Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000481299
- Subject:
- XM_006515113.3
- Aligned Length:
- 3328
- Identities:
- 2709
- Gaps:
- 209
Alignment
Query 1 ATGGGGCTGGAGAACTATAAACAGCCCGTGGTGCTGAGAGAGGACAACTGCCGAAGGCGCCGGAGGATGAAGCC 74
||||.|||||||||||||.||||.||.|||||.||.||||||||||||..|||..|||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGCTGGAGAACTATGAACAACCGGTGGTTCTAAGAGAGGACAACCTCCGCCGGCGCCGGAGGATGAAGCC 74
Query 75 GCGCAGTGCTGCGGCCAGCCTGTCCTCCATGGAGCTCATCCCCATCGAGTTCGTGCTGCCCACCAGCCAGCGCA 148
.|||||.||.||.|.|||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACGCAGCGCAGCAGGCAGCCTGTCTTCCATGGAGCTCATCCCCATTGAGTTCGTACTGCCCACCAGCCAGCGCA 148
Query 149 AATGCAAGAGCCCCGAAACGGCGCTGCTGCACGTGGCCGGCCACGGCAACGTGGAGCAGATGAAGGCCCAGGTG 222
...||||||..||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||
Sbjct 149 TCAGCAAGACTCCAGAAACAGCGCTGCTGCATGTGGCTGGCCATGGCAATGTGGAACAGATGAAAGCTCAGGTG 222
Query 223 TGGCTGCGAGCGCTGGAGACCAGCGTGGCGGCGGACTTCTACCACCGGCTGGGACCGCATCACTTCCTCCTGCT 296
||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||..||||.|||.|.||.|||||||||||
Sbjct 223 TGGCTGCGCGCACTGGAGACCAGTGTGGCTGCGGAGTTCTACCACCGATTGGGCCCGGACCAATTCCTCCTGCT 296
Query 297 CTATCAGAAGAAGGGGCAGTGGTACGAGATCTACGACAAGTACCAGGTGGTGCAGACTCTGGACTGCCTGCGCT 370
|||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||.||||||.|||||||||||.||.||||||||||..|
Sbjct 297 CTACCAGAAGAAAGGACAATGGTATGAGATCTATGACAGGTACCAAGTGGTGCAGACCCTAGACTGCCTGCATT 370
Query 371 ACTGGAAGGCCACGCACCGGAGCCCGGGCCAGATCCACCTGGTGCAGCGGCACCCGCCCTCCGAGGAGTCCCAA 444
||||||||...|.||||..||||||.||||||||||||.||||.|||||.|||...||.||.||||||.||...
Sbjct 371 ACTGGAAGTTGATGCACAAGAGCCCTGGCCAGATCCACGTGGTACAGCGACACGTACCTTCTGAGGAGACCTTG 444
Query 445 GCCTTCCAGCGGCAGCTCACGGCGCTGATTGGCTATGACGTCACTGACGTCAGCAACGTGCACGACGATGAGCT 518
||.||||||..|||||||||..|.||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 445 GCTTTCCAGAAGCAGCTCACCTCCCTGATTGGCTATGACGTCACTGACATCAGCAATGTGCACGATGATGAGCT 518
Query 519 GGAGTTCACGCGCCGTGGCTTGGTGACCCCGCGCATGGCGGAGGTGGCCAGCCGCGACCCCAAGCTCTACGCCA 592
.||||||||.|||||..|..||||.||.||.||||||||.||.|||||..||||.||..||||.|||||.||.|
Sbjct 519 AGAGTTCACTCGCCGCCGTCTGGTTACGCCCCGCATGGCTGAAGTGGCTGGCCGGGATGCCAAACTCTATGCTA 592
Query 593 TGCACCCGTGGGTGACGTCCAAGCCCCTCCCGGAGTACCTGTGGAAGAAGATTGCCAACAACTGCATCTTCATC 666
|||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||..||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGCACCCTTGGGTAACGTCCAAACCTCTCCCAGACTACCTGTCAAAAAAGATTGCCAACAACTGCATCTTCATC 666
Query 667 GTCATTCACCGCAGCACCACCAGCCAGACCATTAAGGTCTCACCCGACGACACCCCCGGCGCCATCCTGCAGAG 740
|||||.||||||.|.|||||||||||.|||||.||||||||..|.||.||.||.||.||..|||||||.|||||
Sbjct 667 GTCATCCACCGCGGTACCACCAGCCAAACCATCAAGGTCTCCGCAGATGATACTCCTGGTACCATCCTCCAGAG 740
Query 741 CTTCTTCACCAAGATGGCCAAGAAGAAATCTCTGATGGATATTCCCGAAAGCCAAAGCGAACAGGATTTTGTGC 814
|||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||.||||..|.|||||.|||||.||.|||||||||||..
Sbjct 741 CTTCTTCACCAAGATGGCCAAGAAGAAGTCCCTAATGAATATCTCAGAAAGTCAAAGTGAGCAGGATTTTGTAT 814
Query 815 TGCGCGTCTGTGGCCGGGATGAGTACCTGGTGGGCGAAACGCCCATCAAAAACTTCCAGTGGGTGAGGCACTGC 888
||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 815 TGCGGGTTTGTGGCCGCGATGAGTACCTGGTGGGTGAAACACCCCTCAAAAATTTCCAGTGGGTGAGGCAGTGC 888
Query 889 CTCAAGAACGGAGAAGAGATTCACGTGGTACTGGACACGCCTCCAGACCCGGCCCTAGACGAGGTGAGGAAGGA 962
||||||||||||||.||.||.|||.||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct 889 CTCAAGAACGGAGATGAAATACACCTGGTGCTCGACACGCCTCCAGACCCAGCCCTTGATGAGGTGAGGAAGGA 962
Query 963 AGAGTGGCCGCTGGTGGACGACTGCACGGGAGTCACCGGCTACCATGAGCAGCTTACCATCCACGGCAAGGACC 1036
|||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 963 AGAATGGCCGCTGGTGGATGACTGCACTGGAGTCACCGGCTACCACGAGCAGCTGACCATCCATGGCAAGGACC 1036
Query 1037 ACGAGAGTGTGTTCACCGTGTCCCTGTGGGACTGCGACCGCAAGTTCAGGGTCAAGATCAGAGGCATTGATATC 1110
||||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACGAGAGTGTGTTCACAGTGTCTTTGTGGGACTGCGACCGAAAGTTCAGGGTCAAGATCAGAGGCATTGATATC 1110
Query 1111 CCCGTCCTGCCTCGGAACACCGACCTCACAGTTTTTGTAGAGGCAAACATCCAGCATGGGCAACAAGTCCTTTG 1184
||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1111 CCTGTCCTGCCTCGGAACACCGACCTCACTGTGTTTGTGGAAGCGAACATCCAGCACGGGCAACAAGTCCTCTG 1184
Query 1185 CCAAAGGAGAACCAGCCCCAAACCCTTCACAGAGGAGGTGCTGTGGAATGTGTGGCTTGAGTTCAGTATCAAAA 1258
||||||||||||||||||.||.||||||.||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||..|.|||||||
Sbjct 1185 CCAAAGGAGAACCAGCCCTAAGCCCTTCGCAGAAGAGGTACTCTGGAATGTGTGGCTGGAGTTTGGCATCAAAA 1258
Query 1259 TCAAAGACTTGCCCAAAGGGGCTCTACTGAACCTCCAGATCTACTGCGGTAAAGCTCCAGCACTGTCCAGCAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||.|.|||.|.|||.||||||||||||||
Sbjct 1259 TCAAAGACTTGCCCAAAGGGGCTCTATTGAACCTACAGATCTACTGCTGCAAAACCCCATCACTGTCCAGCAAG 1332
Query 1333 GCCTCTGCAGAGTCCCCCAGTTCTGAGTCCAAGGGCAAAGTTCAGCTTCTCTATTATGTGAACCTGCTGCTGAT 1406
||.|||||||||.|.||..|.||.||||||||||||||||..||||||||||||||.||||||.|||||.|.||
Sbjct 1333 GCTTCTGCAGAGACTCCAGGCTCCGAGTCCAAGGGCAAAGCCCAGCTTCTCTATTACGTGAACTTGCTGTTAAT 1406
Query 1407 AGACCACCGTTTCCTCCTGCGCCGTGGAGAATACGTCCTCCACATGTGGCAGATATCTGGGAAGGGAGAAGACC 1480
||||||||||||||||||.||||..||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||.|||.||.|
Sbjct 1407 AGACCACCGTTTCCTCCTCCGCCACGGGGACTATGTGCTCCACATGTGGCAGATATCTGGCAAGGCAGAGGAGC 1480
Query 1481 AAGGAAGCTTCAATGCTGACAAACTCACGTCTGCAACTAACCCAGACAAGGAGAACTCAATGTCCATCTCCATT 1554
|.||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1481 AGGGCAGCTTCAATGCTGACAAGCTCACATCCGCAACCAATCCTGACAAGGAGAACTCAATGTCCATTTCCATC 1554
Query 1555 CTTCTGGACAATTACTGCCACCCGATAGCCCTGCCTAAGCATCAGCCCACCCCTGACCCGGAAGGGGACCGGGT 1628
||.||||||||||||||.|||||.|||||..||||||||||.|.|||||||||||||||.||.||.|||.||||
Sbjct 1555 CTGCTGGACAATTACTGTCACCCCATAGCTTTGCCTAAGCACCGGCCCACCCCTGACCCAGAGGGAGACAGGGT 1628
Query 1629 TCGAGCAGAAATGCCCAACCAGCTTCGCAAGCAATTGGAGGCGATCATAGCCACTGATCCACTTAACCCTCTCA 1702
|||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1629 TCGGGCTGAAATGCCCAATCAGCTTCGAAAGCAATTGGAGGCGATCATAGCCACAGATCCACTTAACCCCCTCA 1702
Query 1703 CAGCAGAGGACAAAGAATTGCTCTGGCATTTTAGATACGAAAGCCTTAAGCACCCAAAAGCATATCCTAAGCTA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 1703 CAGCAGAGGACAAAGAATTGCTCTGGCATTTTCGATATGAAAGCCTGAAGCATCCGAAGGCTTACCCTAAGCTA 1776
Query 1777 TTTAGTTCAGTGAAATGGGGACAGCAAGAAATTGTGGCCAAAACATACCAATTGTTGGCCAGAAGGGAAGTCTG 1850
||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||..||||.|||||||||||..||||
Sbjct 1777 TTCAGCTCAGTGAAATGGGGGCAGCAAGAAATTGTTGCCAAAACGTACCAGCTGTTAGCCAGAAGGGAGATCTG 1850
Query 1851 GGATCAAAGTGCTTTGGATGTTGGGTTAACAATGCAGCTCCTGGACTGCAACTTCTCAGATGAAAATGTAAGAG 1924
||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||..|.|
Sbjct 1851 GGATCAAAGTGCTTTGGACGTTGGCTTAACCATGCAGCTCCTGGACTGCAACTTTTCAGACGAGAATGTCCGGG 1924
Query 1925 CCATTGCAGTTCAGAAACTGGAGAGCTTGGAGGACGATGATGTTCTGCATTACCTTCTACAATTGGTCCAGGCT 1998
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.|||||||||||.||..||||.||||||
Sbjct 1925 CCATTGCAGTTCAGAAACTGGAGAGCTTAGAGGACGATGACGTTTTACATTACCTTCTCCAGCTGGTACAGGCT 1998
Query 1999 GTGAAATTTGAACCATACCATGATAGTGCCCTTGCCAGATTTCTGCTGAAGCGTGGTTTAAGAAACAAAAGAAT 2072
||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1999 GTGAAATTTGAACCGTACCACGACAGTGCGCTGGCCAGATTCCTGCTGAAGCGTGGCTTGAGGAACAAAAGAAT 2072
Query 2073 TGGTCACTTTTTGTTTTGGTTCTTGAGAAGTGAGATAGCCCAGTCCAGACACTATCAGCAGAGGTTCGCTGTGA 2146
.||||||||.|||||.||||||.||.||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CGGTCACTTCTTGTTCTGGTTCCTGCGAAGTGAGATCGCACAGTCCAGACACTATCAGCAGAGGTTCGCTGTGA 2146
Query 2147 TTCTGGAAGCCTATCTGAGGGGCTGTGGCACAGCCATGCTGCACGACTTTACCCAACAAGTCCAAGTAATCGAG 2220
|.|||||.||.||.|||.|.||||||||||||||||||.||||.|||||.||.||.||.|||||.||.||.|||
Sbjct 2147 TCCTGGAGGCGTACCTGCGAGGCTGTGGCACAGCCATGTTGCAGGACTTCACACAGCAGGTCCATGTGATTGAG 2220
Query 2221 ATGTTACAAAAAGTCACCCTTGATATTAAATCGCTCTCTGCTGAAAAGTATGACGTCAGTTCCCAAGTTATTTC 2294
||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 ATGTTACAGAAAGTCACCATTGATATTAAATCGCTCTCGGCAGAGAAGTATGACGTCAGTTCCCAAGTTATTTC 2294
Query 2295 ACAACTTAAACAAAAGCTTGAAAACCTGCAGAATTCTCAA-CTCCCCGAAAGCTTTAGAGTTCCATATGATCCT 2367
|||.|||||.|||||||||||||.|||.|||||.|| ||| ||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2295 ACAGCTTAAGCAAAAGCTTGAAAGCCTTCAGAACTC-CAATCTCCCCGAGAGCTTTAGAGTTCCCTATGATCCT 2367
Query 2368 GGACTGAAAGCAGGAGCGCTGGCAATTGAAAAATGTAAAGTAATGGCCTCCAAGAAAAAACCACTATGGCTTGA 2441
|||||.|||||.||..|.||||..||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 2368 GGACTAAAAGCCGGTACCCTGGTGATCGAGAAATGCAAAGTGATGGCCTCCAAGAAGAAGCCCCTGTGGCTTGA 2441
Query 2442 GTTTAAATGTGCCGATCCTACAGCCCTATCAAATGAAACAATTGGAATTATCTTTAAACATGGTGATGATCTGC 2515
||||||.|||||.|||||.||||.||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2442 GTTTAAGTGTGCTGATCCCACAGTCCTATCCAACGAAACCATTGGAATCATCTTTAAACATGGTGATGATCTGC 2515
Query 2516 GCCAAGACATGCTTATTTTACAGATTCTACGAATCATGGAGTCTATTTGGGAGACTGAATCTTTGGATCTATGC 2589
|||||||||||.|.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||.|||
Sbjct 2516 GCCAAGACATGTTGATCTTGCAGATTCTACGCATCATGGAGTCCATTTGGGAGACTGAATCTCTGGACCTGTGC 2589
Query 2590 CTCCTGCCATATGGTTGCATTTCAACTGGTGACAAAATAGGAATGATCGAGATTGTGAAAGACGCCACGACAAT 2663
||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||
Sbjct 2590 CTTCTGCCTTACGGTTGCATCTCAACTGGTGACAAAATAGGAATGATCGAGATTGTAAAGGATGCCACAACGAT 2663
Query 2664 TGCCAAAATTCAGCAAAGCACAGTGGGCAACACGGGAGCATTTAAAGATGAAGTCCTGAATCACTGGCTCAAAG 2737
.||..||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2664 CGCTCAAATTCAGCAAAGCACAGTGGGTAACACGGGGGCATTCAAAGATGAAGTCCTGAATCACTGGCTCAAGG 2737
Query 2738 AAAAATCCCCTACTGAAGAAAAGTTTCAGGCAGCAGTGGAGAGATTTGTTTATTCCTGTGCAGGCTACTGTGTG 2811
||||||..||||.||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2738 AAAAATGTCCTATTGAAGAAAAGTTTCAGGCCGCAGTGGAAAGGTTTGTTTACTCCTGTGCAGGCTACTGTGTG 2811
Query 2812 GCAACCTTTGTTCTTGGAATAGGCGACAGACACAATGACAATATTATGATCACCGAGACAGGAAACCTATTTCA 2885
||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||
Sbjct 2812 GCCACATTTGTTCTTGGGATCGGTGACAGGCACAACGACAACATTATGATCTCAGAGACAGGAAACCTATTTCA 2885
Query 2886 TATTGACTTCGGGCACATTCTTGGGAATTACAAAAGTTTCCTGGGCATTAATAAAGAGAGAGTGCCATTTGTGC 2959
|||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 2886 TATAGACTTCGGACACATTCTTGGGAATTACAAGAGTTTCCTGGGCATCAATAAAGAGAGAGTGCCCTTCGTCC 2959
Query 2960 TAACCCCTGACTTCCTCTTTGTGATGGGAACTTCTGGAAAGAAGACAAGCCCACACTTCCAGAAATTTCAGGAC 3033
|||||||.||||||.|.||||||||||||.||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 2960 TAACCCCAGACTTCTTGTTTGTGATGGGATCTTCTGGAAAAAAGACAAGTCCACACTTCCAGAAATTCCAG--- 3030
Query 3034 ATCTGTGTTAAGGCTTATCTAGCCCTTCGTCATC-----ACA-CAAACCTACTGATCATCCTGTTCTCCATGAT 3101
||| ||||||.|.|| ||.| ||| ||| ||..||| |||.|||
Sbjct 3031 --CTG---------TTATCTTGTCC-TCAT-ATCAAGGTACAGCACGCCT-----TCAGCCT------------ 3074
Query 3102 GCTGATGACAGGAATGCCCCAGTTAACAAGCA-----AAGAAGACATTGAATATATCCGGGATGCC---CTCAC 3167
|||| |.||.||| ||| ||| |||| ||.||| ||||
Sbjct 3075 -------ACAG----GTCCAAGT------GCATGTCCAAG--GACA--------------GAGGCCTGACTCA- 3114
Query 3168 AGTGGGGAAAAATG---AGGA----GGATGCTAAAAAGTATTTTCTTGATCAGATCGAAGTTTGCAGAGACAAA 3234
.||.||| |||| |||.| ||||
Sbjct 3115 -------GAAGATGGCCAGGAACCTGGAGG------------TTCT---------------------------- 3141
Query 3235 GGATGGACTGTGCAGTTTAATTGGTTTCTACATCTTGTTCTTGGCATCAAACAAGGAGAGAAACATTCAGCC 3306
Sbjct 3142 ------------------------------------------------------------------------ 3141