Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479556
• Subject: XM_006539728.3
• Aligned Length: 1413
• Identities: 1246
• Gaps: 45

Alignment

Query    1  ATGTCGGACTTCGACGAGTTCGAGCGGCAGCTCAACGAGAATAAACAAGAGCGGGACAAGGAGAACCGGCATCG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|
Sbjct    1  ATGTCGGACTTCGACGAGTTCGAGCGGCAGCTCAACGAGAATAAACAAGAGCGGGACAAGGAGAATCGGCACAG  74

Query   75  GAAGCGCAGCCACAGCCGCTCTCGGAGCCGGGACCGCAAACGCCGGAGCCGGAGCCGCGACCGGCGCAACCGGG  148
            ||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||.|||||.|||||||.||.|||||||||||||
Sbjct   75  GAAGCGTAGTCACAGTCGCTCTCGAAGCCGAGATCGAAAGCGCAGGAGCAGGAGCCGAGATCGGCGCAACCGGG  148

Query  149  ACCAGCGGAGCGCCTCCCGGGACAGGCGACGACGCAGCAAACCTTTGACCAGAGGCGCTAAAGAGGAGCACGGT  222
            |||||||.||.|||||.|||||.|||.|||||||.||                                     
Sbjct  149  ACCAGCGCAGTGCCTCTCGGGATAGGAGACGACGAAG-------------------------------------  185

Query  223  GGACTGATTCGTTCCCCCCGCCACGAGAAGAAGAAGAAGGTCCGTAAATACTGGGACGTGCCACCCCCAGGCTT  296
                    ||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  186  --------TCGTTCTCCCCGCCATGAGAAGAAGAAGAAGGTGCGTAAATACTGGGACGTGCCACCGCCTGGCTT  251

Query  297  TGAGCACATCACCCCAATGCAGTACAAGGCCATGCAAGCTGCGGGTCAGATTCCAGCCACTGCTCTTCTCCCCA  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  252  TGAGCACATCACCCCAATGCAGTACAAGGCCATGCAAGCTGCGGGTCAGATTCCAGCCACTGCCCTTCTCCCGA  325

Query  371  CCATGACCCCTGACGGTCTGGCTGTGACCCCAACGCCGGTGCCCGTGGTCGGGAGCCAGATGACCAGACAAGCC  444
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  326  CCATGACTCCTGATGGTCTGGCTGTGACCCCAACGCCAGTGCCTGTGGTTGGGAGCCAGATGACCAGACAGGCC  399

Query  445  CGGCGCCTCTACGTGGGCAACATCCCCTTTGGCATCACTGAGGAGGCCATGATGGATTTCTTCAACGCCCAGAT  518
            .|.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  400  AGACGTCTCTACGTGGGCAACATCCCTTTTGGCATTACTGAGGAGGCTATGATGGACTTCTTCAACGCCCAGAT  473

Query  519  GCGCCTGGGGGGGCTGACCCAGGCCCCTGGCAACCCAGTGTTGGCTGTGCAGATTAACCAGGACAAGAATTTTG  592
            ||||.||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct  474  GCGCTTGGGAGGGTTGACTCAGGCCCCTGGCAACCCAGTCTTGGCTGTGCAGATAAATCAAGACAAGAATTTTG  547

Query  593  CCTTTTTGGAGTTCCGCTCAGTGGACGAGACTACCCAGGCTATGGCCTTTGATGGCATCATCTTCCAGGGCCAG  666
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  548  CCTTTTTGGAGTTCCGGTCAGTGGATGAGACGACCCAGGCCATGGCATTTGATGGCATCATCTTCCAGGGCCAG  621

Query  667  TCACTAAAGATCCGCAGGCCTCACGACTACCAGCCGCTTCCTGGCATGTCAGAGAACCCCTCCGTCTATGTGCC  740
            |||.|.|||||.||.||||||||.|||||.|||||..|.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  622  TCATTGAAGATTCGAAGGCCTCATGACTATCAGCCATTGCCTGGCATGTCAGAGAACCCCTCTGTTTATGTGCC  695

Query  741  TGGGGTTGTGTCCACTGTGGTCCCCGACTCTGCCCACAAGCTGTTCATCGGGGGCTTACCCAACTACCTGAACG  814
            |||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|
Sbjct  696  TGGAGTTGTATCCACTGTAGTCCCAGATTCTGCCCACAAGCTGTTCATCGGGGGTTTGCCCAATTACCTAAATG  769

Query  815  ATGACCAGGTCAAAGAGCTGCTGACATCCTTTGGGCCCCTCAAGGCCTTCAACCTGGTCAAGGACAGTGCCACG  888
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||.|||||.||||||||.
Sbjct  770  ATGACCAGGTAAAAGAGCTGCTGACATCCTTTGGGCCTCTCAAGGCCTTCAACTTGGTTAAGGATAGTGCCACA  843

Query  889  GGGCTCTCCAAGGGCTACGCCTTCTGTGAGTACGTGGACATCAACGTCACGGATCAGGCCATTGCGGGGCTGAA  962
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  844  GGGCTCTCCAAGGGCTATGCCTTCTGTGAGTACGTGGACATCAACGTCACAGATCAGGCCATTGCGGGGCTGAA  917

Query  963  CGGCATGCAGCTGGGGGATAAGAAGCTGCTGGTCCAGAGGGCGAGTGTGGGAGCCAAGAATGCCACGCTGAGCA  1036
            .||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  918  TGGGATGCAGCTAGGGGACAAGAAGCTGCTTGTCCAGAGGGCGAGTGTGGGAGCCAAGAATGCCACGCTGAGCA  991

Query 1037  CCATCAATCAGACGCCTGTGACCCTGCAAGTGCCGGGCTTGATGAGCTCCCAGGTGCAGATGGGCGGCCACCCG  1110
            |||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  992  CCATCAATCAGACACCTGTGACCCTTCAAGTGCCCGGCCTGATGAGCTCTCAGGTGCAGATGGGCGGTCACCCA  1065

Query 1111  ACTGAGGTCCTGTGCCTCATGAACATGGTGCTGCCTGAGGAGCTGCTGGACGACGAGGAGTATGAGGAGATCGT  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1066  ACTGAGGTCCTGTGCCTCATGAACATGGTGCTGCCTGAGGAGCTGCTGGACGATGAGGAGTATGAGGAGATTGT  1139

Query 1185  GGAGGATGTGCGGGACGAGTGCAGCAAGTACGGGCTTGTCAAGTCCATCGAGATCCCCCGGCCTGTGGACGGCG  1258
            .|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||.|.|||||.|||||.||.||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 1140  AGAGGACGTACGAGACGAGTGCAGCAAGTATGGGTTGGTCAAATCCATTGAAATTCCCCGCCCCGTGGACGGCG  1213

Query 1259  TCGAGGTGCCCGGCTGCGGAAAGATCTTTGTGGAGTTCACCTCTGTGTTTGACTGCCAGAAAGCCATGCAGGGC  1332
            ||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1214  TCGAGGTGCCTGGCTGTGGAAAGATCTTCGTGGAGTTCACCTCTGTGTTTGACTGCCAGAAAGCCATGCAGGGT  1287

Query 1333  CTGACGGGCCGCAAGTTCGCCAACAGAGTGGTTGTCACAAAATACTGTGACCCCGACTCTTATCACCGCCGGGA  1406
            ||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 1288  CTAACCGGTCGCAAGTTCGCCAACAGAGTGGTGGTCACAAAATACTGTGACCCTGATTCTTACCACCGTCGGGA  1361

Query 1407  CTTCTGG  1413
            |||||||
Sbjct 1362  CTTCTGG  1368