Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000487752
Subject:
XM_006506918.3
Aligned Length:
580
Identities:
500
Gaps:
28

Alignment

Query   1  ATGACTGAATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGCTGGTGACGTAGGCAAGAGTGCCTTGACGATACAGCTAATTCA  74
           ||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGACTGAGTATAAACTTGTGGTGGTTGGAGCTGGTGGCGTAGGCAAGAGCGCCTTGACGATACAGCTAATTCA  74

Query  75  GAATCATTTTGTGGACGAATATGATCCAACAATAGAGGATTCCTACAGGAAGCAAGTAGTAATTGATGGAGAAA  148
           ||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  GAATCACTTTGTGGATGAGTATGACCCTACGATAGAGGACTCCTACAGGAAACAAGTAGTAATTGATGGAGAAA  148

Query 149  CCTGTCTCTTGGATATTCTCGACACAGCAGGTCAAGAGGAGTACAGTGCAATGAGGGACCAGTACATGAGGACT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 149  CCTGTCTCTTGGATATTCTCGACACAGCAGGTCAAGAGGAGTACAGTGCAATGAGGGACCAGTACATGAGAACT  222

Query 223  GGGGAGGGCTTTCTTTGTGTATTTGCCATAAATAATACTAAATCATTTGAAGATATTCACCATTATAGAGAACA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GGGGAGGGCTTTCTTTGTGTATTTGCCATAAATAATACTAAATCATTTGAAGATATTCACCATTATAGAGAACA  296

Query 297  AATTAAAAGAGTTAAGGACTCTGAAGATGTACCTATGGTCCTAGTAGGAAATAAATGTGATTTGCCTTCTAGAA  370
           ||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297  AATTAAAAGAGTAAAGGACTCTGAAGATGTGCCTATGGTCCTGGTAGGGAATAAGTGTGATTTGCCTTCTAGAA  370

Query 371  CAGTAGACACAAAACAGGCTCAGGACTTAGCAAGAAGTTATGGAATTCCTTTTATTGAAACATCAGCAAAGACA  444
           ||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 371  CAGTAGACACGAAACAGGCTCAGGAGTTAGCAAGGAGTTACGGGATTCCGTTCATTGAGACCTCAGCAAAGACA  444

Query 445  AGACAGGGTGTTGATGATGCCTTCTATACATTAGTTCGAGAAATTCGAAA--ACATAAAG-AAAAGATGAGCAA  515
           ||||||.|.||.||.|||||.||.||||||||.||..||||.||.|||.|  |||.|..| ||||.||.|||||
Sbjct 445  AGACAGAGAGTGGAGGATGCTTTTTATACATTGGTGAGAGAGATCCGACAGTACAGATTGAAAAAAATCAGCAA  518

Query 516  AGATGGTAAAAAGA------------AGAAAAAGAAGTCAAAGACAAAGTGTGTAATTATGG  565
           |||.|   ||||||            .|||||..||         |||.||.||.||.||| 
Sbjct 519  AGAAG---AAAAGACTCCTGGCTGTGTGAAAATTAA---------AAAATGCGTTATAATG-  567