
.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 75 CTACTGCAAAATTGAGGACATCATTACAAAGATGCAAGATGACAAGACAGGGGGTGTGCCCATCAGAACAGTTA 148
Query 149 AGAGCTTTCTCTCCAAAATCCCCAGTGTCGTCACAGGTACTGACATTGTGCAGTGGCTTATGAAGAACCTTTCC 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGAGCTTTCTCTCCAAAATCCCCAGTGTCGTCACAGGTACTGACATTGTACAGTGGCTTATGAAGAACCTTTCC 222
Query 223 ATTGAGGACCCAGTTGAAGCAATACACTTGGGGAGCCTTATCGCTGCCCAGGGCTACATCTTTCCAATCTCAGA 296
|||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 ATTGAGGACCCAGTTGAAGCAATACACCTGGGAAGCCTTATTGCCGCCCAGGGCTACATCTTCCCAATCTCAGA 296
Query 297 CCATGTTCTCACCATGAAGGATGATGGCACCTTTTATCGTTTCCAGGCTCCGTACTTCTGGCCTTCGAACTGCT 370
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 297 CCATGTTCTCACCATGAAGGACGATGGCACCTTTTACCGTTTCCAGGCTCCTTACTTCTGGCCTTCAAACTGCT 370
Query 371 GGGAACCTGAAAACACTGACTATGCCATCTATCTCTGTAAGAGGACAATGCAAAATAAAGCAAGGCTGGAACTG 444
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGGAACCTGAAAACACGGACTATGCCATCTATCTCTGTAAGAGGACGATGCAGAACAAAGCAAGGCTGGAACTG 444
Query 445 GCAGATTATGAAGCAGAAAACTTAGCAAGACTCCAGAGGGCCTTTGCGAGGAAGTGGGAATTCATCTTTATGCA 518
||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCCGACTACGAAGCAGAAAACTTAGCAAGACTCCAGAGGGCCTTTGCAAGGAAGTGGGAATTCATCTTTATGCA 518
Query 519 AGCAGAAGCACAAGTAAAGATTGACCGGAAAAAAGACAAGACAGAAAGGAAAATTTTGGATAGTCAAGAACGAG 592
|||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.|||||||.||||||||.|
Sbjct 519 AGCAGAAGCACAAGTGAAGATTGACCGGAAAAAGGATAAGACAGAAAGAAAAATTCTGGATAGCCAAGAACGGG 592
Query 593 CCTTTTGGGATGTCCACAGGCCTGTGCCAGGCTGTGTGAACACAACAGAAATGGATATCCGAAAATGTCGACGT 666
||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||
Sbjct 593 CCTTCTGGGATGTCCACAGGCCAGTGCCAGGCTGTGTGAACACAACAGAAATGGATATCAGAAAATGTCGGCGT 666
Query 667 TTGAAGAATCCACAAAAGGTTAAAAAGTCCGTGTATGGCGTGACTGAAGAGTCCCAGGCACAGAGCCCGGTGCA 740
|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||.|||||.|||||||.||.|||||
Sbjct 667 TTGAAGAATCCACAAAAGGTTAAAAAGTCAGTATATGGTGTGACAGACGAGACCCAGTCACAGAGTCCAGTGCA 740
Query 741 TGTACTCAGCCAACCAATCAGGAAAACAACAAAAGAGGACATCCGGAAACAGATAACATTTTTGAACGCACAGA 814
..|||..|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 741 CATACCAAGCCAGCCAATCAGGAAAACTACAAAAGATGACATCCGAAAACAGATAACGTTTTTGAATGCACAGA 814
Query 815 TCGACAGACATTGTTTGAAAATGTCCAAAGTGGCTGAAAGTTTAATTGCCTACACGGAACAATATGTGGAATAT 888
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.
Sbjct 815 TTGACAGACATTGTTTGAAAATGTCCAAAGTGGCTGAAAGTTTAATCGCTTACACGGAGCAGTATGTGGAGTAC 888
Query 889 GACCCTTTGATAACACCAGCTGAGCCATCCAACCCTTGGATCAGCGATGACGTTGCTTTGTGGGACATAGAGAT 962
|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.|..|.||.||||||||||||||
Sbjct 889 GACCCATTCATAACACCAGCAGAGCCATCTAATCCTTGGATCAGCGATGACATCACCTTATGGGACATAGAGAT 962
Query 963 GAGCAAAGAGCCCAGCCAACAGCGAGTAAAAAGATGGGGCTTCTCT-----TTCGATG--AGATATTGAAGGAC 1029
||||...|| |..|||.| .||||||||| |.|.||| ||.| ||.||
Sbjct 963 GAGCTTTGA-------------CTTGTACA------TGGCTTCTCTGTGTCTCCAATGGCAGCT-----AGCAC 1012
Query 1030 CAGGTGGGGCGGGACCAGTTTCTACGATTCCTGGAGTCCGAATTCAG---TTCAGAAAACCTCAGGTTCTGGCT 1100
| |||.| |||| |||| .||.|||||||
Sbjct 1013 C-------------------TCTCC------------------TCAGCGTTTCA---------TGGCTCTGGCT 1040
Query 1101 GGCTGTCCAAGATCTTAAGAAACAACCCCTACAGGATGTGGCCAAGAGGGTAGAAGAAATCTGGCAAGAGTTTC 1174
| |.||| ||||.|||.| ||| |
Sbjct 1041 G------------------------------CTGGA----------AGGGAAGACG----CTG----------C 1060
Query 1175 TGGCTCCAGGGGCTCCAAGTGCAATCAACCTGGATTCTCACAGCTATGAGATAACCAGTCAAAATGTCAAAGAT 1248
||.| |||||.|| |||| ||.|
Sbjct 1061 TGCC--------------------TCAACTTG---TCTC----CTTT--------------------------- 1080
Query 1249 GGAGGGAGATATACATTTGAAGACGCCCAGGAGCACATCTACA--AGCTGATGAAGAGTGACAGCTATGCCCGC 1320
||.|.|.|.||| |||| ||| |||
Sbjct 1081 --------------ATCTCAGGTCGC-----AGCA-----ACACTAGC-------------------------- 1104
Query 1321 TTCCTCCGGTCAAATGCTTACCAGGATTTGCTGCTGGCCAAGAAGAAGGGAAAGTCGCTGGCGGGCAAGCGCCT 1394
Sbjct 1105 -------------------------------------------------------------------------- 1104
Query 1395 CACGGGCCTGATGCAGTCCTCC 1416
Sbjct 1105 ---------------------- 1104