Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000487812
- Subject:
- XM_030254519.1
- Aligned Length:
- 1404
- Identities:
- 1025
- Gaps:
- 259
Alignment
Query 1 ATGAGCCTCCATTTCTTATACTACTGCAGTGAACCAACATTGGATGTGAAAATTGCCTTTTGTCAGGGATTCGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TAAACAAGTGGATGTGTCATATATTGCCAAACATTACAACATGAGCAAAAGCAAAGTTGACAACCAGTTCTACA 148
||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------------------------------------ATGAGCAAAAGCAAGGTGGACAACCAGTTCTACA 34
Query 149 GTGTGGAAGTGGGAGACTCAACCTTCACAGTTCTCAAGCGCTACCAGAATCTAAAGCCTATTGGCTCTGGGGCT 222
|||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 35 GTGTGGAAGTGGGGGACTCAACCTTCACCGTTCTTAAGCGCTACCAGAACCTGAAGCCAATTGGCTCTGGGGCT 108
Query 223 CAGGGCATAGTTTGTGCCGCGTATGATGCTGTCCTTGACAGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTT 296
|||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 109 CAGGGAATAGTCTGTGCTGCGTACGACGCTGTCCTTGACAGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTT 182
Query 297 TCAGAACCAAACACATGCCAAGAGAGCGTACCGGGAGCTGGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTA 370
.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 183 CCAGAACCAAACTCACGCCAAGAGGGCTTACCGGGAGCTGGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTA 256
Query 371 TTAGTTTATTAAATGTCTTCACACCCCAGAAAACGCTGGAGGAGTTCCAAGATGTTTACTTAGTAATGGAACTG 444
||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 257 TTAGCTTATTAAATGTTTTTACACCCCAGAAAACACTGGAGGAGTTCCAAGATGTCTACTTAGTGATGGAACTG 330
Query 445 ATGGATGCCAACTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAGACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAAT 518
|||||.||||||.|.|||||.||||||||||||||..|.|||||.|||||.|||||||||.||||||||||.||
Sbjct 331 ATGGACGCCAACCTGTGTCAGGTGATTCAGATGGAGCTGGACCACGAGCGGATGTCTTACTTGCTGTACCAGAT 404
Query 519 GTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATTCACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCA 592
|.||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 405 GCTGTGTGGCATCAAGCACCTCCACTCCGCTGGGATCATCCACAGGGACTTAAAACCCAGTAACATTGTAGTCA 478
Query 593 AGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGCCAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCA 666
||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 479 AGTCTGATTGCACACTGAAAATCCTCGACTTCGGACTGGCCAGGACAGCGGGTACAAGCTTCATGATGACTCCG 552
Query 667 TATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTGGATATATG 740
|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||..|.||
Sbjct 553 TATGTGGTGACGCGATATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGCATGGGCTACAAGGAGAACGTTGACCTGTG 626
Query 741 GTCTGTGGGATGCATTATGGGAGAAATGGTTCGCCACAAAA-------TCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATT 807
|||.||.||.|||||.|||||||||||||| |||| |.||.||.||.||.|..||..|||||
Sbjct 627 GTCAGTAGGGTGCATCATGGGAGAAATGGT-------AAAAGGCACAGTGCTGTTCCCTGGCACTGATCATATT 693
Query 808 GACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAGAATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGT 881
|||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 694 GACCAGTGGAACAAAGTCATCGAGCAGCTAGGAACTCCGTGTCCAGAGTTCATGAAGAAATTGCAGCCCACAGT 767
Query 882 AAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTCCCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCC 955
.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 768 CAGAAACTACGTGGAGAATCGGCCCAAGTACGCAGGACTCACCTTCCCCAAGCTCTTTCCAGATTCCCTCTTCC 841
Query 956 CAGCGGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGACTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGAC 1029
|||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct 842 CAGCGGATTCTGAGCACAATAAACTTAAAGCCAGCCAAGCCAGGGATTTGTTGTCTAAGATGTTAGTGATTGAC 915
Query 1030 CCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACATCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGT 1103
|||||.||.||.|||||.|||||||||||..|.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct 916 CCAGCGAAGAGGATATCGGTGGACGACGCACTGCAGCATCCGTACATCAACGTTTGGTACGACCCGGCTGAAGT 989
Query 1104 GGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGAGAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAAC 1177
||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 990 GGAGGCGCCTCCGCCTCAGATATATGATAAGCAGCTGGATGAAAGGGAGCACACCATCGAAGAATGGAAAGAAC 1063
Query 1178 TTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGGTGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCA 1251
|||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1064 TTATCTACAAGGAGGTAATGAACTCAGAAGAGAAGACTAAGAATGGCGTAGTCAAAGGCCAGCCCTCGCCTTCA 1137
Query 1252 GCACAGGTGCAGCAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCTCGTCTGTCAATGACATCTCCTCCATGTCC 1325
|||||||||||||||
Sbjct 1138 GCACAGGTGCAGCAG----------------------------------------------------------- 1152
Query 1326 ACCGACCAGACCCTGGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAAGCCTCGGCAGGACCCCTGGGTTGTTGCAGG 1397
Sbjct 1153 ------------------------------------------------------------------------ 1152