Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479326
- Subject:
- XM_011523240.1
- Aligned Length:
- 2070
- Identities:
- 1662
- Gaps:
- 408
Alignment
Query 1 ATGGGTGGGCACCTGTCCCCATGGCCCACATACACCAGTGGCCAGACCATTTTGCAAAATCGAAAACCCTGTTC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AGATGACTACCGGAAGCGAGTAGGGAGCTGCCAGCAGCACCCCTTTCGCACTGCCAAGCCCCAGTACTTGGAGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AACTGGAAAACTACCTACGCAAGGAGCTCCTCCTGCTGGACCTGGGCACAGATTCCACCCAGGAACTAAGGCTG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CAGCCTTACAGAGAGATCTTTGAGTTCTTCATAGAGGACTTCAAAACGTACAAGCCATTACTATCCTCCATCAA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GAATGCGTATGAGGGGATGCTGGCCCACCAAAGGGAGAAGATTCGGGCTCTGGAGCCCCTGAAGGCCAAGCTTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------------ATGCTGGCCCACCAAAGGGAGAAGATTCGGGCTCTGGAGCCCCTGAAGGCCAAGCTTG 58
Query 371 TCACTGTGAATGAGGACTGCAATGAGAGGATCCTGGCCATGAGAGCTGAGGAGAAATATGAAATCTCCCTGCTC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 59 TCACTGTGAATGAGGACTGCAATGAGAGGATCCTGGCCATGAGAGCTGAGGAGAAATATGAAATCTCCCTGCTC 132
Query 445 AAGAAAGAGAAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGAGGAGAAGATTTCATTGCAGAGCGAGGT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 133 AAGAAAGAGAAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGAGGAGAAGATTTCATTGCAGAGCGAGGT 206
Query 519 GACCAAACTGAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCAGTGAGCGAGATGCCTGTAAGATCCTCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 207 GACCAAACTGAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCAGTGAGCGAGATGCCTGTAAGATCCTCA 280
Query 593 TCGCAGACCTGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTAGCCCAGTCGCCAGGCATCTGGGGGGAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 281 TCGCAGACCTGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTAGCCCAGTCGCCAGGCATCTGGGGGGAG 354
Query 667 GACCCTGTGAAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCTGACCCGCACGCAGATGGAACTCAACAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355 GACCCTGTGAAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCTGACCCGCACGCAGATGGAACTCAACAA 428
Query 741 CATGAAGGCCAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAATGCAGGAGAAGACCAACAAGGATCTTC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 429 CATGAAGGCCAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAATGCAGGAGAAGACCAACAAGGATCTTC 502
Query 815 AGGAG---------------------CAGCTGGACACCCTGAGAGCCAGCTACGAGGAGGTTCGCAAGGAGCAT 867
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 503 AGGAGCAGGGCCAATGTCCTTGCCCACAGCTGGACACCCTGAGAGCCAGCTACGAGGAGGTTCGCAAGGAGCAT 576
Query 868 GAGATCCTCATGCAGCTGCACATGAGCACGCTGAAGGAACGGGACCAATTCTTCTCTGAGCTGCAGGAGATCCA 941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 577 GAGATCCTCATGCAGCTGCACATGAGCACGCTGAAGGAACGGGACCAATTCTTCTCTGAGCTGCAGGAGATCCA 650
Query 942 GCGCACTTCCACGCCGCGGCCTGACTGGACCAAGTGCAA----------------------------------- 980
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 651 GCGCACTTCCACGCCGCGGCCTGACTGGACCAAGTGCAAAGGTGAGGGCAGCCGGCAGGGCCCCAGGTCCTGCT 724
Query 981 ----------------------------------------AGATGTGGTGGCTGGGGGCCCAGAGCGCTGGCAG 1014
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 725 TACATGTGGGCCCAGACTCCAGCTCCCTCTCCCCACATGCAGATGTGGTGGCTGGGGGCCCAGAGCGCTGGCAG 798
Query 1015 ATGCTGGCTGAGGGCAAGAACAGCGACCAGCTGGTGGACGTGCTCCTGGAAGAGATTGGTTCGGGGCTGCTGCG 1088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 799 ATGCTGGCTGAGGGCAAGAACAGCGACCAGCTGGTGGACGTGCTCCTGGAAGAGATTGGTTCGGGGCTGCTGCG 872
Query 1089 GGAGAAAGACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTATGGGGAAGCCATCCCTGCTTTTCTTCGGTTTGATGGCCTCGTGG 1162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 873 GGAGAAAGACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTATGGGGAAGCCATCCCTGCTTTTCTTCGGTTTGATGGCCTCGTGG 946
Query 1163 AGAACAAGAAGCCAAGCAAGAAGGACGTGGTCAACCTCCTCAAGGATGCCTGGAAGGAACGTCTTGCTGAGGAG 1236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 947 AGAACAAGAAGCCAAGCAAGAAGGACGTGGTCAACCTCCTCAAGGATGCCTGGAAGGAACGTCTTGCTGAGGAG 1020
Query 1237 CAGAAAGAGACGTTCCCAGATTTCTTCTTCAATTTCCTGGAGCATCGCTTTGGGCCCAGTGATGCCATGGCCTG 1310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 CAGAAAGAGACGTTCCCAGATTTCTTCTTCAATTTCCTGGAGCATCGCTTTGGGCCCAGTGATGCCATGGCCTG 1094
Query 1311 GGCTTATACTATTTTTGAAAATATCAAGATCTTCCACTCCAACGAGGTTATGAGTCAGTTCTATGCAGTCTTGA 1384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095 GGCTTATACTATTTTTGAAAATATCAAGATCTTCCACTCCAACGAGGTTATGAGTCAGTTCTATGCAGTCTTGA 1168
Query 1385 TGGGAAAGCGGAGTGAGAATGTGTATGTCACCCAGAAGGAGACAGTAGCCCAGCTGCTGAAGGAGATGACAAAT 1458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169 TGGGAAAGCGGAGTGAGAATGTGTATGTCACCCAGAAGGAGACAGTAGCCCAGCTGCTGAAGGAGATGACAAAT 1242
Query 1459 GCTGACAGTCAGAACGAGGGGCTACTAACCATGGAGCAGTTCAACACTGTCCTCAAGAGTACCTTCCCTCTCAA 1532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243 GCTGACAGTCAGAACGAGGGGCTACTAACCATGGAGCAGTTCAACACTGTCCTCAAGAGTACCTTCCCTCTCAA 1316
Query 1533 GACAGAAGAGCAAATCCAGGAGCTGATGGAGGCAGGGGGCTGGCATCCCAGCAGCAGCAATGCAGACTTGCTCA 1606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317 GACAGAAGAGCAAATCCAGGAGCTGATGGAGGCAGGGGGCTGGCATCCCAGCAGCAGCAATGCAGACTTGCTCA 1390
Query 1607 ACTACCGCTCACTGTTTATGGAGGATGAGGAGGGCCAGAGTGAGCCCTTTGTGCAAAAACTCTGGGAACAATAC 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391 ACTACCGCTCACTGTTTATGGAGGATGAGGAGGGCCAGAGTGAGCCCTTTGTGCAAAAACTCTGGGAACAATAC 1464
Query 1681 ATGGATGAGAAGGACGAGTACTTACAGCAGCTAAAGCAGGAGCTTGGCATAGAACTCCATGAGGAAGTGACTCT 1754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1465 ATGGATGAGAAGGACGAGTACTTACAGCAGCTAAAGCAGGAGCTTGGCATAGAACTCCATGAGGAAGTGACTCT 1538
Query 1755 GCCCAAGCTGCGAGGGGGCCTGATGACCATCGACCCCAGCCTGGACAAGCAGACAGTGAACACCTACATGAGCC 1828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1539 GCCCAAGCTGCGAGGGGGCCTGATGACCATCGACCCCAGCCTGGACAAGCAGACAGTGAACACCTACATGAGCC 1612
Query 1829 AGGCCTTCCAGCTCCCTGAGTCGGAAATGCCAGAGGAGGGTGACGAGAAGGAAGAAGCCGTGGTGGAAATCCTC 1902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1613 AGGCCTTCCAGCTCCCTGAGTCGGAAATGCCAGAGGAGGGTGACGAGAAGGAAGAAGCCGTGGTGGAAATCCTC 1686
Query 1903 CAGACTGCCCTGGAGCGGCTTCAGGTGATTGACATCAGGCGTGTGGGACCTCGAGAGCCAGAGCCTGCAAGC 1974
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1687 CAGACTGCCCTGGAGCGGCTTCAGGTGATTGACATCAGGCGTGTGGGACCTCGAGAGCCAGAGCCTGCAAGC 1758