Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479044
• Subject: XM_017025089.2
• Aligned Length: 1083
• Identities: 893
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  ATGGGCACCNAGAAAGAAAGCCCAGAGCCCGACTGCCAGAAACAGTTCCAGGCTGCAGTGAGCGTCATCCAGAA  74
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCACCGAGAAAGAAAGCCCAGAGCCCGACTGCCAGAAACAGTTCCAGGCTGCAGTGAGCGTCATCCAGAA  74

Query   75  CCTGCCCAAGAACGGTTCTTACCGCCCCTCCTATGAAGAGATGCTGCGATTCTACAGTTACTACAAGCAGGCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGCCCAAGAACGGTTCTTACCGCCCCTCCTATGAAGAGATGCTGCGATTCTACAGTTACTACAAGCAGGCCA  148

Query  149  CCATGGGGCCCTGCCTGGTCCCCCGGCCCGGGTTCTGGGACCCCATTGGACGATATAAGTGGGACGCCTGGAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCATGGGGCCCTGCCTGGTCCCCCGGCCCGGGTTCTGGGACCCCATTGGACGATATAAGTGGGACGCCTGGAAC  222

Query  223  AGTCTGGGCAAGATGAGCAGGGAGGAGGCCATGTCTGCCTACATCACTGAAATGAAACTGGTGGCACAGAAGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTCTGGGCAAGATGAGCAGGGAGGAGGCCATGTCTGCCTACATCACTGAAATGAAACTGGTGGCACAGAAGGT  296

Query  297  GATCGACACAGTGCCCCTGGGTGAGGTGGCAGAGGACATGTTTGGTTACTTCGAGCCCCTGTACCAGGTGATCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCGACACAGTGCCCCTGGGTGAGGTGGCAGAGGACATGTTTGGTTACTTCGAGCCCCTGTACCAGGTGATCC  370

Query  371  CTGACATGCCGAGGCCCCCAGAGACCTTCCTGAGAAGGGTCACAGGTTGGAAAGAGCAGGTTGTGAATGGAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGACATGCCGAGGCCCCCAGAGACCTTCCTGAGAAGGGTCACAGGTTGGAAAGAGCAGGTTGTGAATGGAGAT  444

Query  445  GTTGGGGCTGTTTCAGAGCCTCCCTGCCTCCCCAAGGAACCGGCACCCCCAAGCCCAGCTTCCCTCTGGGCAGT  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct  445  GTTGGGGCTGTTTCAGAGCCTCCCTGCCTCCCCAAGGAACCGGCACCCCCAAGCC-------------------  499

Query  519  AACTCTACCAACCCCTCCACAGAGTCCCATTCACCCAGGGACCTGGACTCCGAGGTTTTCTGTGATTCCCTGGA  592
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  500  -------------------CAGAGTCCCATTCACCCAGGGACCTGGACTCCGAGGTTTTCTGTGATTCCCTGGA  554

Query  593  GCAGCTGGAGCCTGAGCT---GGTTTGGACAGAGCAGCGGGCAGCATCTGGAGGAAAGCGTGATCCCAGGAACA  663
            ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  555  GCAGCTGGAGCCTGAGCTGCAGGTTTGGACAGAGCAGCGGGCAGCATCTGGAGGAAAGCGTGATCCCAGGAACA  628

Query  664  GCCCCGTGCCCCCCACAAAGAAAGAGGGGTTGCGGGGCAGCCCGCCGGGGCCCCAGGAGTTGGACGTGTGGCTG  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  629  GCCCCGTGCCCCCCACAAAGAAAGAGGGGTTGCGGGGCAGCCCGCCGGGGCCCCAGGAGTTGGACGTGTGGCTG  702

Query  738  CTGGGGACAGTTCGAGCACTACAGGAGAGCATGCAGGAGGTGCAGGCGAGGGTGCAGAGCCTGGAGAGCATGCC  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  703  CTGGGGACAGTTCGAGCACTACAGGAGAGCATGCAGGAGGTGCAGGCGAGGGTGCAGAGCCTGGAGAGCATGCC  776

Query  812  CCGGCCCCCTGAGCAGAGGCCG---------------CAGCCCAGGCCCAGTG------------CTCGGC-CA  857
            |||||||||||||||||.||.|               |||.|..|    ||||            |||.|| ||
Sbjct  777  CCGGCCCCCTGAGCAGATGCAGTCTCACTCTGTCGGTCAGACTGG----AGTGAAGTGGCGTGAACTCAGCTCA  846

Query  858  -TGGCCCCTTGGGCTCCCGGGG--CCCGCGCTGCTCT---TCTTCCTCCTG------TGGCCCTTC-GTCGTCC  918
             ||...|||..|.|||||.|||  |..||..|.||||   ||..|||||.|      |||...|.| |.||.||
Sbjct  847  CTGCAACCTCCGCCTCCCCGGGTTCAAGCAATTCTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCC  920

Query  919  A---------GTGGCTCTTCCGAATGTTTCGGACCCAAAAGAGGTG-ACTGTCAGTGGA---GGGGTCTCTGCA  979
            |         ..||||      |||.|||             ..|| |.|.|.|||.||   |||||.||    
Sbjct  921  ACCACCATGCCCGGCT------AATTTTT-------------TTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC----  971

Query  980  GCCAACTGAGACTATCTTGCTGTGCC---CTGAGCCTTCCTAGGGTT  1023
                      ||.||||||    |||   ||| |.||          
Sbjct  972  ----------ACCATCTTG----GCCACGCTG-GTCT----------  993