Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479222
• Subject: XM_006537870.3
• Aligned Length: 1032
• Identities: 840
• Gaps: 75

Alignment

Query    1  ATGG-TTATCA--CTCAGCCAGAT---------GAAGCT--TC-------------------TGGTCTG---CT  38
            |||| ||.|.|  |||...|||||         |.||||  ||                   ||| |||   |.
Sbjct    1  ATGGCTTGTGAGCCTCCCACAGATCCTGGTGGGGCAGCTGGTCCCCTGCCCACCTCTACCCTTGG-CTGCAACA  73

Query   39  TCC-------------------------------AGAGCTCCACAATGGCCAGGTCCTCACTGTTCTCCGGATT  81
            |||                               ||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct   74  TCCTGCCTCAGGGGAACCCTCCTGGCTGGGGGCAAGAGCTACACAATGGCCAGGTCCTCACAGTCCTCCGGATC  147

Query   82  GACAATACCTGTGCACCCATCTCCTTCGACCTGGGAGCCGCAGAAGAGCAACTGCAAACTTGGGGCATCCAGGT  155
            |||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||..|.||||||||.|||||
Sbjct  148  GACAATACCTGTGCACCTATCTCCTTTGACCTGGGAGCTGCAGAAGAGCAACTGCAGGCCTGGGGCATTCAGGT  221

Query  156  CCCGGCTGACCAGTACAGGAGCTTGGCTGAGAGTGCCCTCTTGGAGCCCCAAGTGAGAAGATATATCATCTACA  229
            |||.|||||.||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct  222  CCCTGCTGAGCAGTACAGGAACTTGGCTGAGAGTGCCCTTTTGGAACCTCAAGTGAGGAGGTACATCATCTACA  295

Query  230  ACTCGAGGCCTATGCGGCTGGCCTTTGCTGTGGTTTTCTATGTGGTGGTGTGGGCCAATATCTACTCTACCAGT  303
            ||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct  296  ACTCCAGGCCCATGAGGCTGGCCTTTGCTGTGGTGTTCTACGTGTTGGTGTGGGCCAACATCTACTCCACCAGC  369

Query  304  CAGATGTTTGCCTTGGGGAACCACTGGGCTGGCATGCTGCTCGTGACCCTGGCCGCGGTGAGCCTGACCTTGAC  377
            ||.|||||||||.||||.|||||.|||||.|||.|||||||.|.|||||||||.||..|.|||||||||.||||
Sbjct  370  CAAATGTTTGCCCTGGGCAACCAGTGGGCAGGCGTGCTGCTTGCGACCCTGGCTGCTTTCAGCCTGACCCTGAC  443

Query  378  TCTTGTGCTGGTCTTTGAAAGACACCAGAAGAAGGCCAACACCAACACGGACCTGAGGCTGGCAGCTGCCAATG  451
            .|||||||||||||||||.||.||.||||.||||||||||||.|||||.|||||||||||||..||.|||||||
Sbjct  444  CCTTGTGCTGGTCTTTGAGAGGCAGCAGAGGAAGGCCAACACTAACACAGACCTGAGGCTGGTGGCCGCCAATG  517

Query  452  GAGCCCTCCTGAGACACCGGGTGCTGCTGGGGGTGACAGACACAGTGGAAGGATGCCAGAGTGTGATTCAGCTT  525
            |||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  518  GAGCCCTTCTGCGACACCGTGTGCTGCTGGGGGTGACAGACACAGTGGAGGGATGCCAGAGTGTGATCCAGCTC  591

Query  526  TGGTTTGTCTACTTCGACCTGGAGAACTGTGTGCAGTTTTTGTCTGATCATGTTCAAGAAATGAAGACTAGCCA  599
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||..|||||
Sbjct  592  TGGTTTGTCTACTTCGATCTGGAGAACTGTGTGCAGTTTTTGTCCGACCATGTTCAAGAGATGAAGAGGAGCCA  665

Query  600  AGAGTCCTTGCTGAGAAGCAGATTGAGCCAGTTGTGTGTTGTCATGGAGACTGGGGTGAGCCCTGCAACAGCGG  673
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.||||||||||   ..|.||
Sbjct  666  AGAGTCCTTGCTGAGAAGCAGATTGAGCCAGCTGTGCGTTGTCATGGAGACTGGAGTGAGCCCTG---TGGTGG  736

Query  674  AGGGGCCTGAGAACTTGGAGGATGCTCCTCTCCTGCCCGGCAATTCTTGTCCTAACGAGAGGCCACTCATGCAG  747
            |.|||||.|||.|.||||||||||||||.|||||||||.|||.|.||.|||||.|.|||||||||||||..|||
Sbjct  737  AAGGGCCCGAGGATTTGGAGGATGCTCCCCTCCTGCCCAGCACTCCTGGTCCTCAGGAGAGGCCACTCACACAG  810

Query  748  ACTGAGCTTCATCAGCTTGTTCCTGAGGCTGAGCCGGAGGAAATGGCCCGCCAGCTGCTGGCAGTGTTTGGCGG  821
            |||||.||..|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct  811  ACTGAACTCTATCAGCTTGTTCCAGAGGCTGAGCCGGAGGAGATGGCCCGGCAGCTACTGGCAGTGTTTGGTGG  884

Query  822  CTACTACATCCGGCTTCTAGTGACCTCCCAGCTCCCTCAGGCAATGGGGACACGACACACGAACTCTCCGAGAA  895
            ||||||||.||||||.||.||||||||.|.||||||||||.|||||||.||.|||||||.|.|||||.|.||.|
Sbjct  885  CTACTACACCCGGCTCCTGGTGACCTCTCGGCTCCCTCAGTCAATGGGAACGCGACACATGGACTCTGCAAGGA  958

Query  896  TTCCATGCCCCTGCCAGCTCATAGAAGCCTACA--TCCTAGGCACAGGGTGCTGCCCGTTCCTGGCGAGG  963
            |.|||||||||||||||||||||||||  ||||  |.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  959  TCCCATGCCCCTGCCAGCTCATAGAAG--TACACGTTCTGGGCACAGGATGTTGCCCGTTCCTGGCTAGG  1026