Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479982
- Subject:
- XR_926220.3
- Aligned Length:
- 1718
- Identities:
- 1263
- Gaps:
- 419
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AAACACACAAGACGCCGGAGCTTCACAAGGGAGCGAACGAGGGTGTTTATAAGAATGGAAGTGTTGTTTCCTTG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCCGATTCCTTCATGCTATATCTCATGAACCTCTGTAATCTTGGGGGAGAGACTATATTTAATGATGACAAACC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TGTCACCAGTGTAGCAACAACAGTGTGAGGACAAAAGCAAATAAAAATTAAGAAGCGTTCAAATTTATATTCAA 222
Query 1 ------------------------------------------------ATGAACCGATACACAACCATGAGACA 26
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAAGGAAGTCATTTCAATCAACAACTTCTGCTGCATTATTTTTCCAAGATGAACCGATACACAACCATGAGACA 296
Query 27 GTTGGGGGACGGCACGTATGGGAGTGTGCTTATGGGCAAGAGTAATGAATCCGGGGAGCTGGTGGCCATCAAAA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GTTGGGGGACGGCACGTATGGGAGTGTGCTTATGGGCAAGAGTAATGAATCCGGGGAGCTGGTGGCCATCAAAA 370
Query 101 GGATGAAGAGAAAGTTCTATTCTTGGGATGAATGCATGAACTTGAGAGAAGTTAAGTCTCTGAAGAAACTTAAT 174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGATGAAGAGAAAGTTCTATTCTTGGGATGAATGCATGAACTTGAGAGAAGTTAAGTCTCTGAAGAAACTTAAT 444
Query 175 CATGCCAATGTTATTAAATTGAAAGAAGTTATCAGAGAAAATGACCATCTTTATTTTATATTTGAATATATGAA 248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CATGCCAATGTTATTAAATTGAAAGAAGTTATCAGAGAAAATGACCATCTTTATTTTATATTTGAATATATGAA 518
Query 249 AGAAAACCTCTATCAATTAATGAAAGACAGAAACAAGTTGTTCCCTGAATCAGTCATCAGAAATATTATGTATC 322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGAAAACCTCTATCAATTAATGAAAGACAGAAACAAGTTGTTCCCTGAATCAGTCATCAGAAATATTATGTATC 592
Query 323 AAATATTGCAAGGGCTGGCTTTTATCCATAAACATGGCTTTTTTCATAGGGACATGAAACCAGAAAACTTGCTT 396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAATATTGCAAGGGCTGGCTTTTATCCATAAACATGGCTTTTTTCATAGGGACATGAAACCAGAAAACTTGCTT 666
Query 397 TGTATGGGTCCAGAGCTTGTGAAAATTGCTGATTTTGGACTTGCAAGAGAATTAAGGTCACAGCCACCATACAC 470
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TGTATGGGTCCAGAGCTTGTGAAAATTGCTGATTTTGGACTTGCAAGAGAATTAAGGTCACAGCCACCATACAC 740
Query 471 TGATTATGTATCTACCAGATGGTATCGTGCCCCTGAAGTTTTACTGAGATCTTCAGTTTATAGTTCTCCCATTG 544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGATTATGTATCTACCAGATGGTATCGTGCCCCTGAAGTTTTACTGAGATCTTCAGTTTATAGTTCTCCCATTG 814
Query 545 ATGTGTGGGCTGTTGGAAGTATCATGGCTGAACTCTATATGTTAAGGCCACTTTTCCCAGGGACAAGTGAGGTC 618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATGTGTGGGCTGTTGGAAGTATCATGGCTGAACTCTATATGTTAAGGCCACTTTTCCCAGGGACAAGTGAGGTC 888
Query 619 GATGAAATCTTTAAAATTTGCCAAGTTTTAGGGACTCCCAAAAAAAGTGACTGGCCAGAAGGATACCAGCTGGC 692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GATGAAATCTTTAAAATTTGCCAAGTTTTAGGGACTCCCAAAAAAAGTGACTGGCCAGAAGGATACCAGCTGGC 962
Query 693 ATCCTCTATGAACTTCCGTTTTCCCCAGTGTGTTCCTATAAACTTAAAAACTCTTATTCCCAATGCCAGTAATG 766
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ATCCTCTATGAACTTCCGTTTTCCCCAGTGTGTTCCTATAAACTTAAAAACTCTTATTCCCAATGCCAGTAATG 1036
Query 767 AAGCTATTCAGCTCATGACCGAAATGTTGAATTGGGATCCAAAGAAACGACCGACAGCAAGCCAGGCATTGAAA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAGCTATTCAGCTCATGACCGAAATGTTGAATTGGGATCCAAAGAAACGACCGACAGCAAGCCAGGCATTGAAA 1110
Query 841 CACCCATATTTTCAAGTTGGTCAGGTATTAGGCCCTTCGTCAAATCATCTGGAATCAAAACAGTCTTTAAATAA 914
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CACCCATATTTTCAAGTTGGTCAGGTATTAGGCCCTTCGTCAAATCATCTGGAATCAAAACAGTCTTTAAATAA 1184
Query 915 GCAGCTGCAACCATTAGAATCAAAGCCATCTTTAGTTGAGGTAGAGCCTAAGCCTCTGCCGGATATAATCGATC 988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCAGCTGCAACCATTAGAATCAAAGCCATCTTTAGTTGAGGTAGAGCCTAAGCCTCTGCCGGATATAATCGATC 1258
Query 989 AGGTTGTTGGACAACCCCAGCCAAAAACTAGCCAGCAGCCACTGCAGCCCATTCAGCCGCCACAGAACCTGAGC 1062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGGTTGTTGGACAACCCCAGCCAAAAACTAGCCAGCAGCCACTGCAGCCCATTCAGCCGCCACAGAACCTGAGC 1332
Query 1063 GTCCAGCAACCTCCAAAGCAACAGAGTCAGGAGAAACCGCCACAAACGCTATTCCCGAGCATCGTCAAAAACAT 1136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTCCAGCAACCTCCAAAGCAACAGAGTCAGGAGAAACCGCCACAAACGCTATTCCCGAGCATCGTCAAAAACAT 1406
Query 1137 GCCAACT-------AAGCCAAATGGCACACTGAGTCATAAA---------AGTGG----TAGGAG-------GC 1183
||||||| .||||| |.||.||.||.|...|| ||.|| .|.||| ||
Sbjct 1407 GCCAACTGCTTCCAGAGCCA----GTACCCTCAGGCTCCAACCACTCGACAGGGGAAAACAAGAGCTTACCTGC 1476
Query 1184 -GTTGGGGTCAGACTATCTTCAAGTCTG-----GAGAT----AGCTG----------------GGAAGAGTTGG 1231
||| |||..|.|.||.|||| || || |.||| |.|..|.|||.
Sbjct 1477 TGTT--------ACTTCCCTAAAATCTGATTCCGA-ATTGTCAACTGCTCCAACCTCTAAACAGTACTACTTGA 1541
Query 1232 AGGACTAT---GATTTCGGAGCCTCCC--------ATTCCAAGAAGCCAAGCATGGGTGTTTTTAA-----AGA 1289
| ||.|| |||.| ||.|| ||.||||||| |||||..||.| ||.
Sbjct 1542 A--ACAATCAAGATAT------CTTCCAGGTGTGAATCCCAAGAA----------GGTGTCCTTGATAGCCAGT 1597
Query 1290 AAAAAGGAAA-AAAGATTCTCCATTTCGTCAACAGGTGAAGATGGCTGTTATTTCCCTCTC----AGCACACCA 1358
..|||||||| ||| || |||.|.| |||| ||||
Sbjct 1598 GGAAAGGAAATAAA------CC--------------------------------CCCACACTTGGAGCA-ACCA 1632
Query 1359 G---TTTCCCACGTTA 1371
| ||.||||.||
Sbjct 1633 GTTATTCCCCAAGT-- 1646