Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479222
• Subject: XM_011518353.1
• Aligned Length: 1227
• Identities: 841
• Gaps: 375

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCTGTGAACCACAGGTGGACCCGGGGGCCACTGGCCCATTGCCCCCCTCCTCCCCTGGCTGGAGTGCCCT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCCTGGAGGGAGCCCTCCTGGCTGGGGGCAAGCCGCCATAGAGAATATGCCAAAATATCCAGTCCTCAGCAGTG  148

Query    1  ------------------------------------------------------------------ATGGTTAT  8
                                                                              .||.|.|.
Sbjct  149  CATGGCTGAAACCTGGGATCCTAGAATCCCAGGGCTGGAATCTCTCCCACCCCCCAGACCTCCTGGCTGCTGAC  222

Query    9  CA----CTCA----GCC------------------AGAT---GAAGCTTCTGGTCTGCTTC-------------  40
            ||    ||||    |||                  ||||   ||..|||.||..|.|.|||             
Sbjct  223  CAGTGGCTCACAGGGCCTTGTACTGTGGTGCAAGGAGATCTCGATCCTTTTGTCCAGTTTCTCTACTTGGAACT  296

Query   41  -----CAGAGCTCCACAATGGCCAGGTCCTCACTGTTCTCCGGATTGACAATACCTGTGCACCCATCTCCTTCG  109
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGGCAGAGCTCCACAATGGCCAGGTCCTCACTGTTCTCCGGATTGACAATACCTGTGCACCCATCTCCTTCG  370

Query  110  ACCTGGGAGCCGCAGAAGAGCAACTGCAAACTTGGGGCATC---CAGGTCCCGGCTGACCAGTACAGGAGCTTG  180
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACCTGGGAGCCGCAGAAGAGCAACTGCAAACTTGGGGCATCCAGCAGGTCCCGGCTGACCAGTACAGGAGCTTG  444

Query  181  GCTGAGAGTGCCCTCTTGGAGCCCCAAGTGAGAAGATATATCATCTACAACTCGAGGCCTATGCGGCTGGCCTT  254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTGAGAGTGCCCTCTTGGAGCCCCAAGTGAGAAGATATATCATCTACAACTCGAGGCCTATGCGGCTGGCCTT  518

Query  255  TGCTGTGGTTTTCTATGTGGTGGTGTGGGCCAATATCTACTCTACCAGTCAGATGTTTGCCTTGGGGAACCACT  328
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCTGTGGTTTTCTATGTGGTGGTGTGGGCCAATATCTACTCTACCAGTCAGATGTTTGCCTTGGGGAACCACT  592

Query  329  GGGCTGGCATGCTGCTCGTGACCCTGGCCGCGGTGAGCCTGACCTTGACTCTTGTGCTGGTCTTTGAAAGACAC  402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGCTGGCATGCTGCTCGTGACCCTGGCCGCGGTGAGCCTGACCTTGACTCTTGTGCTGGTCTTTGAAAGACAC  666

Query  403  CAGAAGAAGGCCAACACCAACACGGACCTGAGGCTGGCAGCTGCCAATGGAGCCCTCCTGAGACACCGGGTGCT  476
            |||||||                                                                   
Sbjct  667  CAGAAGA-------------------------------------------------------------------  673

Query  477  GCTGGGGGTGACAGACACAGTGGAAGGATGCCAGAGTGTGATTCAGCTTTGGTTTGTCTACTTCGACCTGGAGA  550
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  674  --------------------------------------------AGCTTTGGTTTGTCTACTTCGACCTGGAGA  703

Query  551  ACTGTGTGCAGTTTTTGTCTGATCATGTTCAAGAAATGAAGACTAGCCAAGAGTCCTTGCTGAGAAGCAGATTG  624
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  704  ACTGTGTGCAGTTTTTGTCTGATCATGTTCAAGAAATGAAGACTAGCCAAGAGTCCTTGCTGAGAAGCAGATTG  777

Query  625  AGCCAGTTGTGTGTTGTCATGGAGACTGGGGTGAGCCCTGCAACAGCGGAGGGGCCTGAGAACTTGGAGGATGC  698
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  778  AGCCAGTTGTGTGTTGTCATGGAGACTGGGGTGAGCCCTGCAACAGCGGAGGGGCCTGAGAACTTGGAGGATGC  851

Query  699  TCCTCTCCTGCCCGGCAATTCTTGTCCTAACGAGAGGCCACTCATGCAGACTGAGCTTCATCAGCTTGTTCCTG  772
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  852  TCCTCTCCTGCCCGGCAATTCTTGTCCTAACGAGAGGCCACTCATGCAGACTGAGCTTCATCAGCTTGTTCCTG  925

Query  773  AGGCTGAGCCGGAGGAAATGGCCCGCCAGCTGCTGGCAGTGTTTGGCGGCTACTACATCCGGCTTCTAGTGACC  846
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  926  AGGCTGAGCCGGAGGAAATGGCCCGCCAGCTGCTGGCAGTGTTTGGCGGCTACTACATCCGGCTTCTAGTGACC  999

Query  847  TCCCAGCTCCCTCAGGCAATGGGGACACGACACACGAACTCTCCGAGAATTCCATGCCCCTGCCAGCTCATAGA  920
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1000  TCCCAGCTCCCTCAGGCAATGGGGACACGACACACGAACTCTCCGAGAATTCCATGCCCCTGCCAGCTCATAGA  1073

Query  921  AGCCTACATCCTAGGCACAGGGTGCTGCCCGTTCCTGGCGAGG  963
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074  AGCCTACATCCTAGGCACAGGGTGCTGCCCGTTCCTGGCGAGG  1116