Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480501
• Subject: XM_017314255.1
• Aligned Length: 1983
• Identities: 1837
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC  74
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGTCAAGCTGCAGCCCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC  74

Query   75  CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTGATG  148
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  AACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCTACTGATG  148

Query  149  TCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCC  222
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  TCAGCTATACTCAGGCTCAGACCACTGCCACCTACGGGCAGACTGCATATGCAACTTCTTACGGACAGCCTCCC  222

Query  223  ACTGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTATGA  296
            ||||||||||..||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||
Sbjct  223  ACTGGTTATAGCACTCCAACTGCCCCGCAGGCGTACAGCCAGCCTGTGCAGGGATATGGCACTGGGACTTATGA  296

Query  297  TACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTGCTT  370
            .|.|||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  297  CAGCACCACTGCTACAGTCACCACAACGCAGGCCTCTTACGCAGCTCAGACTGCATATGGCACCCAGCCTGCCT  370

Query  371  ATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGAAACAAGCCCACTGAGACT  444
            |.||..|||||||.|||||||||.|||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||..||||||||
Sbjct  371  ACCCCACCTATGGCCAGCAGCCAACAGCCACCGCACCTACCAGACCACAGGATGGTAACAAGCCTGCTGAGACT  444

Query  445  AGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAACCCAGCCTAGGATATGGACAGAGTAACTACAGTTATCC  518
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  AGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTATAACCAACCCAGCCTAGGATATGGACAGAGTAACTACAGCTATCC  518

Query  519  CCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTATTCCTCTA  592
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.
Sbjct  519  CCAGGTACCTGGGAGCTACCCAATGCAGCCAGTCACCGCACCTCCATCTTATCCTCCTACCAGCTACTCCTCTT  592

Query  593  CACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGACAG  666
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  593  CACAGCCGACTAGTTACGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAGCCGAGCAGCTATGGACAA  666

Query  667  CAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATCCTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct  667  CAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCTACTAGTTACCCCCCTCAGACTGGATCCTA  740

Query  741  CAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTTCATTCCGACAGGACCACC  814
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGCCAGGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTTCATTCCGACAGGACCACC  814

Query  815  CCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAGAACCGGAGCATGAGTGGC  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  815  CCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAGAACCGGAGCTTGAGTGGC  888

Query  889  CCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGGTGGGCGGGGAGGAGGACG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGGTGGGCGGGGAGGAGGACG  962

Query  963  CGGTGGAATGGGCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCATGGATGAAGGACCAGATCTTG  1036
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGGTGGACTGGGCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCATGGATGAAGGACCAGATCTTG  1036

Query 1037  ATCTAGGCCCACCTGTAGATCCAGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTATGTACAAGGATTAAATGACAGT  1110
            |||||||||..|||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|
Sbjct 1037  ATCTAGGCCTTCCTATAGATCCCGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTATGTGCAAGGATTAAATGACAAT  1110

Query 1111  GTGACTCTAGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTTAAGATGAACAAGAGAACTGGGCAACC  1184
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111  GTGACTCTGGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTCAAGATGAACAAGAGAACTGGACAACC  1184

Query 1185  CATGATCCACATCTACCTGGACAAGGAAACAGGAAAGCCCAAAGGCGATGCCACAGTGTCCTATGAAGACCCAC  1258
            |||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1185  CATGATCCATATCTACCTGGATAAGGAGACAGGAAAGCCTAAAGGGGACGCCACAGTGTCCTATGAAGATCCAC  1258

Query 1259  CCACTGCCAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGGAGCAAACTTAAAGTCTCCCTTGCT  1332
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1259  CAACTGCAAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGAAGCAAACTTAAAGTGTCTCTTGCC  1332

Query 1333  CGGAAGAAGCCTCCAATGAACAGTATGCGGGGTGGTCTGCCACCCCGTGAGGGCAGAGGCATGCCACCACCACT  1406
            ||.||||||||||||||||||||.||||||||.||..|||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1333  CGAAAGAAGCCTCCAATGAACAGCATGCGGGGAGGCATGCCACCTCGTGAGGGCAGGGGGATGCCACCACCACT  1406

Query 1407  CCGTGGAGGTCCAGGAGGCCCAGGAGGTCCTGGGGGACCCATGGGTCGCATGGGAGGCCGTGGAGGAGATAGAG  1480
            .|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1407  TCGTGGAGGTCCTGGTGGCCCAGGAGGCCCTGGAGGACCCATGGGTCGCATGGGAGGCCGTGGAGGAGACAGAG  1480

Query 1481  GAGGCTTCCCTCCAAGAGGACCCCGGGGTTCCCGAGGGAACCCCTCTGGAGGAGGAAACGTCCAGCACCGAGCT  1554
            |.|||||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1481  GGGGCTTCCCTCCAAGAGGGCCCCGAGGCTCCAGAGGAAACCCCTCTGGAGGAGGAAATGTCCAGCACCGAGCT  1554

Query 1555  GGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGTTGTGGAAACCAGAACTTCGCCTGGAGAACAGAGTGCAACCAGTGTAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1555  GGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGCTGTGGAAACCAGAACTTCGCTTGGAGAACAGAATGCAACCAGTGTAA  1628

Query 1629  GGCCCCAAAGCCTGAAGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCGCCCCCGGGTGGTGATCGTGGCAGAGGTGGCCCTG  1702
            ||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||..||||||||||||
Sbjct 1629  GGCCCCTAAGCCCGAGGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCACCTCCGGGTGGTGATCGTGGACGAGGTGGCCCTG  1702

Query 1703  GTGGCATGCGGGGAGGAAGAGGTGGCCTCATGGATCGTGGTGGTCCCGGTGGAATGTTCAGAGGTGGCCGTGGT  1776
            ||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||.|.|||
Sbjct 1703  GTGGCATGCGAGGAGGAAGAGGAGGACTCATGGACCGTGGTGGTCCTGGAGGAATGTTCAGAGGTGGCAGAGGT  1776

Query 1777  GGAGACAGAGGTGGCTTCCGTGGTGGCCGGGGCATGGACCGAGGTGGCTTTGGTGGAGGAAGACGAGGTGGCCC  1850
            |||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1777  GGAGACAGAGGAGGCTTCCGAGGTGGCCGTGGAATGGACCGAGGTGGCTTTGGTGGAGGAAGACGAGGTGGTCC  1850

Query 1851  TGGGGGGCCCCCTGGACCTTTGATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGAGGACGTGGAGGACCTGGAAAAATGG  1924
            |||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1851  TGGGGGGCCTCCTGGACCTTTAATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGCGGACGTGGAGGACCTGGGAAAATGG  1924

Query 1925  ATAA------------------AGGCGAGCACCGTCAGGAGCGCAGAGATCGGCCCTAC  1965
            ||||                  ||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1925  ATAAGGTCCCTTTGCTTTGCAGAGGCGAGCACCGTCAGGAACGCAGAGACCGGCCCTAC  1983