Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479222
• Subject: XM_011518352.1
• Aligned Length: 1224
• Identities: 952
• Gaps: 261

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCTGTGAACCACAGGTGGACCCGGGGGCCACTGGCCCATTGCCCCCCTCCTCCCCTGGCTGGAGTGCCCT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCCTGGAGGGAGCCCTCCTGGCTGGGGGCAAGCCGCCATAGAGAATATGCCAAAATATCCAGTCCTCAGCAGTG  148

Query    1  ------------------------------------------------------------------ATGGTTAT  8
                                                                              .||.|.|.
Sbjct  149  CATGGCTGAAACCTGGGATCCTAGAATCCCAGGGCTGGAATCTCTCCCACCCCCCAGACCTCCTGGCTGCTGAC  222

Query    9  CA----CTCA----GCC------------------AGAT---GAAGCTTCTGGTCTGCTTC-------------  40
            ||    ||||    |||                  ||||   ||..|||.||..|.|.|||             
Sbjct  223  CAGTGGCTCACAGGGCCTTGTACTGTGGTGCAAGGAGATCTCGATCCTTTTGTCCAGTTTCTCTACTTGGAACT  296

Query   41  -----CAGAGCTCCACAATGGCCAGGTCCTCACTGTTCTCCGGATTGACAATACCTGTGCACCCATCTCCTTCG  109
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGGCAGAGCTCCACAATGGCCAGGTCCTCACTGTTCTCCGGATTGACAATACCTGTGCACCCATCTCCTTCG  370

Query  110  ACCTGGGAGCCGCAGAAGAGCAACTGCAAACTTGGGGCATCCAGGTCCCGGCTGACCAGTACAGGAGCTTGGCT  183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACCTGGGAGCCGCAGAAGAGCAACTGCAAACTTGGGGCATCCAGGTCCCGGCTGACCAGTACAGGAGCTTGGCT  444

Query  184  GAGAGTGCCCTCTTGGAGCCCCAAGTGAGAAGATATATCATCTACAACTCGAGGCCTATGCGGCTGGCCTTTGC  257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGAGTGCCCTCTTGGAGCCCCAAGTGAGAAGATATATCATCTACAACTCGAGGCCTATGCGGCTGGCCTTTGC  518

Query  258  TGTGGTTTTCTATGTGGTGGTGTGGGCCAATATCTACTCTACCAGTCAGATGTTTGCCTTGGGGAACCACTGGG  331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTGGTTTTCTATGTGGTGGTGTGGGCCAATATCTACTCTACCAGTCAGATGTTTGCCTTGGGGAACCACTGGG  592

Query  332  CTGGCATGCTGCTCGTGACCCTGGCCGCGGTGAGCCTGACCTTGACTCTTGTGCTGGTCTTTGAAAGACACCAG  405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGGCATGCTGCTCGTGACCCTGGCCGCGGTGAGCCTGACCTTGACTCTTGTGCTGGTCTTTGAAAGACACCAG  666

Query  406  AAGAAGGCCAACACCAACACGGACCTGAGGCTGGCAGCTGCCAATGGAGCCCTCCTGAGACACCGGGTGCTGCT  479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGAAGGCCAACACCAACACGGACCTGAGGCTGGCAGCTGCCAATGGAGCCCTCCTGAGACACCGGGTGCTGCT  740

Query  480  GGGGGTGACAGACACAGTGGAAGGATGCCAGAGTGTGATTCAGCTTTGGTTTGTCTACTTCGACCTGGAGAACT  553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGGGGTGACAGACACAGTGGAAGGATGCCAGAGTGTGATTCAGCTTTGGTTTGTCTACTTCGACCTGGAGAACT  814

Query  554  GTGTGCAGTTTTTGTCTGATCATGTTCAAGAAATGAAGACTAGCCAAGAGTCCTTGCTGAGAAGCAGATTGAGC  627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGTGCAGTTTTTGTCTGATCATGTTCAAGAAATGAAGACTAGCCAAGAGTCCTTGCTGAGAAGCAGATTGAGC  888

Query  628  CAGTTGTGTGTTGTCATGGAGACTGGGGTGAGCCCTGCAACAGCGGAGGGGCCTGAGAACTTGGAGGATGCTCC  701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGTTGTGTGTTGTCATGGAGACTGGGGTGAGCCCTGCAACAGCGGAGGGGCCTGAGAACTTGGAGGATGCTCC  962

Query  702  TCTCCTGCCCGGCAATTCTTGTCCTAACGAGAGGCCACTCATGCAGACTGAGCTTCATCAGCTTGTTCCTGAGG  775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCTCCTGCCCGGCAATTCTTGTCCTAACGAGAGGCCACTCATGCAGACTGAGCTTCATCAGCTTGTTCCTGAGG  1036

Query  776  CTGAGCCGGAGGAAATGGCCCGCCAGCTGCTGGCAGTGTTTGGCGGCTACTACATCCGGCTTCTAGTGACCTCC  849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGAGCCGGAGGAAATGGCCCGCCAGCTGCTGGCAGTGTTTGGCGGCTACTACATCCGGCTTCTAGTGACCTCC  1110

Query  850  CAGCTCCCTCAGGCAATGGGGACACGACACACGAACTCTCCGAGAATTCCATGCCCCTGCCAGCTCATAGAAGC  923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGCTCCCTCAGGCAATGGGGACACGACACACGAACTCTCCGAGAATTCCATGCCCCTGCCAGCTCATAGAAGC  1184

Query  924  CTACATCCTAGGCACAGGGTGCTGCCCGTTCCTGGCGAGG  963
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTACATCCTAGGCACAGGGTGCTGCCCGTTCCTGGCGAGG  1224