Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480524
- Subject:
- NM_001166413.1
- Aligned Length:
- 1831
- Identities:
- 1235
- Gaps:
- 413
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGAGCAGTCGCAAGGATCCATAAATTCAGTTACGAGGGCCATATGCCAAGTTCTGGTTGACGCTTTCAGACC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCCGGAGAGAGATCCCTTAGGGCCTGGGAGTACCAAGACAGAGAGTGATTGTATCGAGGAGGATCAGACAGGGC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AGCGCGAACCTGAGGTCCTCGCCTGGGCTCCGCAGCCCGAATCCTATTCTATTGCCGTCAGTGAGGGGAGCATG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TCAGCGTCTGCTGTCTCGGGGCTGGCTGCCCTGTCTGGCCCCAGCTCTGGCCTCAGCTCTGATCCGTGTTCTCC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 GATTCCCCCTGGACCAGTAACTGGCCTGAGGAGATGGTTGGATCATTCCAAACATTGTCTCAGTGTGGAAACTG 370
Query 1 -------------------------ATGT-------------TGGAGCCAGCTCTAGCCACAGGAGAGGAGCTG 36
|||| ||||||||.||.||.||||||||.|.||||||
Sbjct 371 AGGCAGAGAGTGGTCAGACCGGACAATGTGAGAACTGGACGCTGGAGCCAACTTTAACCACAGGACAAGAGCTG 444
Query 37 CCGGAACTGACCTTGCTGACCACACTGTTGGAGGGCCCTGGAGATAAGACGCAGCCACCTGAAGAGGAGACTTT 110
||.|||||||||||.|||||.|||.||.|||||||.||||||||.|||.|.||||||.||||||||||.|||||
Sbjct 445 CCCGAACTGACCTTACTGACTACATTGCTGGAGGGTCCTGGAGACAAGGCACAGCCAGCTGAAGAGGAAACTTT 518
Query 111 GTCCCAAGCCCCTGAGAGTGAGGAGGAACAGAAGAAGAAGGCTCTGGAAAGGAGTATGTATGTCCTGAGTGAAC 184
|||||||||.||..|||.||||||.||.||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||.||||.|
Sbjct 519 GTCCCAAGCTCCCAAGAATGAGGAAGAGCAGAAGAAGATGGCTCTGGAAAGGAGTATGTTTGTCCTGGGTGAGC 592
Query 185 TGGTAGAAACAGAGAAAATGTACGTGGACGACTTGGGGCAGATTGTGGAGGGTTATATGGCCACCATGGCTGCT 258
||||.||||||||.|.||..||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||.||
Sbjct 593 TGGTGGAAACAGAAAGAACATATGTGGACGACTTGGGACAGATCGTAGAGGGTTACATGGCTACCATGGCTACT 666
Query 259 CAGGGGGTCCCCGAGAGTCTTCGAGGCCGTGACAGGATTGTGTTTGGGAATATCCAGCAAATCTATGAGTGGCA 332
||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 667 CAGGGGGTACCTGAGAGTCTCCGAGGTCGTGACAGGATTGTGTTTGGGAACATTCAGCAGATCTATGAGTGGCA 740
Query 333 CCGAGACTATTTCTTGCAAGAGCTACAACGGTGTCTGAAAGATCCTGATTGGCTGGCTCAGCTATTCATCAAAC 406
|||||||||.|||.||||.|||||.||.|.||||.||||||||||.||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 741 CCGAGACTACTTCCTGCAGGAGCTGCAGCAGTGTTTGAAAGATCCCGATTGGTTGGCTCAGCTGTTCATCAAAC 814
Query 407 ACGAGCGCCGGCTGCATATGTATGTGGTGTACTGTCAGAATAAGCCCAAGTCAGAGCATGTGGTGTCAGAGTTT 480
|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 815 ATGAGCGCCGACTGCATATGTATGTGGTGTACTGCCAGAATAAACCCAAGTCAGAGCATGTGCTGTCAGAGTTT 888
Query 481 GGGGACAGCTACTTTGAGGAGCTCCGGCAGCAGCTGGGGCACCGCCTGCAGCTGAACGACCTCCTCATCAAACC 554
|||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 889 GGGGACAGCTACTTTGAGGAGCTGAGGCAGCAGCTGGGACACCGACTGCAGCTCAATGACCTCCTCATTAAACC 962
Query 555 TGTGCAGCGGATCATGAAATACCAGCTGCTGCTCAAGGATTTTCTCAAGTATTACAATAGAGCTGGGATGGATA 628
.||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||..||||||||||.|||||
Sbjct 963 AGTGCAGCGAATCATGAAATACCAGTTGCTGCTGAAGGATTTTCTAAAGTATTACAGAAGAGCTGGGAAGGATA 1036
Query 629 CTGCAGACCTAGAGCAAGCTGTGGAGGTCATGTGCTTTGTGCCCAAGCGCTGCAACGATATGATGACGCTGGGG 702
|||.|||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||||||.|.||||||
Sbjct 1037 CTGAAGAGCTGGAGCAAGCTGTGGAGGTCATGTGTTTCGTACCTAAGCGATGCAATGATATGATGTCCCTGGGG 1110
Query 703 AGATTGCGGGGATTTGAGGGCAAACTGACTGCTCAGGGGAAGCTCTTGGGCCAGGACACTTTCTGGGTCACCGA 776
|||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||.||.||
Sbjct 1111 AGACTTCGGGGATTTGAGGGAAAACTGACTGCTCAGGGGAAGCTCTTGGGCCAGGACACATTCTTGGTTACAGA 1184
Query 777 GCCTGAGGCTGGAGGGCTGCTATCTTCCCGAGGTCGAGAGAGGCGCGTCTTCCTCTTTGAGCAAATCATCATCT 850
||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCCTGAAGCTGGGGGTCTGCTTTCTTCCCGGGGTCGGGAGAGGCGTGTCTTCCTGTTCGAGCAAATCATCATCT 1258
Query 851 TCAGTGAAGCCCTGGGAGGAGGAGTGAGAGGTGGAACACAGCCTGGATATGTATACAAGAACAGCATTAAGGTG 924
|||||||.||||||||||||||||...|||||||..|.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259 TCAGTGAGGCCCTGGGAGGAGGAGGCCGAGGTGGCGCGCAGCCTGGCTACGTGTACAAGAACAGCATCAAGGTG 1332
Query 925 AGCTGCCTGGGACTGGAGGGGAACCTCCAAGGTGACCCTTGCCGCTTTGCACTGACCTCCAGAGGGCCAGAGGG 998
||||||||.||.|||||||||||.||||||||..||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1333 AGCTGCCTAGGGCTGGAGGGGAATCTCCAAGGCAACCCTTGCCGGTTTGCGCTGACCTCTAGAGGGCCAGAAGG 1406
Query 999 TGGGATCCAGCGCTATGTCCTGCAGGCTGCAGACCCTGCTATCAGTCAGGCCTGGATCAAGCATGTGGCTCAGA 1072
|||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||||||.|||||||.||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 1407 TGGGATCCAGCGCTACGTTCTGCAGGCTTCAGACCCTGCTGTCAGTCAAGCCTGGATAAAGCAAGTGGCCCAGA 1480
Query 1073 TCTTGGAGAGCCAACGGGACTTCCTCAACGCATTGCAGTCACCCATTGAGTACCAGAGACGGGAGAGCCAGACC 1146
||.||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1481 TCCTGGAAAGCCAGCGTGACTTTCTCAACGCATTACAGTCACCCATTGAATACCAGAGACGTGAGAGCCAGACC 1554
Query 1147 AACAGCCTGGGGCGGCCAAGAGGGCCTGGAGTGGGGAGCCCTGGAAGAATTCGGCTTGGAGATCAGGCCCAGGG 1220
||.|||||||||||.|||.||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||||.||||||.|.||||||||.
Sbjct 1555 AATAGCCTGGGGCGACCAGGAGGGCCTTGGGTAGGGAGCCCTGGGAGAATGCGGCCTGGAGACCTGGCCCAGGC 1628
Query 1221 CAGCACACACACACCCATCAATGGCTCTCTCCCCTCTCTGCTGCTGTC-ACCCAAAGGGGAGGTGGCCAGAGCC 1293
|||||..||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|| || .||||.||||||||||.||||||..
Sbjct 1629 CAGCATGCACACACCCATCAATGGCTCTCTCCCTTCCCTGCTACT-TCTGCCCAGAGGGGAGGTGTCCAGAGTG 1701
Query 1294 CTCTTGCCACTGGATAAACAGGCCCTTGGTGACATCCCCCAGGCTCCCCATGACTCTCCTCCAGTCTCTCCAAC 1367
||.|||||.|||||||.||||||.||..||||.|.|||||||.||||.||||||| ||||||.|..|||.||
Sbjct 1702 CTGTTGCCCCTGGATACACAGGCTCTCAGTGATACCCCCCAGACTCCTCATGACT---CTCCAGCCCTTCCCAC 1772
Query 1368 TCCAAAAACCCCTCCCTGCCAAGCCAGACTTGCCAAGCTGGATGAAGATGAGCTG 1422
|...||.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773 TGTGAACACTCCTCCCTGTCAGGCCAGGCTCGCCAAGCTGGATGAAGATGAGCTG 1827
