Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479326
• Subject: XM_017023448.1
• Aligned Length: 2001
• Identities: 1800
• Gaps: 156

Alignment

Query    1  ATGGGTGGGCAC---CTGTCCCCATGGCCCACATACACCAG-TGGCCAGACCATTTTGCAAAATCGAAAACCCT  70
                .|||..||   ||||.|.|          |||..||| |..||||.||                  .|..
Sbjct    1  ----ATGGCGACCGGCTGTACGC----------TACCACAGCTTCCCAGGCC------------------GCGG  42

Query   71  GTTCAGATGACTACCGGAAGCGAGTAGG----GAGCTGCCAGCAGCACCCCTTTCGCACTGCCAAGCCCCAGTA  140
            ||.|.|||..|  |||...||..||.||    |..||||||||||        ||||..|.|||     |||  
Sbjct   43  GTGCTGATTGC--CCGCCTGCCCGTGGGTCATGGCCTGCCAGCAG--------TCGCGGTACCA-----CAG--  99

Query  141  CTTGGAGGAACTGGAAAACTACCTACGCAAGGAGCTCCTCCTGC-TGGACCTGGGCACAGATTCCACCCAGGAA  213
            |||                               |||.||| || |.|          |||||.||.|||    
Sbjct  100  CTT-------------------------------CTCGTCC-GCGTCG----------AGATTACAGCCA----  127

Query  214  CTAAGGCTGCAGCCTTACAGAGAGATCTTTGAGTTCTTCATAGAGGA---CTT-----CAAAACGTACAAG---  276
                     |.||||| ||| |||     |||     .||||||.||   |||     ||.||  .|||||   
Sbjct  128  ---------CGGCCTT-CAG-GAG-----TGA-----CCATAGACGAATCCTTTCTCACAGAA--GACAAGAGC  178

Query  277  --CCATTACTATC-----CTCCATCAAGAATGCGTATGAGGGGATGCTGGCCCACCAAAGGGAGAAGATTCGGG  343
              ||   |..|||     ||.|.|||..||  ||.|     |||.||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  179  ACCC---AGAATCGCAAGCTTCTTCAGAAA--CGAA-----GGACGCT-GCCCACCAAAGGGAGAAGATTCGGG  241

Query  344  CTCTGGAGCCCCTGAAGGCCAAGCTTGTCACTGTGAATGAGGACTGCAATGAGAGGATCCTGGCCATGAGAGCT  417
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  242  CTCTGGAGCCCCTGAAGGCCAAGCTTGTCACTGTGAATGAGGACTGCAATGAGAGGATCCTGGCCATGAGAGCT  315

Query  418  GAGGAGAAATATGAAATCTCCCTGCTCAAGAAAGAGAAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGA  491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  316  GAGGAGAAATATGAAATCTCCCTGCTCAAGAAAGAGAAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGA  389

Query  492  GGAGAAGATTTCATTGCAGAGCGAGGTGACCAAACTGAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCA  565
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  390  GGAGAAGATTTCATTGCAGAGCGAGGTGACCAAACTGAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCA  463

Query  566  GTGAGCGAGATGCCTGTAAGATCCTCATCGCAGACCTGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTA  639
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  464  GTGAGCGAGATGCCTGTAAGATCCTCATCGCAGACCTGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTA  537

Query  640  GCCCAGTCGCCAGGCATCTGGGGGGAGGACCCTGTGAAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCT  713
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  538  GCCCAGTCGCCAGGCATCTGGGGGGAGGACCCTGTGAAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCT  611

Query  714  GACCCGCACGCAGATGGAACTCAACAACATGAAGGCCAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAA  787
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  612  GACCCGCACGCAGATGGAACTCAACAACATGAAGGCCAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAA  685

Query  788  TGCAGGAGAAGACCAACAAGGATCTTCAGGAGCAGCTGGACACCCTGAGAGCCAGCTACGAGGAGGTTCGCAAG  861
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  686  TGCAGGAGAAGACCAACAAGGATCTTCAGGAGCAGCTGGACACCCTGAGAGCCAGCTACGAGGAGGTTCGCAAG  759

Query  862  GAGCATGAGATCCTCATGCAGCTGCACATGAGCACGCTGAAGGAACGGGACCAATTCTTCTCTGAGCTGCAGGA  935
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  760  GAGCATGAGATCCTCATGCAGCTGCACATGAGCACGCTGAAGGAACGGGACCAATTCTTCTCTGAGCTGCAGGA  833

Query  936  GATCCAGCGCACTTCCACGCCGCGGCCTGACTGGACCAAGTGCAAAGATGTGGTGGCTGGGGGCCCAGAGCGCT  1009
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  834  GATCCAGCGCACTTCCACGCCGCGGCCTGACTGGACCAAGTGCAAAGATGTGGTGGCTGGGGGCCCAGAGCGCT  907

Query 1010  GGCAGATGCTGGCTGAGGGCAAGAACAGCGACCAGCTGGTGGACGTGCTCCTGGAAGAGATTGGTTCGGGGCTG  1083
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  908  GGCAGATGCTGGCTGAGGGCAAGAACAGCGACCAGCTGGTGGACGTGCTCCTGGAAGAGATTGGTTCGGGGCTG  981

Query 1084  CTGCGGGAGAAAGACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTATGGGGAAGCCATCCCTGCTTTTCTTCGGTTTGATGGCCT  1157
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  982  CTGCGGGAGAAAGACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTATGGGGAAGCCATCCCTGCTTTTCTTCGGTTTGATGGCCT  1055

Query 1158  CGTGGAGAACAAGAAGCCAAGCAAGAAGGACGTGGTCAACCTCCTCAAGGATGCCTGGAAGGAACGTCTTGCTG  1231
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1056  CGTGGAGAACAAGAAGCCAAGCAAGAAGGACGTGGTCAACCTCCTCAAGGATGCCTGGAAGGAACGTCTTGCTG  1129

Query 1232  AGGAGCAGAAAGAGACGTTCCCAGATTTCTTCTTCAATTTCCTGGAGCATCGCTTTGGGCCCAGTGATGCCATG  1305
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130  AGGAGCAGAAAGAGACGTTCCCAGATTTCTTCTTCAATTTCCTGGAGCATCGCTTTGGGCCCAGTGATGCCATG  1203

Query 1306  GCCTGGGCTTATACTATTTTTGAAAATATCAAGATCTTCCACTCCAACGAGGTTATGAGTCAGTTCTATGCAGT  1379
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204  GCCTGGGCTTATACTATTTTTGAAAATATCAAGATCTTCCACTCCAACGAGGTTATGAGTCAGTTCTATGCAGT  1277

Query 1380  CTTGATGGGAAAGCGGAGTGAGAATGTGTATGTCACCCAGAAGGAGACAGTAGCCCAGCTGCTGAAGGAGATGA  1453
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1278  CTTGATGGGAAAGCGGAGTGAGAATGTGTATGTCACCCAGAAGGAGACAGTAGCCCAGCTGCTGAAGGAGATGA  1351

Query 1454  CAAATGCTGACAGTCAGAACGAGGGGCTACTAACCATGGAGCAGTTCAACACTGTCCTCAAGAGTACCTTCCCT  1527
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1352  CAAATGCTGACAGTCAGAACGAGGGGCTACTAACCATGGAGCAGTTCAACACTGTCCTCAAGAGTACCTTCCCT  1425

Query 1528  CTCAAGACAGAAGAGCAAATCCAGGAGCTGATGGAGGCAGGGGGCTGGCATCCCAGCAGCAGCAATGCAGACTT  1601
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1426  CTCAAGACAGAAGAGCAAATCCAGGAGCTGATGGAGGCAGGGGGCTGGCATCCCAGCAGCAGCAATGCAGACTT  1499

Query 1602  GCTCAACTACCGCTCACTGTTTATGGAGGATGAGGAGGGCCAGAGTGAGCCCTTTGTGCAAAAACTCTGGGAAC  1675
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500  GCTCAACTACCGCTCACTGTTTATGGAGGATGAGGAGGGCCAGAGTGAGCCCTTTGTGCAAAAACTCTGGGAAC  1573

Query 1676  AATACATGGATGAGAAGGACGAGTACTTACAGCAGCTAAAGCAGGAGCTTGGCATAGAACTCCATGAGGAAGTG  1749
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1574  AATACATGGATGAGAAGGACGAGTACTTACAGCAGCTAAAGCAGGAGCTTGGCATAGAACTCCATGAGGAAGTG  1647

Query 1750  ACTCTGCCCAAGCTGCGAGGGGGCCTGATGACCATCGACCCCAGCCTGGACAAGCAGACAGTGAACACCTACAT  1823
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1648  ACTCTGCCCAAGCTGCGAGGGGGCCTGATGACCATCGACCCCAGCCTGGACAAGCAGACAGTGAACACCTACAT  1721

Query 1824  GAGCCAGGCCTTCCAGCTCCCTGAGTCGGAAATGCCAGAGGAGGGTGACGAGAAGGAAGAAGCCGTGGTGGAAA  1897
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1722  GAGCCAGGCCTTCCAGCTCCCTGAGTCGGAAATGCCAGAGGAGGGTGACGAGAAGGAAGAAGCCGTGGTGGAAA  1795

Query 1898  TCCTCCAGACTGCCCTGGAGCGGCTTCAGGTGATTGACATCAGGCGTGTGGGACCTCGAGAGCCAGAGCCTGCA  1971
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1796  TCCTCCAGACTGCCCTGGAGCGGCTTCAGGTGATTGACATCAGGCGTGTGGGACCTCGAGAGCCAGAGCCTGCA  1869

Query 1972  AGC  1974
            |||
Sbjct 1870  AGC  1872