Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479295
- Subject:
- XR_941575.2
- Aligned Length:
- 2655
- Identities:
- 1935
- Gaps:
- 719
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GGAGCTCGGCAGGGTGGGGGAAAGGGATGGAGTTTCGGCCTGGGGCGGCGGGGGCGGCCCAGAAAAGGCCTAGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GTCCTGGGCTGTGTGGGTGTAGCGTCCAGGGCGCGTCGGTCTCTATGGCAACGCTCCACACGCGGAGGTCGGGT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 ACGGTTATCTGTGGCCACAAAGAAAGTTATTTGTCTCTGTCTTGGCAAGGCTGGGAGGAAAGTTTTAGCTAAGA 222
Query 1 --------------------ATGGATAAGTACGATGCGATTAAGGCCATCGGGCAAGGTGCCTTCGGGAAAGCA 54
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AACTCAGCCCATTGGAGACCATGGATAAGTACGATGTGATTAAGGCCATCGGGCAAGGTGCCTTCGGGAAAGCA 296
Query 55 TACTTAGCTAAAGGGAAATCAGATAGCAAGCACTGTGTCATAAAAGAGATCAATTTTGAAAAGATGCCCATACA 128
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TACTTAGCTAAAGGGAAATCAGATAGCAAGCACTGTGTCATAAAAGAGATCAATTTTGAAAAGATGCCCATACA 370
Query 129 AGAAAAAGAAGCTTCAAAGAAAGAAGTGATTCTTCTGGAAAAGATGAAACATCCCAACATTGTAGCCTTCTTCA 202
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGAAAAAGAAGCTTCAAAGAAAGAAGTGATTCTTCTGGAAAAGATGAAACATCCCAACATTGTAGCCTTCTTCA 444
Query 203 ATTCATTTCAAGAGAATGGCAGGCTGTTTATTGTAATGGAATATTGTGATGGAGGGGATCTCATGAAAAGGATC 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATTCATTTCAAGAGAATGGCAGGCTGTTTATTGTAATGGAATATTGTGATGGAGGGGATCTCATGAAAAGGATC 518
Query 277 AATAGACAACGGGGTGTGTTATTTAGTGAAGATCAGATCCTCGGTTGGTTTGTACAGATTTCTCTAGGACTAAA 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AATAGACAACGGGGTGTGTTATTTAGTGAAGATCAGATCCTCGGTTGGTTTGTACAGATTTCTCTAGGACTAAA 592
Query 351 ACATATTCATGACAGGAAGATATTACACAGGGACATAAAAGCTCAGAACATTTTTCTTAGCAAGAACGGAATGG 424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACATATTCATGACAGGAAGATATTACACAGGGACATAAAAGCTCAGAACATTTTTCTTAGCAAGAACGGAATGG 666
Query 425 TGGCAAAGCTTGGGGACTTTGGTATAGCAAGAGTCCTGAATAATTCCATGGAACTTGCTCGAACTTGTATTGGA 498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TGGCAAAGCTTGGGGACTTTGGTATAGCAAGAGTCCTGAATAATTCCATGGAACTTGCTCGAACTTGTATTGGA 740
Query 499 ACACCTTACTACCTGTCCCCAGAGATCTGTCAGAATAAACCCTACAACAATAAAACGGATATTTGGTCTCTTGG 572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACACCTTACTACCTGTCCCCAGAGATCTGTCAGAATAAACCCTACAACAATAAAACGGATATTTGGTCTCTTGG 814
Query 573 CTGTGTCTTATATGAGCTCTGCACACTTAAACATCCTTTTGAGGGTAACAACTTACAGCAGCTGGTTCTGAAGA 646
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTGTGTCTTATATGAGCTCTGCACACTTAAACATCCTTTTGAGGGTAACAACTTACAGCAGCTGGTTCTGAAGA 888
Query 647 TTTGTCAAGCACATTTTGCCCCAATATCTCCGGGGTTTTCTCGTGAGCTCCATTCCTTGATATCTCAGCTCTTT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTTGTCAAGCACATTTTGCCCCAATATCTCCGGGGTTTTCTCGTGAGCTCCATTCCTTGATATCTCAGCTCTTT 962
Query 721 CAAGTATCTCCTCGAGACCGACCATCCATAAATTCCATTTTGAAAAGGCCCTTTTTAGAGAATCTTATTCCCAA 794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAAGTATCTCCTCGAGACCGACCATCCATAAATTCCATTTTGAAAAGGCCCTTTTTAGAGAATCTTATTCCCAA 1036
Query 795 ATATTTGACTCCTGAGGTCATTCAGGAAGAATTCAGTCACATGCTTATATGCAGAGCAGGAGCGCCAGCTTCTC 868
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATATTTGACTCCTGAGGTCATTCAGGAAGAATTCAGTCACATGCTTATATGCAGAGCAGGAGCGCCAGCTTCTC 1110
Query 869 GACATGCTGGGAAGGTGGTCCAGAAGTGTAAAATACAAAAAGTGAGATTCCAGGGAAAGTGCCCACCAAGATCA 942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GACATGCTGGGAAGGTGGTCCAGAAGTGTAAAATACAAAAAGTGAGATTCCAGGGAAAGTGCCCACCAAGATCA 1184
Query 943 AGGATATCTGTGCCAATTAAAAGGAATGCTATATTGCATAGAAATGAATGGAGACCACCAGCTGGAGCCCAGAA 1016
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGGATATCTGTGCCAATTAAAAGGAATGCTATATTGCATAGAAATGAATGGAGACCACCAGCTGGAGCCCAGAA 1258
Query 1017 GGCCAGATCTATAAAAATGATAGAAAGACCCAAAATTGCTGCTGTCTGTGGACATTATGATTATTATTATGCTC 1090
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGCCAGATCTATAAAAATGATAGAAAGACCCAAAATTGCTGCTGTCTGTGGACATTATGATTATTATTATGCTC 1332
Query 1091 AACTTGATATGCTGAGGAGGAGAGCCCACAAACCAAGTTATCACCCTATTCCTCAAGAAAATACTGGAGTTGAG 1164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AACTTGATATGCTGAGGAGGAGAGCCCACAAACCAAGTTATCACCCTATTCCTCAAGAAAATACTGGAGTTGAG 1406
Query 1165 GATTACGGTCAGGAAACGAGGCATGGTCCATCCCCAAGTCAATGGCCTGCTGAGTACCTTCAGAGAAAATTTGA 1238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GATTACGGTCAGGAAACGAGGCATGGTCCATCCCCAAGTCAATGGCCTGCTGAGTACCTTCAGAGAAAATTTGA 1480
Query 1239 AGCTCAACAATATAAGTTGAAAGTGGAGAAGCAATTGGGTCTTCGTCCATCTTCTGCCGAGCCAAATTACAACC 1312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGCTCAACAATATAAGTTGAAAGTGGAGAAGCAATTGGGTCTTCGTCCATCTTCTGCCGAGCCAAATTACAACC 1554
Query 1313 AGAGACAAGAGCTAAGAAGTAATGGAGAAGAGCCTAGATTCCAGGAGCTGCCATTTAGGAAAAACGAAATGAAG 1386
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGAGACAAGAGCTAAGAAGTAATGGAGAAGAGCCTAGATTCCAGGAGCTGCCATTTAGGAAAAACGAAATGAAG 1628
Query 1387 GAACAGGAATATTGGAAGCAGTTAGAGGAAATACGCCAACAGTACCACAATGACATGAAAGAAATTAGAAAGAA 1460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GAACAGGAATATTGGAAGCAGTTAGAGGAAATACGCCAACAGTACCACAATGACATGAAAGAAATTAGAAAGAA 1702
Query 1461 GATGGGGAGAGAACCAGAGGAGAACTCAAAAATAAGTCATAAAACCTATTTGGTGAAGAAGAGTAACCTGCCTG 1534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GATGGGGAGAGAACCAGAGGAGAACTCAAAAATAAGTCATAAAACCTATTTGGTGAAGAAGAGTAACCTGCCTG 1776
Query 1535 TCCATCAAGATGCATCTGAGGGAGAAGCACCTGTGCAGATGGAATTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCA 1608
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TCCATCAAGATGCATCTGAGGGAGAAGCACCTGTG--------------------------------------- 1811
Query 1609 ATGGCACGATCTTGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCCAGGACATTGAAAAAGACTTGAAACAAATGAGGCTTCA 1682
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1812 ------------------------------------CAGGACATTGAAAAAGACTTGAAACAAATGAGGCTTCA 1849
Query 1683 GAACACAAAGGAAAGTAAAAATCCAGAACAGAAATATAAAGCTAAGAAGGGGGTAAAATTTGAAATTAATTTAG 1756
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 GAACACAAAGGAAAGTAAAAATCCAGAACAGAAATATAAAGCTAAGAAGGGGGTAAAATTTGAAATTAATTTAG 1923
Query 1757 ACAAATGTATTTCTGATGAAAACATCCTCCAAGAGGAAGAGGCAATGGATATACCAAATGAAACTTTGACCTTT 1830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924 ACAAATGTATTTCTGATGAAAACATCCTCCAAGAGGAAGAGGCAATGGATATACCAAATGAAACTTTGACCTTT 1997
Query 1831 GAGGATGGCATGAAGTTTAAGGAATATGAATGTGTAAAGGAGCATGGAGATTATACAGACAAAGCATTTGAAAA 1904
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1998 GAGGATGGCATGAAGTTTAAGGAATATGAATGTGTAAAGGAGCATGGAGATTATACAGACAAAGCATTTGAAAA 2071
Query 1905 ACTTCACTGCCCAGAAGC-------------------------------------------------------- 1922
||||||||||||||||||
Sbjct 2072 ACTTCACTGCCCAGAAGCAGCATTTACAGAACTGACTTGGCTCAGTTTCCTCTTCCTGGAATACTCTCTGCCTC 2145
Query 1923 -------------------------------------------------------------------------- 1922
Sbjct 2146 ATTTCCTTCTGGAAAAATCTCCATTCAGCAGGCATCTTATTGAGGATCTCCTTTGTGCCAAAGACTGCTCACTG 2219
Query 1923 -------------------------------------------------------------------------- 1922
Sbjct 2220 AAGGACTGGAGTGAGAAGGAAATGGAGCTTAGGACATAACCCTACCACTATATAAACAAACTTTGGAGAATCAG 2293
Query 1923 -------------------------------------------------------------------------- 1922
Sbjct 2294 GAGAGAGTAAAGCCAAAGGAGGAGAGACAGGTCATGGAGGAGGCACAGGAATTGGCAGCATCAACTGGAAGAGA 2367
Query 1923 -----------AGGGTTTTCCACGCAGACTGTAGCTGCTGTGGGAAACAGGAGGCAGTGGGATGGAGGAGCGCC 1985
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2368 AAGGCCAGATGAGGGTTTTCCACGCAGACTGTAGCTGCTGTGGGAAACAGGAGGCAGTGGGATGGAGGAGCGCC 2441
Query 1986 TCAGACTCTGCTGCAGATGATGGCAGTGGCCGACATCACCTCCACCTGCCCCACGGGGCCTGACAGTGAGTCTG 2059
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2442 TCAGACTCTGCTGCAGATGATGGCAG------------------------------------------------ 2467
Query 2060 TGCTTAGCGTCAGTCGTCAGGAAGGGAAGACCAAGGACCCGTACAGCCCAGTGCTCATCCTGATG 2124
Sbjct 2468 ----------------------------------------------------------------- 2467