Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487893
• Subject: NM_001366487.2
• Aligned Length: 1740
• Identities: 1569
• Gaps: 171

Alignment

Query    1  ATGGCCAGAAAGGCTCTCAAGCTTGCTTCGTGGACCAGCATGGCTCTTGCTGCCTCTGGCATCTACTTCTACAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCAGAAAGGCTCTCAAGCTTGCTTCGTGGACCAGCATGGCTCTTGCTGCCTCTGGCATCTACTTCTACAG  74

Query   75  TAACAAGTACTTGGACCCTAATGACTTTGGCGCTGTCAGGGTGGGCAGAGCAGTTGCTACGACGGCTGTCATCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TAACAAGTACTTGGACCCTAATGACTTTGGCGCTGTCAGGGTGGGCAGAGCAGTTGCTACGACGGCTGTCATCA  148

Query  149  GTTACGACTACCTCACTTCCCTGAAGAGTGTCCCTTATGGCTCAGAGGAGTACTTGCAGCTGAGATCTAAGGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTTACGACTACCTCACTTCCCTGAAGAGTGTCCCTTATGGCTCAGAGGAGTACTTGCAGCTGAGATCTAAGGTG  222

Query  223  CACCTTCGCTCTGCCAGGCGTCTCTGTGAGCTCTGCTGTGCCAACCGGGGCACCTTCATCAAGGTGGGCCAGCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CACCTTCGCTCTGCCAGGCGTCTCTGTGAGCTCTGCTGTGCCAACCGGGGCACCTTCATCAAGGTGGGCCAGCA  296

Query  297  CCTGGGGGCTCTGGACTACCTGTTGCCAGAGGAGTACACCAGCACGCTGAAGGTACTGCACAGCCAGGCTCCAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTGGGGGCTCTGGACTACCTGTTGCCAGAGGAGTACACCAGCACGCTGAAGGTACTGCACAGCCAGGCTCCAC  370

Query  371  AGAGCAGCATGCAAGAGATCCGCCAGGTCATCCGAGAAGATCTGGGCAAGGAGATCCATGATTTGTTCCAGAGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAGCAGCATGCAAGAGATCCGCCAGGTCATCCGAGAAGATCTGGGCAAGGAGATCCATGATTTGTTCCAGAGC  444

Query  445  TTCGATGACACCCCTCTGGGGACGGCCTCCCTGGCCCAGGTCCACAAGGCAGTGCTGCATGATGGGCGGACGGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCGATGACACCCCTCTGGGGACGGCCTCCCTGGCCCAGGTCCACAAGGCAGTGCTGCATGATGGGCGGACGGT  518

Query  519  GGCCGTGAAGGTCCAGCACCCAAAGGTGCGGGCTCAGAGCTCGAAGGACATTCTCCTGATGGAGGTGCTCGTTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCCGTGAAGGTCCAGCACCCAAAGGTGCGGGCTCAGAGCTCGAAGGACATTCTCCTGATGGAGGTGCTCGTTC  592

Query  593  TGGCTGTGAAGCAGCTGTTCCCAGAGTTTGAGTTTATGTGGCTTGTGGATGAAGCCAAGAAGAACCTGCCTTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGCTGTGAAGCAGCTGTTCCCAGAGTTTGAGTTTATGTGGCTTGTGGATGAAGCCAAGAAGAACCTGCCTTTG  666

Query  667  GAGCTGGATTTCCTCAATGAAGGGAGGAATGCTGAGAAGGTGTCCCAGATGCTCAGGCATTTTGACTTCTTGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCTGGATTTCCTCAATGAAGGGAGGAATGCTGAGAAGGTGTCCCAGATGCTCAGGCATTTTGACTTCTTGAA  740

Query  741  GGTCCCCCGAATCCACTGGGACCTGTCCACGGAGCGGGTCCTCCTGATGGAGTTTGTGGATGGCGGGCAGGTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTCCCCCGAATCCACTGGGACCTGTCCACGGAGCGGGTCCTCCTGATGGAGTTTGTGGATGGCGGGCAGGTCA  814

Query  815  ATGACAGAGACTACATGGAGAGGAACAAGATCGACGTCAAT---------------------------------  855
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                 
Sbjct  815  ATGACAGAGACTACATGGAGAGGAACAAGATCGACGTCAATGAGGTGAGGTCAAGAGCTCAGGGCTGCTGTGCC  888

Query  856  --------------------------------------------------------------------------  855
                                                                                      
Sbjct  889  GGGGAACGTGGGCTTGGTCAAGGCTGCCCAGGAAGTGCCTGTGTGTCCAGGAGCAGCGAAAAGGTCTCACATTT  962

Query  856  ----------------------------------------------------------------GAGATCTCAC  865
                                                                            ||||||||||
Sbjct  963  GCTTTCAGCAAATGATTTCTCGAGCAGCTACCATGTGCAAGCACTGAGTGCACTTGCTACAATAGAGATCTCAC  1036

Query  866  GCCACCTGGGCAAGATGTATAGTGAGATGATCTTCGTCAATGGCTTCGTGCACTGCGATCCCCACCCCGGCAAT  939
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCCACCTGGGCAAGATGTATAGTGAGATGATCTTCGTCAATGGCTTCGTGCACTGCGATCCCCACCCCGGCAAT  1110

Query  940  GTACTGGTGCGGAAGCACCCCGGCACGGGAAAGGCGGAGATTGTCCTGTTGGACCATGGGCTTTACCAGATGCT  1013
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTACTGGTGCGGAAGCACCCCGGCACGGGAAAGGCGGAGATTGTCCTGTTGGACCATGGGCTTTACCAGATGCT  1184

Query 1014  CACGGAAGAATTCCGCCTGAATTACTGCCACCTCTGGCAGTCTCTGATCTGGACTGACATGAAGAGAGTGAAGG  1087
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CACGGAAGAATTCCGCCTGAATTACTGCCACCTCTGGCAGTCTCTGATCTGGACTGACATGAAGAGAGTGAAGG  1258

Query 1088  AGTACAGCCAGCGACTGGGAGCCGGGGATCTCTACCCCTTGTTTGCCTGCATGCTGACGGCGCGATCGTGGGAC  1161
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGTACAGCCAGCGACTGGGAGCCGGGGATCTCTACCCCTTGTTTGCCTGCATGCTGACGGCGCGATCGTGGGAC  1332

Query 1162  TCGGTCAACAGAGGCATCAGCCAAGCTCCCGTCACTGCCACTGAGGACTTAGAGATTCGCAACAACGCGGCCAA  1235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCGGTCAACAGAGGCATCAGCCAAGCTCCCGTCACTGCCACTGAGGACTTAGAGATTCGCAACAACGCGGCCAA  1406

Query 1236  CTACCTCCCCCAGATCAGCCATCTCCTCAACCACGTGCCGCGCCAGATGCTGCTCATCTTGAAGACCAACGACC  1309
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTACCTCCCCCAGATCAGCCATCTCCTCAACCACGTGCCGCGCCAGATGCTGCTCATCTTGAAGACCAACGACC  1480

Query 1310  TGCTGCGTGGCATTGAGGCCGCCCTGGGCACCCGCGCCAGCGCCAGCTCCTTTCTCAACATGTCACGTTGCTGC  1383
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGCTGCGTGGCATTGAGGCCGCCCTGGGCACCCGCGCCAGCGCCAGCTCCTTTCTCAACATGTCACGTTGCTGC  1554

Query 1384  ATCAGAGCGCTAGCTGAGCACAAGAAGAAGAATACCTGTTCATTCTTCAGAAGGACCCAGATCTCTTTCAGCGA  1457
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATCAGAGCGCTAGCTGAGCACAAGAAGAAGAATACCTGTTCATTCTTCAGAAGGACCCAGATCTCTTTCAGCGA  1628

Query 1458  GGCCTTCAACTTATGGCAGATCAACCTCCATGAGCTCATCCTGCGTGTGAAGGGGTTGAAGCTGGCTGACCGGG  1531
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGCCTTCAACTTATGGCAGATCAACCTCCATGAGCTCATCCTGCGTGTGAAGGGGTTGAAGCTGGCTGACCGGG  1702

Query 1532  TCTTGGCCCTAATATGCTGGCTGTTCCCTGCTCCACTC  1569
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TCTTGGCCCTAATATGCTGGCTGTTCCCTGCTCCACTC  1740