Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478305
- Subject:
- XM_006504318.1
- Aligned Length:
- 2589
- Identities:
- 2125
- Gaps:
- 9
Alignment
Query 1 ATGACTGGGAGAGCCCGAGCCAGAGCCAGAGGAAGGGCCCGCGGTCAGGAGACAGCGCAGCTGGT--GGGCTCC 72
||||||||..||||||||||..|.|||.|.||.|||||.||.|||||||||||.|.|||||..|| |||||
Sbjct 1 ATGACTGGCCGAGCCCGAGCTCGGGCCCGCGGCAGGGCACGAGGTCAGGAGACGGTGCAGCATGTTGGGGCT-- 72
Query 73 ACTGCCAGTCAGCAACCTGGTTATATTCAGCCTAGGCCTCAGCCG-CCACCAGCAGAGGGGGAATTATTTGGCC 145
.||||.||.|||||||||||.||.||.|..||.||.|||||.|.| ||.||| ||||||||||.||..||||||
Sbjct 73 GCTGCGAGCCAGCAACCTGGGTACATCCCACCGAGACCTCAACAGTCCCCCA-CAGAGGGGGACTTGGTTGGCC 145
Query 146 GTGGACGGCAGAGAGGAA---CAGCAGGAGGAACAGCCAAGTCACAAGGACTCCAGATATCTGCTGGATTTCAG 216
|.|||||.|||||.||.| .||..||||..|||.||||||||||||.|||.|||||.||.|||||.||||||
Sbjct 146 GAGGACGACAGAGGGGGATGGTAGTCGGAGCCACATCCAAGTCACAAGAACTGCAGATCTCAGCTGGGTTTCAG 219
Query 217 GAGTTATCGTTAGCAGAGAGAGGAGGTCGTCGTAGAGATTTTCATGATCTTGGTGTGAATACAAGGCAGAACCT 290
|||.|.||..|.||||||||||||||.|||||..||||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 220 GAGCTGTCACTGGCAGAGAGAGGAGGGCGTCGCCGAGACTTCCATGACCTTGGTGTGAACACCAGACAGAACCT 293
Query 291 AGACCATGTTAAAGAATCAAAAACAGGTTCTTCAGGCATTATAGTAAGGTTAAGCACTAACCATTTCCGGCTGA 364
.||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.||.|.|.|.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct 294 TGACCATGTCAAAGAGTCAAAGACAGGCTCCTCTGGCATCATTGTGAAGCTGAGCACCAACCACTTCCGGCTGA 367
Query 365 CATCCCGTCCCCAGTGGGCCTTATATCAGTATCACATTGACTATAACCCACTGATGGAAGCCAGAAGACTCCGT 438
|.||.||.||.|||||||||.|.||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||.||||.||.||.
Sbjct 368 CCTCGCGCCCACAGTGGGCCCTGTATCAGTACCACATCGACTACAATCCCCTGATGGAGGCCCGAAGGCTTCGC 441
Query 439 TCAGCTCTTCTTTTTCAACACGAAGATCTAATTGGAAAGTGTCATGCTTTTGATGGAACGATATTATTTTTACC 512
||.||.||.||.||.||.||.|||||.||.|||||||.||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 442 TCCGCACTGCTCTTCCAGCATGAAGACCTCATTGGAAGGTGTCATGCTTTCGATGGGACAATATTGTTTTTACC 515
Query 513 TAAAAGACTACAGCAAAAGGTTACTGAAGTTTTTAGTAAGACCCGGAATGGAGAGGATGTGAGGATAACGATCA 586
|||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||.||||.||||||||.||..|.||||||||.||.||||
Sbjct 516 TAAGAGACTACAGCACAAGGTCACAGAAGTATTCAGTCAGACTCGGAATGGGGAACACGTGAGGATCACCATCA 589
Query 587 CTTTAACAAATGAACTTCCACCTACATCACCAACTTGTTTGCAGTTCTATAATATTATTTTCAGGAGGCTTTTG 660
|..|.||.||.||.||.||.||.||.||.||.||.||..|||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||
Sbjct 590 CCCTGACCAACGAGCTGCCGCCCACCTCGCCCACCTGCCTGCAGTTCTATAACATCATCTTCAGGAGGCTCTTG 663
Query 661 AAAATCATGAATTTGCAACAAATTGGACGAAATTATTATAACCCAAATGACCCAATTGATATTCCAAGTCACAG 734
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||.||||||.|||||||||||||..|||||
Sbjct 664 AAAATCATGAATTTGCAACAAATTGGACGGAATTATTACAATCCAAGTGACCCGATTGATATTCCAAACCACAG 737
Query 735 GTTGGTGATTTGGCCTGGCTTCACTACTTCCATCCTTCAGTATGAAAACAGCATCATGCTCTGCACTGACGTTA 808
|||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 738 GTTGGTGATCTGGCCCGGCTTCACCACCTCCATCCTTCAGTATGAGAACAACATCATGCTCTGCACAGACGTCA 811
Query 809 GCCATAAAGTCCTTCGAAGTGAGACTGTTTTGGATTTCATGTTCAACTTTTATCATCAGACAGAAGAACATAAA 882
||||.||.||.||.||.||.||||||||..|.||.|||||||||||..|.||.||.||||||||.||.||.||.
Sbjct 812 GCCACAAGGTGCTCCGCAGCGAGACTGTCCTAGACTTCATGTTCAATCTATACCAGCAGACAGAGGAGCACAAG 885
Query 883 TTTCAAGAACAAGTTTCCAAAGAACTAATAGGTTTAGTTGTTCTTACCAAGTATAACAATAAGACATACAGAGT 956
||.||.||.|||||.||.||.||.||.|||||..|..|.|||||.||||||||.||.||.|||||.|||.|.||
Sbjct 886 TTCCAGGAGCAAGTGTCGAAGGAGCTCATAGGCCTCATCGTTCTCACCAAGTACAATAACAAGACCTACCGGGT 959
Query 957 GGATGATATTGACTGGGACCAGAATCCCAAGAGCACCTTTAAGAAAGCCGACGGCTCTGAAGTCAGCTTCTTAG 1030
||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||.|.|
Sbjct 960 GGATGACATTGACTGGGACCAGAATCCAAAGAGCACCTTCAAGAAGGCGGATGGCTCGGAGGTCAGCTTCCTGG 1033
Query 1031 AATACTACAGGAAGCAATACAACCAAGAGATCACCGACTTGAAGCAGCCTGTCTTGGTCAGCCAGCCCAAGAGA 1104
|.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||.||..||||.|||||.||||||.|.
Sbjct 1034 AGTACTACAGGAAGCAATACAACCAGGAGATCACGGACCTGAAGCAGCCGGTGCTGGTGAGCCAACCCAAGCGG 1107
Query 1105 AGGCGGGGCCCTGGGGGGACACTGCCAGGGCCTGCCATGCTCATTCCTGAGCTCTGCTATCTTACAGGTCTAAC 1178
|||.|.|||||.||.||.||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 1108 AGGAGAGGCCCCGGCGGCACCCTGCCTGGCCCAGCTATGCTCATCCCTGAACTCTGCTATCTCACAGGCCTGAC 1181
Query 1179 TGATAAAATGCGTAATGATTTTAACGTGATGAAAGACTTAGCCGTTCATACAAGACTAACTCCAGAGCAAAGGC 1252
||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||.|.||.||.||.||..|.||.||.||.|||||..|||
Sbjct 1182 TGATAAAATGCGCAATGATTTCAATGTGATGAAGGACCTGGCAGTGCACACGCGGCTGACCCCTGAGCAGCGGC 1255
Query 1253 AGCGTGAAGTGGGACGACTCATTGATTACATTCATAAAAACGATAATGTTCAAAGGGAGCTTCGAGACTGGGGT 1326
||||.||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||..|.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1256 AGCGGGAGGTGGGCCGCCTCATCGACTACATCCACAAGGATGACAATGTGCAGAGAGAGCTTCGAGACTGGGGC 1329
Query 1327 TTGAGCTTTGATTCCAACTTACTGTCCTTCTCAGGAAGAATTTTGCAAACAGAAAAGATTCACCAAGGTGGAAA 1400
.|||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||.|.||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1330 CTGAGCTTCGACTCAAACTTGCTGTCCTTCTCTGGAAGAATCTTACAATCTGAGAAGATCCACCAGGGCGGAAA 1403
Query 1401 AACATTTGATTACAATCCACAATTTGCAGATTGGTCCAAAGAAACAAGAGGTGCACCATTAATTAGTGTTAATC 1474
.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||..|.||.||.||.||.|
Sbjct 1404 GACGTTTGATTACAACCCACAATTTGCAGACTGGTCCAAAGAAACAAGAGGCGCGCCGCTGATCAGCGTGAAGC 1477
Query 1475 CACTAGATAACTGGCTGTTGATCTATACGCGAAGAAATTATGAAGCAGCCAATTCATTGATACAAAATCTATTT 1548
||.|.||||||||||||.||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||.|||||||.||.||.||.
Sbjct 1478 CATTGGATAACTGGCTGCTGATCTATACCCGCAGGAATTATGAAGCAGCCAACTCACTGATACAGAACCTGTTC 1551
Query 1549 AAAGTTACACCAGCCATGGGCATGCAAATGAAAAAAGCAATAATGATTGAAGTGGATGACAGAACTGAAGCCTA 1622
|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1552 AAAGTGACTCCAGCCATGGGCATCCAGATGAAAAAGGCAATCATGATCGAGGTGGATGACAGAACAGAAGCTTA 1625
Query 1623 CTTAAGAGTCTTACAGCAAAAGGTCACAGCAGACACCCAGATAGTTGTCTGTCTGTTGTCAAGTAATCGGAAGG 1696
..|.||||.|||.|||||.|||||.||..|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1626 TCTGAGAGCCTTGCAGCAGAAGGTGACGTCAGACACTCAGATAGTTGTCTGTCTCTTGTCAAGTAATCGGAAGG 1699
Query 1697 ACAAATACGATGCTATTAAAAAATACCCGTGTACAGATTGCCCTACCCCAAGTCAGTGTGTGGTGGCCCGAACC 1770
|||||||.|||||.||.||.||.|||..|||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1700 ACAAATATGATGCCATCAAGAAGTACTTGTGTACAGACTGCCCCACCCCAAGTCAGTGTGTGGTGGCCCGGACC 1773
Query 1771 TTAGGCAAACAGCAAACTGTCATGGCCATTGCTACAAAGATTGCCCTACAGATGAACTGCAAGATGGGAGGAGA 1844
.|.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1774 CTGGGCAAGCAGCAAACAGTCATGGCCATTGCCACCAAGATCGCCCTGCAGATGAACTGCAAGATGGGAGGCGA 1847
Query 1845 GCTCTGGAGGGTGGACATCCCCCTGAAGCTCGTGATGATCGTTGGCATCGATTGTTACCATGACATGACAGCTG 1918
|||||||.||||||||||.||||||||.||.|..||||||||.||||||||.|||||||||||||..|||||||
Sbjct 1848 GCTCTGGCGGGTGGACATGCCCCTGAAACTGGCAATGATCGTGGGCATCGACTGTTACCATGACACCACAGCTG 1921
Query 1919 GGCGGAGGTCAATCGCAGGATTTGTTGCCAGCATCAATGAAGGGATGACCCGCTGGTTCTCACGCTGCATATTT 1992
||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||
Sbjct 1922 GGCGGAGGTCCATCGCAGGATTCGTCGCCAGCATCAATGAAGGGATGACCCGCTGGTTCTCCCGCTGCGTCTTT 1995
Query 1993 CAGGATAGAGGACAGGAGCTGGTAGATGGGCTCAAAGTCTGCCTGCAAGCGGCTCTGAGGGCTTGGAATAGCTG 2066
|||||..|.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||.|||||||.||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 1996 CAGGACCGCGGGCAGGAGCTGGTGGATGGTCTCAAGGTGTGCTTGCAAGCTGCTCTGAGGGCTTGGAGTGGCTG 2069
Query 2067 CAATGAGTACATGCCCAGCCGGATCATCGTGTACCGCGATGGCGTAGGAGACGGCCAGCTGAAAACACTGGTGA 2140
||||||.||||||||||||||..|||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct 2070 CAATGAATACATGCCCAGCCGTGTCATCGTGTACCGAGACGGTGTGGGGGACGGGCAGCTGAAGACCCTGGTCA 2143
Query 2141 ACTACGAAGTGCCACAGTTTTTGGATTGTCTAAAATCCATTGGTAGAGGTTACAACCCTAGACTAACGGTAATT 2214
|.||.||.||.||||||||..|.|||||.||.||.||..|.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.
Sbjct 2144 ATTATGAGGTCCCACAGTTCCTAGATTGCCTCAAGTCAGTCGGGAGAGGTTACAACCCAAGACTGACTGTAATC 2217
Query 2215 GTGGTGAAGAAAAGAGTGAACACCAGATTTTTTGCTCAGTCTGGAGGAAGACTTCAGAATCCACTTCCTGGAAC 2288
|||||||||||..|.||.||..||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 2218 GTGGTGAAGAAGCGTGTCAATGCCAGGTTTTTTGCTCAGTCTGGGGGAAGACTTCAGAACCCTCTTCCAGGGAC 2291
Query 2289 AGTTATTGATGTAGAGGTTACCAGACCAGAATGGTATGACTTTTTTATCGTGAGCCAGGCTGTGAGAAGTGGTA 2362
|||.||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 2292 AGTCATCGATGTGGAAGTCACCAGACCAGAGTGGTATGACTTTTTCATCGTGAGCCAGGCAGTGAGAAGCGGGA 2365
Query 2363 GTGTTTCTCCCACACATTACAATGTCATCTATGACAACAGCGGCCTGAAGCCAGACCACATACAGCGCTTGACC 2436
||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||.|||.|||||||||||.||||||||.|||||..||||.
Sbjct 2366 GTGTGTCCCCAACACACTACAATGTCATCTATGACAGCAGTGGCCTGAAGCCCGACCACATCCAGCGGCTGACA 2439
Query 2437 TACAAGCTGTGCCACATCTATTACAACTGGCCAGGTGTCATTCGTGTTCCTGCTCCTTGCCAGTACGCCCACAA 2510
||||||||.||||||.|.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 2440 TACAAGCTCTGCCACGTGTACTATAATTGGCCTGGAGTCATCCGAGTCCCTGCACCTTGCCAGTATGCACACAA 2513
Query 2511 GCTGGCTTTTCTTGTTGGCCAGAGTATTCACAGAGAGCCAAATCTGTCACTGTCAAACCGCCTTTACTACCTC 2583
||||||.||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 2514 GCTGGCCTTCCTCGTGGGCCAGAGCATCCACAGAGAGCCAAACCTCTCCCTGTCCAACCGCCTCTACTACCTC 2586