Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479326
• Subject: XM_017023453.1
• Aligned Length: 1974
• Identities: 1566
• Gaps: 408

Alignment

Query    1  ATGGGTGGGCACCTGTCCCCATGGCCCACATACACCAGTGGCCAGACCATTTTGCAAAATCGAAAACCCTGTTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGATGACTACCGGAAGCGAGTAGGGAGCTGCCAGCAGCACCCCTTTCGCACTGCCAAGCCCCAGTACTTGGAGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AACTGGAAAACTACCTACGCAAGGAGCTCCTCCTGCTGGACCTGGGCACAGATTCCACCCAGGAACTAAGGCTG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CAGCCTTACAGAGAGATCTTTGAGTTCTTCATAGAGGACTTCAAAACGTACAAGCCATTACTATCCTCCATCAA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GAATGCGTATGAGGGGATGCTGGCCCACCAAAGGGAGAAGATTCGGGCTCTGGAGCCCCTGAAGGCCAAGCTTG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TCACTGTGAATGAGGACTGCAATGAGAGGATCCTGGCCATGAGAGCTGAGGAGAAATATGAAATCTCCCTGCTC  444
                                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------------ATGAGAGCTGAGGAGAAATATGAAATCTCCCTGCTC  36

Query  445  AAGAAAGAGAAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGAGGAGAAGATTTCATTGCAGAGCGAGGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   37  AAGAAAGAGAAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGAGGAGAAGATTTCATTGCAGAGCGAGGT  110

Query  519  GACCAAACTGAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCAGTGAGCGAGATGCCTGTAAGATCCTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  111  GACCAAACTGAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCAGTGAGCGAGATGCCTGTAAGATCCTCA  184

Query  593  TCGCAGACCTGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTAGCCCAGTCGCCAGGCATCTGGGGGGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  185  TCGCAGACCTGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTAGCCCAGTCGCCAGGCATCTGGGGGGAG  258

Query  667  GACCCTGTGAAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCTGACCCGCACGCAGATGGAACTCAACAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  259  GACCCTGTGAAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCTGACCCGCACGCAGATGGAACTCAACAA  332

Query  741  CATGAAGGCCAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAATGCAGGAGAAGACCAACAAGGATCTTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  333  CATGAAGGCCAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAATGCAGGAGAAGACCAACAAGGATCTTC  406

Query  815  AGGAGCAGCTGGACACCCTGAGAGCCAGCTACGAGGAGGTTCGCAAGGAGCATGAGATCCTCATGCAGCTGCAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  407  AGGAGCAGCTGGACACCCTGAGAGCCAGCTACGAGGAGGTTCGCAAGGAGCATGAGATCCTCATGCAGCTGCAC  480

Query  889  ATGAGCACGCTGAAGGAACGGGACCAATTCTTCTCTGAGCTGCAGGAGATCCAGCGCACTTCCACGCCGCGGCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  ATGAGCACGCTGAAGGAACGGGACCAATTCTTCTCTGAGCTGCAGGAGATCCAGCGCACTTCCACGCCGCGGCC  554

Query  963  TGACTGGACCAAGTGCAAAGATGTGGTGGCTGGGGGCCCAGAGCGCTGGCAGATGCTGGCTGAGGGCAAGAACA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  555  TGACTGGACCAAGTGCAAAGATGTGGTGGCTGGGGGCCCAGAGCGCTGGCAGATGCTGGCTGAGGGCAAGAACA  628

Query 1037  GCGACCAGCTGGTGGACGTGCTCCTGGAAGAGATTGGTTCGGGGCTGCTGCGGGAGAAAGACTTCTTCCCTGGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  629  GCGACCAGCTGGTGGACGTGCTCCTGGAAGAGATTGGTTCGGGGCTGCTGCGGGAGAAAGACTTCTTCCCTGGT  702

Query 1111  CTGGGCTATGGGGAAGCCATCCCTGCTTTTCTTCGGTTTGATGGCCTCGTGGAGAACAAGAAGCCAAGCAAGAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  703  CTGGGCTATGGGGAAGCCATCCCTGCTTTTCTTCGGTTTGATGGCCTCGTGGAGAACAAGAAGCCAAGCAAGAA  776

Query 1185  GGACGTGGTCAACCTCCTCAAGGATGCCTGGAAGGAACGTCTTGCTGAGGAGCAGAAAGAGACGTTCCCAGATT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  777  GGACGTGGTCAACCTCCTCAAGGATGCCTGGAAGGAACGTCTTGCTGAGGAGCAGAAAGAGACGTTCCCAGATT  850

Query 1259  TCTTCTTCAATTTCCTGGAGCATCGCTTTGGGCCCAGTGATGCCATGGCCTGGGCTTATACTATTTTTGAAAAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  851  TCTTCTTCAATTTCCTGGAGCATCGCTTTGGGCCCAGTGATGCCATGGCCTGGGCTTATACTATTTTTGAAAAT  924

Query 1333  ATCAAGATCTTCCACTCCAACGAGGTTATGAGTCAGTTCTATGCAGTCTTGATGGGAAAGCGGAGTGAGAATGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  925  ATCAAGATCTTCCACTCCAACGAGGTTATGAGTCAGTTCTATGCAGTCTTGATGGGAAAGCGGAGTGAGAATGT  998

Query 1407  GTATGTCACCCAGAAGGAGACAGTAGCCCAGCTGCTGAAGGAGATGACAAATGCTGACAGTCAGAACGAGGGGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  999  GTATGTCACCCAGAAGGAGACAGTAGCCCAGCTGCTGAAGGAGATGACAAATGCTGACAGTCAGAACGAGGGGC  1072

Query 1481  TACTAACCATGGAGCAGTTCAACACTGTCCTCAAGAGTACCTTCCCTCTCAAGACAGAAGAGCAAATCCAGGAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073  TACTAACCATGGAGCAGTTCAACACTGTCCTCAAGAGTACCTTCCCTCTCAAGACAGAAGAGCAAATCCAGGAG  1146

Query 1555  CTGATGGAGGCAGGGGGCTGGCATCCCAGCAGCAGCAATGCAGACTTGCTCAACTACCGCTCACTGTTTATGGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1147  CTGATGGAGGCAGGGGGCTGGCATCCCAGCAGCAGCAATGCAGACTTGCTCAACTACCGCTCACTGTTTATGGA  1220

Query 1629  GGATGAGGAGGGCCAGAGTGAGCCCTTTGTGCAAAAACTCTGGGAACAATACATGGATGAGAAGGACGAGTACT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1221  GGATGAGGAGGGCCAGAGTGAGCCCTTTGTGCAAAAACTCTGGGAACAATACATGGATGAGAAGGACGAGTACT  1294

Query 1703  TACAGCAGCTAAAGCAGGAGCTTGGCATAGAACTCCATGAGGAAGTGACTCTGCCCAAGCTGCGAGGGGGCCTG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1295  TACAGCAGCTAAAGCAGGAGCTTGGCATAGAACTCCATGAGGAAGTGACTCTGCCCAAGCTGCGAGGGGGCCTG  1368

Query 1777  ATGACCATCGACCCCAGCCTGGACAAGCAGACAGTGAACACCTACATGAGCCAGGCCTTCCAGCTCCCTGAGTC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1369  ATGACCATCGACCCCAGCCTGGACAAGCAGACAGTGAACACCTACATGAGCCAGGCCTTCCAGCTCCCTGAGTC  1442

Query 1851  GGAAATGCCAGAGGAGGGTGACGAGAAGGAAGAAGCCGTGGTGGAAATCCTCCAGACTGCCCTGGAGCGGCTTC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1443  GGAAATGCCAGAGGAGGGTGACGAGAAGGAAGAAGCCGTGGTGGAAATCCTCCAGACTGCCCTGGAGCGGCTTC  1516

Query 1925  AGGTGATTGACATCAGGCGTGTGGGACCTCGAGAGCCAGAGCCTGCAAGC  1974
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1517  AGGTGATTGACATCAGGCGTGTGGGACCTCGAGAGCCAGAGCCTGCAAGC  1566