Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478444
- Subject:
- XR_001737463.2
- Aligned Length:
- 2203
- Identities:
- 1585
- Gaps:
- 547
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AAAGCGGGCTGCGGCCCCCTCCCAAAACCCGGGGAAGTGGATTCTACTCTACGCTCCGCTCCGCTCCGCTCCGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 ACCACCAACCCCGGGCCGCAGTCCTGACGAGCGGGTCAGGGCTTGTCGGGCGGAAGCCTGGCCTGGAGCCTGGA 148
Query 1 ------------------------------------------------------------------ATGTTTGT 8
||||||||
Sbjct 149 AGGGGGAGACGGCCCGAGCGGGAGCGGGAGCGGACGCGGCCTCAGTCCTGCGCGGAATATTGAAGGATGTTTGT 222
Query 9 TCCAAGATCTCTAAAAATCAAGAGGAATGCTAATGATGATGGCAAAAGTTGTGTGGCTAAGATAATTAAACCAG 82
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCCAAGATCTCTAAAAATCAAGAGGAATGCTAATGATGATGGCAAAAGTTGTGTGGCTAAGATAATTAAACCAG 296
Query 83 ACCCAGAAGACCTTCAGTTGGACAAAAGCAGAGATGTTCCCGTTGATGCTGTAGCTACAGAAGCAGCCACAATA 156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACCCAGAAGACCTTCAGTTGGACAAAAGCAGAGATGTTCCCGTTGATGCTGTAGCTACAGAAGCAGCCACAATA 370
Query 157 GACAGGCACATCAGCGAATCATGCCCTTTCCCCAGCCCAGGTGGCCAGTTGGCAGAGGTTCATTCAGTAAGTCC 230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GACAGGCACATCAGCGAATCATGCCCTTTCCCCAGCCCAGGTGGCCAGTTGGCAGAGGTTCATTCAGTAAGTCC 444
Query 231 CGAGCAGGGTGCGAAGGACAGCCATCCTTCTGAAGAGCCCGTTAAGTCATTTTCCAAAACACAGCGCTGGGCAG 304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CGAGCAGGGTGCGAAGGACAGCCATCCTTCTGAAGAGCCCGTTAAGTCATTTTCCAAAACACAGCGCTGGGCAG 518
Query 305 AACCAGGGGAACCCATCTGTGTTGTCTGTGGTCGTTATGGAGAGTATATCTGTGATAAGACAGATGAAGATGTG 378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AACCAGGGGAACCCATCTGTGTTGTCTGTGGTCGTTATGGAGAGTATATCTGTGATAAGACAGATGAAGATGTG 592
Query 379 TGTAGTTTGGAGTGTAAAGCGAAACATCTTCTACAAGTTAAGGAAAAGGAAGAGAAATCAAAACTCAGCAATCC 452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGTAGTTTGGAGTGTAAAGCGAAACATCTTCTACAAGTTAAGGAAAAGGAAGAGAAATCAAAACTCAGCAATCC 666
Query 453 ACAGAAGGCTGATTCTGAGCCAGAGTCTCCACTGAATGCTTCCTATGTCTACAAAGAGCACCCCTTTATTTTGA 526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACAGAAGGCTGATTCTGAGCCAGAGTCTCCACTGAATGCTTCCTATGTCTACAAAGAGCACCCCTTTATTTTGA 740
Query 527 ACCTTCAGGAAGACCAGATTGAAAATCTTAAACAGCAGCTGGGAATTTTAGTTCAAGGGCAAGAAGTCACCAGG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACCTTCAGGAAGACCAGATTGAAAATCTTAAACAGCAGCTGGGAATTTTAGTTCAAGGGCAAGAAGTCACCAGG 814
Query 601 CCCATTATTGACTTTGAACATTGTAGTCTCCCTGAGGTCTTAAATCACAACTTGAAGAAATCGGGCTATGAGGT 674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 815 CCCATTATTGACTTTGAACATTGTAGTCTCCCTGAGGTCTTAAATCACAACTTGAAGAAATCAGGCTATGAGGT 888
Query 675 GCCAACTCCCATTCAAATGCAGATGATTCCTGTGGGACTTCTGGGAAGAGACATTCTGGCCAGTGCAGATACTG 748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCCAACTCCCATTCAAATGCAGATGATTCCTGTGGGACTTCTGGGAAGAGACATTCTGGCCAGTGCAGATACTG 962
Query 749 GCTCAGGAAAAACAGCTGCTTTTCTTCTTCCTGTTATCATGCGAGCTTTATTCGAGAGCAAAACTCCATCTGCG 822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCTCAGGAAAAACAGCTGCTTTTCTTCTTCCTGTTATCATGCGAGCTTTATTCGAGAGCAAAACTCCATCTGCG 1036
Query 823 CTCATTCTTACACCAACCAGAGAGTTAGCCATTCAGATAGAGAGACAAGCTAAAGAATTGATGAGTGGCCTGCC 896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTCATTCTTACACCAACCAGAGAGTTAGCCATTCAGATAGAGAGACAAGCTAAAGAATTGATGAGTGGCCTGCC 1110
Query 897 ACGCATGAAAACTGTGCTTCTTGTAGGGGGCTTACCCTTACCCCCACAGCTTTATCGTCTGCAACAACATGTTA 970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACGCATGAAAACTGTGCTTCTTGTAGGGGGCTTACCCTTACCCCCACAGCTTTATCGTCTGCAACAACATGTTA 1184
Query 971 AGGTTATCATAGCAACCCCTGGGCGACTTCTGGATATAATAAAGCAGAGCTCTGTAGAACTCTGTGGTGTAAAG 1044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGGTTATCATAGCAACCCCTGGGCGACTTCTGGATATAATAAAGCAGAGCTCTGTAGAACTCTGTGGTGTAAAG 1258
Query 1045 ATTGTGGTAGTAGATGAAGCTGATACCATGTTAAAGATGGGTTTTCAACAACAAGT-GCTTGACATTTTGGAAA 1117
||||||||||||||||||| || |||.| | |||||
Sbjct 1259 ATTGTGGTAGTAGATGAAG---------------AG--------TCACC------TGGCTTG------------ 1291
Query 1118 ACATTCCTAATGATTGTCAGACCATTTTGGTTTCAG-CCACAATTCCAACTAGCATAGAACAGCTAGCAAGCCA 1190
|.||.|||...|||||| .|| |||.|..||..|||.|.|||
Sbjct 1292 -----CTTAGTGACCATCAGAC-----------GAGACCAGACCTCTCACTTGGATA----------------- 1332
Query 1191 GCTTCTGCATAATCC------TGTGAGAATTATCACTGGAGAAAAGAACCTACCTTGTGCCAATGTACGTCAGA 1258
||||| ||.| |||||| .|||||..|.|||.|| || .||| ||
Sbjct 1333 --TTCTG----ATTCAGTAGGTGTGAG--------TTGGAGCCAGGAATCT--CT----ACAA---AC------ 1377
Query 1259 TTATTTTGTGGGTAGAAGACCCAGCCAAAAAGAAAAAATTATTTGAAATTTTAAATGATAAGAAACTCTTTAAG 1332
|.||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1378 TCATT---------------CCAG--------------------------------GATAAGAAACTCTTTAAG 1404
Query 1333 CCTCCAGTGTTAGTATTTGTGGACTGCAAACTAGGAGCAGATCTTTTGAGTGAAGCCGTTCAGAAAATCACAGG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405 CCTCCAGTGTTAGTATTTGTGGACTGCAAACTAGGAGCAGATCTTTTGAGTGAAGCCGTTCAGAAAATCACAGG 1478
Query 1407 GCTGAAAAGAATATCTATACATTCGGAGAAGTCGCAAATAGAAAGGAAAAACATATTGAAGGGATTACTTGAAG 1480
|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479 GCTGAAAAGCATATCTATACATTCAGAGAAGTCGCAAATAGAAAGGAAAAACATATTGAAGGGATTACTTGAAG 1552
Query 1481 GAGACTATGAAGTTGTAGTGAGCACAGGAGTCTTGGGACGAGGCCTAGACTTGATCAGTGTCAGGCTGGTTGTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553 GAGACTATGAAGTTGTAGTGAGCACAGGAGTCTTGGGACGAGGCCTAGACTTGATCAGTGTCAGGCTGGTTGTC 1626
Query 1555 AATTTTGATATGCCTTCAAGTATGGATGAGTATGTCCATCAG-------------ATTGGAAGAGTAGGAAGAT 1615
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || .|.||.||||.|
Sbjct 1627 AATTTTGATATGCCTTCAAGTATGGATGAGTATGTCCATCAGTCTACTCACCACAAT-----CAATATGAAGTT 1695
Query 1616 T-------------AGGTCAAAATGGAAC-AGCGATTAC-TTTCATCAATAATAATTCAAAAAGACTCTTCTGG 1674
| |||| ||||.|| ||.|.|.|| |.||||| |||...||||.|.||||
Sbjct 1696 TACTCCATAAACAGAGGT----ATGGTACAAGAGGTAACGTGTCATC----------CAAGGTGACTTTCCTGG 1755
Query 1675 GATATTGCAAAACGAGTAAAGCCCAC-----------AGGA-TCCATTCTTCCCCCTCAGTTATTAAATTCCCC 1736
.| || .||.|||||| |..|| |||| ||..||.||.||.|..|| .|
Sbjct 1756 CA----GC--CACCAGTAAA-CTGACTCCGGACAGATAGGACTCTTTTGTTGCCGCCAAG------------GC 1810
Query 1737 ATACCTTC-ATGAC--CAGAAG----AG----AAAG---GAA---CAACAGAAAGATAA--ACAG---ACACAG 1788
||||.|.| ||||| ||||.| || |.|| ||| ||||..|..||||| | || ||||||
Sbjct 1811 ATACTTACAATGACCTCAGAGGCTCTAGGGCCACAGTGTGAAAACCAACCAATGGATAATTA-AGTAAACACAG 1883
Query 1789 AATGATCTGGT--TAC----------AGGAGCTAATCTTATGGATATTATCAGAAA--------AC-----ATG 1837
|..|||.|| ||| ||.|.|| ||.|||| ||.|||| || || |||
Sbjct 1884 --TTCTCTTGTTCTACTGTTAGTGTGAGAACCT-ATTTTAT--ATTTTAT----AATGTGTTGCACGTGTGATG 1948
Query 1838 ATAAAAG---TAATTCTCAGAAA---------------------------------- 1857
|||.|.| .|||| |.|||
Sbjct 1949 ATATAGGACAAAATT---ACAAATAAAGCATAAGACGAGTGTTTATTTTTGTAATGT 2002