Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479742
• Subject: XM_017028903.1
• Aligned Length: 1576
• Identities: 1145
• Gaps: 428

Alignment

Query    1  ATGAAGCCTCACTTCAGAAACACAGTGGAGCGAATGTATCGAGACACATTCTCCTACAACTTTTATAATAGACC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGCCTCACTTCAGAAACACAGTGGAGCGAATGTATCGAGACACATTCTCCTACAACTTTTATAATAGACC  74

Query   75  CATCCTTTCTCGTCGGAATACCGTCTGGCTGTGCTACGAAGTGAAAACAAAGGGTCCCTCAAGGCCCCCTTTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATCCTTTCTCGTCGGAATACCGTCTGGCTGTGCTACGAAGTGAAAACAAAGGGTCCCTCAAGGCCCCCTTTGG  148

Query  149  ACGCAAAGATCTTTCGAGGCCAGGTGTATTCCGAACTTAAGTACCACCCAGAGATGAGATTCTTCCACTGGTTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACGCAAAGATCTTTCGAGGCCAGGTGTATTCCGAACTTAAGTACCACCCAGAGATGAGATTCTTCCACTGGTTC  222

Query  223  AGCAAGTGGAGGAAGCTGCATCGTGACCAGGAGTATGAGGTCACCTGGTACATATCCTGGAGCCCCTGCACAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCAAGTGGAGGAAGCTGCATCGTGACCAGGAGTATGAGGTCACCTGGTACATATCCTGGAGCCCCTGCACAAA  296

Query  297  GTGTACAAGGGATATGGCCACGTTCCTGGCCGAGGACCCGAAGGTTACCCTGACCATCTTTGTTGCCCGCCTCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTGTACAAGGGATATGGCCACGTTCCTGGCCGAGGACCCGAAGGTTACCCTGACCATCTTTGTTGCCCGCCTCT  370

Query  371  ACTACTTCTGGGACCCAGATTACCAGGAGGCGCTTCGCAGCCTGTGTCAGAAAAGAGACGGTCCGCGTGCCACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACTACTTCTGGGACCCAGATTACCAGGAGGCGCTTCGCAGCCTGTGTCAGAAAAGAGACGGTCCGCGTGCCACC  444

Query  445  ATGAAGATCATGAATTATGACGAATTTCAGCACTGTTGGAGCAAGTTCGTGTACAGCCAAAGAGAGCTATTTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGAAGATCATGAATTATGACGAATTTCAGCACTGTTGGAGCAAGTTCGTGTACAGCCAAAGAGAGCTATTTGA  518

Query  519  GCCTTGGAATAATCTGCCTAAATATTATATATTACTGCACATCATGCTGGGGGAGATTCTCAGACACTCGATGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCTTGGAATAATCTGCCTAAATATTATATATTACTGCACATCATGCTGGGGGAGATTCTCAGACACTCGATGG  592

Query  593  ATCCACCCACATTCACTTTCAACTTTAACAATGAACCTTGGGTCAGAGGACGGCATGAGACTTACCTGTGTTAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATCCACCCACATTCACTTTCAACTTTAACAATGAACCTTGGGTCAGAGGACGGCATGAGACTTACCTGTGTTAT  666

Query  667  GAGGTGGAGCGCATGCACAATGACACCTGGGTCCTGCTGAACCAGCGCAGGGGCTTTCTATGCAACCAGGCTCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGGTGGAGCGCATGCACAATGACACCTGGGTCCTGCTGAACCAGCGCAGGGGCTTTCTATGCAACCAGGCTCC  740

Query  741  ACATAAACACGGTTTCCTTGAAGGCCGCCATGCAGAGCTGTGCTTCCTGGACGTGATTCCCTTTTGGAAGCTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACATAAACACGGTTTCCTTGAAGGCCGCCATGCAGAGCTGTGCTTCCTGGACGTGATTCCCTTTTGGAAGCTGG  814

Query  815  ACCTGGACCAGGACTACAGGGTTACCTGCTTCACCTCCTGGAGCCCCTGCTTCAGCTGTGCCCAGGAAATGGCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCTGGACCAGGACTACAGGGTTACCTGCTTCACCTCCTGGAGCCCCTGCTTCAGCTGTGCCCAGGAAATGGCT  888

Query  889  AAATTCATTTCAAAAAACAAACACGTGAGCCTGTGCATCTTCACTGCCCGCATCTATGATGATCAAGGAAGATG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAATTCATTTCAAAAAACAAACACGTGAGCCTGTGCATCTTCACTGCCCGCATCTATGATGATCAAGGAAGATG  962

Query  963  TCAGGAGGGGCTGCGCACCCTGGCCGAGGCTGGGGCCAAAATTTCAATAATGACATACAGTGAATTTAAGCACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCAGGAGGGGCTGCGCACCCTGGCCGAGGCTGGGGCCAAAATTTCAATAATGACATACAGTGAATTTAAGCACT  1036

Query 1037  GCTGGGACACCTTTGTGGACCACCAGGGATGTCCCTTCCAGCCCTGGGATGGACTAGATGAGCACAGCCAAGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCTGGGACACCTTTGTGGACCACCAGGGATGTCCCTTCCAGCCCTGGGATGGACTAGATGAGCACAGCCAAGAC  1110

Query 1111  CTGAGTGGGAGGCTGCGGGCCATTCTCCAGAATCAGGAAAAC--------------------------------  1152
            |||||||||||||||||||||||||||||| .|.|||   .|                                
Sbjct 1111  CTGAGTGGGAGGCTGCGGGCCATTCTCCAG-GTGAGG---GCTTCTTCCCTCTGCCCAGTGCCCCATCGGCCTC  1180

Query 1153  --------------------------------------------------------------------------  1152
                                                                                      
Sbjct 1181  CCCCTCCTCCCCTCTCCCCTGCGCCGTGCCTTCCCCTCTGCTCAGAGCCTCCTCTGGGTTCCCTGCTCCCCCAG  1254

Query 1153  --------------------------------------------------------------------------  1152
                                                                                      
Sbjct 1255  GGCACCTGTCTCTGTCCCTCCCTTTCCTTCTCACAGCCTCCCTTTCTCTCCCACCTCCCACATCCCTCCCTCCT  1328

Query 1153  --------------------------------------------------------------------------  1152
                                                                                      
Sbjct 1329  CTCCGATCATTGTCACTGTCCCCAGGCCTCCACCATATGCCTACTTTCCACTCGCTCACCCTTTGCTCCATTCA  1402

Query 1153  --------------------------------------------------------------------------  1152
                                                                                      
Sbjct 1403  ACCTCCCTGCTCTTCCAGAATCAGGAAAACTGAAGGATGGGCCTCAGTCTCTAAGGAAGGCAGAGACCTGGGTT  1476

Query 1153  --------------------------------------------------------------------------  1152
                                                                                      
Sbjct 1477  GAGCCTCAGAATAAAAGATCTTCTTCCAAGAAATGCAAACAGGCTGTTCACCACCATCTCCAGCTGATCACAGA  1550

Query 1153  ----------------------  1152
                                  
Sbjct 1551  CACCAGCAAAGCAATGCACTCC  1572