Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478685
- Subject:
- XM_006497354.1
- Aligned Length:
- 1332
- Identities:
- 1192
- Gaps:
- 6
Alignment
Query 1 ATGGAGGTGACGGCGGACCAGCCGCGCTGGGTGAGCCACCACCACCCCGCCGTGCTCAACGGGCAGCACCCGGA 74
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1 ATGGAGGTGACTGCGGACCAGCCGCGCTGGGTGAGCCACCATCACCCCGCGGTCCTCAACGGTCAGCACCCAGA 74
Query 75 CACGCACCACCCGGGCCTCAGCCACTCCTACATGGACGCGGCGCAGTACCCGCTGCCGGAGGAGGTGGATGTGC 148
|||||||||||||||||||.||||.||.|||||||| .||.|||||.||||||.||||.||||||||.||.|
Sbjct 75 CACGCACCACCCGGGCCTCGGCCATTCGTACATGGA---AGCTCAGTATCCGCTGACGGAAGAGGTGGACGTAC 145
Query 149 TTTTTAACATCGACGGTCAAGGCAACCACGTCCCGCCCTACTACGGAAACTCGGTCAGGGCCACGGTGCAGAGG 222
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 146 TTTTTAACATCGATGGTCAAGGCAACCACGTCCCGTCCTACTACGGAAACTCCGTCAGGGCTACGGTGCAGAGG 219
Query 223 TACCCTCCGACCCACCACGGGAGCCAGGTGTGCCGCCCGCCTCTGCTTCATGGATCCCTACCCTGGCTGGACGG 296
||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 220 TATCCTCCGACCCACCACGGGAGCCAGGTATGCCGCCCGCCTCTGCTGCACGGATCTCTGCCCTGGCTGGATGG 293
Query 297 CGGCAAAGCCCTGGGCAGCCACCACACCGCCTCCCCCTGGAATCTCAGCCCCTTCTCCAAGACGTCCATCCACC 370
|||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 CGGCAAAGCCCTGAGCAGCCACCACACCGCCTCGCCCTGGAACCTCAGCCCCTTCTCCAAGACGTCCATCCACC 367
Query 371 ACGGCTCCCCGGGGCCCCTCTCCGTCTACCCCCCGGCCTCGTCCTCCTCCTTGTCGGGGGGCCACGCCAGCCCG 444
|||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||..||.|||..||||||.||||.||.
Sbjct 368 ACGGCTCTCCGGGGCCTCTGTCCGTTTACCCTCCGGCTTCATCCTCTTCTCTGGCGGCCGGCCACTCCAGTCCT 441
Query 445 CACCTCTTCACCTTCCCGCCCACCCCGCCGAAGGACGTCTCCCCGGACCCATCGCTGTCCACCCCAGGCTCGGC 518
||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 442 CATCTCTTCACCTTCCCGCCCACCCCGCCGAAAGACGTCTCCCCAGACCCGTCGCTGTCCACCCCGGGATCCGC 515
Query 519 CGGCTCGGCCCGGCAGGACGAGAAAGAGTGCCTCAAGTACCAGGTGCCCCTGCCCGACAGCATGAAGCTGGAGT 592
|||.||||||.||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||..|||||.||.|||||||||||||||.
Sbjct 516 CGGGTCGGCCAGGCAAGATGAGAAAGAGTGCCTCAAGTATCAGGTGCAGCTGCCAGATAGCATGAAGCTGGAGA 589
Query 593 CGTCCCACTCCCGTGGCAGCATGACCGCCCTGGGTGGAGCCTCCTCGTCGACCCACCACCCCATCACCACCTAC 666
||||.|||||.||.||||||||||||.||||||||||.|||||.||.||..|||||||||||||.||||||||.
Sbjct 590 CGTCTCACTCTCGAGGCAGCATGACCACCCTGGGTGGGGCCTCATCCTCAGCCCACCACCCCATTACCACCTAT 663
Query 667 CCGCCCTACGTGCCCGAGTACAGCTCCGGACTCTTCCCCCCCAGCAGCCTGCTGGGCGGCTCCCCCACCGGCTT 740
||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 664 CCGCCCTATGTGCCCGAGTACAGCTCTGGACTCTTCCCACCCAGCAGCCTGCTGGGAGGATCCCCTACCGGGTT 737
Query 741 CGGATGCAAGTCCAGGCCCAAGGCCCGGTCCAGCAC---AGGCAGGGAGTGTGTGAACTGTGGGGCAACCTCGA 811
||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||| |||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 738 CGGATGTAAGTCGAGGCCCAAGGCACGATCCAGCACAGAAGGCAGGGAGTGTGTGAACTGCGGGGCAACCTCTA 811
Query 812 CCCCACTGTGGCGGCGAGATGGCACGGGACACTACCTGTGCAACGCCTGCGGGCTCTATCACAAAATGAACGGA 885
||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||.
Sbjct 812 CCCCACTGTGGCGGCGAGATGGTACCGGGCACTACCTTTGCAATGCCTGCGGACTCTACCATAAAATGAATGGG 885
Query 886 CAGAACCGGCCCCTCATTAAGCCCAAGCGAAGGCTGTCTGCAGCCAGGAGAGCAGGGACGTCCTGTGCGAACTG 959
||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 886 CAGAACCGGCCCCTTATCAAGCCCAAGCGAAGGCTGTCGGCAGCAAGGAGAGCAGGGACATCCTGCGCGAACTG 959
Query 960 TCAGACCACCACAACCACACTCTGGAGGAGGAATGCCAATGGGGACCCTGTCTGCAATGCCTGTGGGCTCTACT 1033
||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 960 TCAGACCACCACCACCACCCTCTGGAGGAGGAACGCTAATGGGGACCCGGTCTGCAATGCCTGTGGGCTGTACT 1033
Query 1034 ACAAGCTTCACAATATTAACAGACCCCTGACTATGAAGAAGGAAGGCATCCAGACCAGAAACCGAAAAATGTCT 1107
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||.||||||
Sbjct 1034 ACAAGCTTCATAATATTAACAGACCCCTGACTATGAAGAAAGAAGGCATCCAGACCCGAAACCGGAAGATGTCT 1107
Query 1108 AGCAAATCCAAAAAGTGCAAAAAAGTGCATGACTCACTGGAGGACTTCCCCAAGAACAGCTCGTTTAACCCGGC 1181
||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||||||.||||||.||.||||||||
Sbjct 1108 AGCAAATCGAAAAAGTGCAAAAAGGTGCATGACGCGCTGGAGGACTTCCCCAAGAGCAGCTCCTTCAACCCGGC 1181
Query 1182 CGCCCTCTCCAGACACATGTCCTCCCTGAGCCACATCTCGCCCTTCAGCCACTCCAGCCACATGCTGACCACGC 1255
|||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1182 CGCTCTCTCCAGACACATGTCATCCCTGAGCCACATCTCTCCCTTCAGCCACTCCAGCCACATGCTGACCACAC 1255
Query 1256 CCACGCCGATGCACCCGCCATCCAGCCTGTCCTTTGGACCACACCACCCCTCCAGCATGGTCACCGCCATGGGT 1329
|.|||||.|||||.|||||.|||.||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 CGACGCCCATGCATCCGCCCTCCGGCCTCTCCTTCGGACCTCACCACCCTTCCAGCATGGTCACCGCCATGGGT 1329