Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487738
• Subject: XM_017013929.1
• Aligned Length: 1512
• Identities: 1155
• Gaps: 357

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGCTCAGCGAAAAGTTCTTTAGAGGGACGATATCCTTTATACAATCGTATAATTTTATATGTTCACTTTGT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CAGATTACACACACAGACGGTGACCAGCGATGATCCAGGCGTCTCGGTCGTTAGCGGGTATCCTGGGGGCTGTC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TCCCTGACCACGACCCCCCAGTGGGGTTTCTTTCCGAGGGTCCCGCCCCTCGCAGCTGCTCTTTGATAAAGGGC  222

Query    1  ----------------------------------------------------------------ATGGGGTGCG  10
                                                                            ||||||||||
Sbjct  223  GGAGGAACGGGGCTGGCTGCTTCCCGAGTCCCCAGGTCCCGCGAGCGGCGGGCGTGTTGCGGGTATGGGGTGCG  296

Query   11  GCGCCAGCAGGAAGGTGGTCCCGGGGCCACCAGCGCTGGCTTGGGCCAAGCACGAAGGTCAAAACCAAGCCGGC  84
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCGCCAGCAGGAAGGTGGTCCCGGGGCCACCAGCGCTGGCTTGGGCCAAGCACGAAGGTCAAAACCAAGCCGGC  370

Query   85  GTCGGAGGCGCGGGGCCTGGGCCCGAGGCGGCGGCCCAGGCGGCGCAGAGGATACAGGTGGCTCGCTTCCGAGC  158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTCGGAGGCGCGGGGCCTGGGCCCGAGGCGGCGGCCCAGGCGGCGCAGAGGATACAGGTGGCTCGCTTCCGAGC  444

Query  159  CAAGTTCGACCCCCGGGTCCTTGCC-------------------------------------------------  183
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct  445  CAAGTTCGACCCCCGGGTCCTTGCCAGGGAGTTCAGAGGATGGGAAAAAAGAGAGCAGGAGCAGCAGCAAACAA  518

Query  184  ----------------------AGATATGACATCAAAGCTCTTATTGGGACAGGCAGTTTCAGCAGGGTTGTCA  235
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGGAAGGAATTCCTATCTTCGGAGATATGACATCAAAGCTCTTATTGGGACAGGCAGTTTCAGCAGGGTTGTCA  592

Query  236  GGGTAGAGCAGAAGACCACCAAGAAACCTTTTGCAATAAAAGTGATGGAAACCAGAGAGAGGGAAGGTAGAGAA  309
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGTAGAGCAGAAGACCACCAAGAAACCTTTTGCAATAAAAGTGATGGAAACCAGAGAGAGGGAAGGTAGAGAA  666

Query  310  GCGTGCGTGTCTGAGCTGAGCGTCCTGCGGCGGGTTAGCCATCGTTACATTGTCCAGCTCATGGAGATCTTTGA  383
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCGTGCGTGTCTGAGCTGAGCGTCCTGCGGCGGGTTAGCCATCGTTACATTGTCCAGCTCATGGAGATCTTTGA  740

Query  384  GACTGAGGATCAAGTTTACATGGTAATGGAGCTGGCTACCGGAGGGGAGCTCTTTGATCGACTCATTGCTCAGG  457
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GACTGAGGATCAAGTTTACATGGTAATGGAGCTGGCTACCGGAGGGGAGCTCTTTGATCGACTCATTGCTCAGG  814

Query  458  GATCCTTTACAGAGCGGGATGCCGTCAGGATCCTCCAGATGGTTGCTGATGGGATTAGGTATTTGCATGCGCTG  531
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GATCCTTTACAGAGCGGGATGCCGTCAGGATCCTCCAGATGGTTGCTGATGGGATTAGGTATTTGCATGCGCTG  888

Query  532  CAGATAACTCATAGGAATCTAAAGCCTGAAAACCTCTTATACTATCATCCAGGTGAAGAGTCGAAAATTTTAAT  605
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGATAACTCATAGGAATCTAAAGCCTGAAAACCTCTTATACTATCATCCAGGTGAAGAGTCGAAAATTTTAAT  962

Query  606  TACAGATTTTGGTTTGGCATACTCCGGGAAAAAAAGTGGTGACTGGACAATGAAGACACTCTGTGGGACCCCAG  679
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TACAGATTTTGGTTTGGCATACTCCGGGAAAAAAAGTGGTGACTGGACAATGAAGACACTCTGTGGGACCCCAG  1036

Query  680  AGTACATAGCTCCTGAGGTTTTGCTAAGGAAGCCTTATACCAGTGCAGTGGACATGTGGGCTCTTGGTGTGATC  753
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGTACATAGCTCCTGAGGTTTTGCTAAGGAAGCCTTATACCAGTGCAGTGGACATGTGGGCTCTTGGTGTGATC  1110

Query  754  ACATATGCTTTACTTAGCGGATTCCTGCCTTTTGATGATGAAAGCCAGACAAGGCTTTACAGGAAGATTCTGAA  827
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACATATGCTTTACTTAGCGGATTCCTGCCTTTTGATGATGAAAGCCAGACAAGGCTTTACAGGAAGATTCTGAA  1184

Query  828  AGGCAAATATAATTATACAGGAGAGCCTTGGCCAAGCATTTCCCACTTGGCGAAGGACTTTATAGACAAACTAC  901
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGGCAAATATAATTATACAGGAGAGCCTTGGCCAAGCATTTCCCACTTGGCGAAGGACTTTATAGACAAACTAC  1258

Query  902  TGATTTTGGAGGCTGGTCATCGCATGTCAGCTGGCCAGGCCCTGGACCATCCCTGGGTGATCACCATGGCTGCA  975
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGATTTTGGAGGCTGGTCATCGCATGTCAGCTGGCCAGGCCCTGGACCATCCCTGGGTGATCACCATGGCTGCA  1332

Query  976  GGGTCTTCCATGAAGAATCTCCAGAGGGCCATATCCCGAAACCTCATGCAGAGGGCCTCTCCCCACTCTCAGAG  1049
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGGTCTTCCATGAAGAATCTCCAGAGGGCCATATCCCGAAACCTCATGCAGAGGGCCTCTCCCCACTCTCAGAG  1406

Query 1050  TCCTGGATCTGCACAGTCTTCTAAGTCACATTATTCTCACAAATCCAGGCATATGTGGAGCAAGAGAAACTTAA  1123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCCTGGATCTGCACAGTCTTCTAAGTCACATTATTCTCACAAATCCAGGCATATGTGGAGCAAGAGAAACTTAA  1480

Query 1124  GGATAGTAGAATCGCCACTGTCTGCGCTTTTG  1155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGATAGTAGAATCGCCACTGTCTGCGCTTTTG  1512