Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488029
- Subject:
- XM_011523075.1
- Aligned Length:
- 2646
- Identities:
- 2059
- Gaps:
- 585
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCACAGATGGAGTTTCTTTTCAGGAAGAACACTCTGACAGCTGCATGGAAGCCCAGACACCAGGAAACCCT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CAGATTGGAGGCTGGTGTCCCGGAGCAGTGCAAGGCTGCCTGGTGCCCCGAGGAGGCTGCTGAGCCCCAGGCCA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TGGTCCCCTCTCGCAGGACGTGGAACCTGGGAGCCACGCCCTCGCTGCGGGGCCTGTGGAGAGTGGGCCGGGCC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CCGGAGCCCGAGCCGGGGATGGCTCGCCCCGCCCCAGCCCCAGCCAGCCCGGCCGCCCGCCCTTTCCCACACAC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 CGGCCCGGGGAGGTTGAGAACTGGGCGTGGAAAAGATACCCCAGTCTGCGGTGACGAGGACTCCAGTGCCCGAA 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 GTGCAGCTCGCCCAGCCCTAGCTCAGTGCCGAGCCCTTAGCGTGGACTGGGCTGGCCCCGGAAGCCCCCACGGG 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 CTCTACCTGACCCTGCAGGTAGAACACCTGAAGGAGAAGCTCATTAGCCAGGCCCAGGAAGTGAGCCGACTGCG 518
Query 1 ----------------------------------------------ATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGGCAGG 28
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Sbjct 519 ATCTGAGCTGGGGGGCACCGACTTGGAGAAGCACCGGGACCTGCTGATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGGCAGG 592
Query 29 AGATGCGGCGCTGTGAGGCCGAGCTGCAAGAGCTGCGCACAAAGCCAGCAGGTCCCTGCCCAGGTTGTGAGCAC 102
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Sbjct 593 AGATGCGGCGCTGTGAGGCCGAGCTGCAAGAGCTGCGCACAAAGCCAGCAGGTCCCTGCCCAGGTTGTGAGCAC 666
Query 103 AGCCAGGAGAGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGCTGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCT 176
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Sbjct 667 AGCCAGGAGAGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGCTGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCT 740
Query 177 GTCAGAGCTGAACCTAGAGGTGCAGCAGAAGACCGACCGGCTGGCTGAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACTGCC 250
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Sbjct 741 GTCAGAGCTGAACCTAGAGGTGCAGCAGAAGACCGACCGGCTGGCTGAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACTGCC 814
Query 251 TGGCTGAGAAGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGTCGGCGCCTGCGTGACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTG 324
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Sbjct 815 TGGCTGAGAAGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGTCGGCGCCTGCGTGACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTG 888
Query 325 CGGGCCCAGTCCCCACCTGTCAAGTATGTCATCAAGACAGTGGAGGTGGAGTCGTCCAAGACCAAGCAGGCCCT 398
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Sbjct 889 CGGGCCCAGTCCCCACCTGTCAAGTATGTCATCAAGACAGTGGAGGTGGAGTCGTCCAAGACCAAGCAGGCCCT 962
Query 399 CAGCGAGTCCCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAGGTGGCTATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGG 472
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Sbjct 963 CAGCGAGTCCCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAGGTGGCTATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGG 1036
Query 473 AACAGCAGCTGCAGAGCTCACACCAGCTGACCGCGCGGCTCCGGGCGCAGATTGCCATGTACGAGTCAGAGCTG 546
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Sbjct 1037 AACAGCAGCTGCAGAGCTCACACCAGCTGACCGCGCGGCTCCGGGCGCAGATTGCCATGTACGAGTCAGAGCTG 1110
Query 547 GAGCGGGCCCATGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCCTGGAAGAGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGC 620
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Sbjct 1111 GAGCGGGCCCATGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCCTGGAAGAGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGC 1184
Query 621 CTTTGCCAGAGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGCACGAGAATCTAGCAGGCGTCCGGACCAACTTGCTGACCT 694
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Sbjct 1185 CTTTGCCAGAGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGCACGAGAATCTAGCAGGCGTCCGGACCAACTTGCTGACCT 1258
Query 695 TGCAGCCGGCACTGCGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGCGTCTTCCCACTGCTG 768
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Sbjct 1259 TGCAGCCGGCACTGCGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGCGGCTTCCCACTGCTG 1332
Query 769 CTGCAGGAGGCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGATAGGCCAGGCCATCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGA 842
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Sbjct 1333 CTGCAGGAGGCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGATAGGCCAGGCCATCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGA 1406
Query 843 GCTGCTGCGCAAGTACCGCCGCGAGCTGCAGCTGCGTAAGAAGTGCCACAATGAGCTCGTGCGGCTGAAAGGGA 916
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Sbjct 1407 GCTGCTGCGCAAGTACCGCCGCGAGCTGCAGCTGCGTAAGAAGTGCCACAATGAGCTCGTGCGGCTGAAAGGGA 1480
Query 917 ACATCCGAGTGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACCAAAGAGGATGGGGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTG 990
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Sbjct 1481 ACATCCGAGTGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACCAAAGAGGATGGGGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTG 1554
Query 991 ACTTTCGATGCCGACGACGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCTGTGTCCTTCGAGCTGGACAA 1064
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Sbjct 1555 ACTTTCGATGCCGACGACGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCTGTGTCCTTCGAGCTGGACAA 1628
Query 1065 GGTCTTCTCCCCACAGGCCTCGCAGCAGGACGTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATG 1138
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Sbjct 1629 GGTCTTCTCCCCACAGGCCTCGCAGCAGGACGTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATG 1702
Query 1139 GCTTCAATGTCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACGGGCGCCGGCAAGACGTACACGATGGAGGGGACCGCTGAG 1212
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Sbjct 1703 GCTTCAATGTCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACGGGCGCCGGCAAGACGTACACGATGGAGGGGACCGCTGAG 1776
Query 1213 AACCCAGGTATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCCGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAGTA 1286
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Sbjct 1777 AACCCAGGTATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCCGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAGTA 1850
Query 1287 CACCATCACCGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATGAGGTCCTCAGGGACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAA 1360
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Sbjct 1851 CACCATCACCGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATGAGGTCCTCAGGGACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAA 1924
Query 1361 AACTGGAGATCCGGCTGTGCCCAGACGGCAGTGGGCAGCTGTATGTACCAGGGCTGACTGAGTTCCAAGTGCAG 1434
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Sbjct 1925 AACTGGAGATCCGGCTGTGCCCAGACGGCAGTGGGCAGCTGTATGTACCAGGGCTGACTGAGTTCCAAGTGCAG 1998
Query 1435 AGCGTGGACGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCCACACTAATCGCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGA 1508
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Sbjct 1999 AGCGTGGACGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCCACACTAATCGCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGA 2072
Query 1509 GCACAGCTCCCGCTCGCACGCACTGCTCATCGTGACGGTGCGAGGCGTGGACTGCAGCACAGGCCTCCGCACCA 1582
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Sbjct 2073 GCACAGCTCCCGCTCGCACGCGCTGCTCATCGTGACGGTGCGAGGCGTGGACTGCAGCACAGGCCTCCGCACCA 2146
Query 1583 CGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACTTGGCTGGCTCGGAGCGCGTGGGCAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTG 1656
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Sbjct 2147 CGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACTTGGCTGGCTCGGAGCGCGTGGGCAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTG 2220
Query 1657 CGGGAGGCGCAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGCTCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGG 1730
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Sbjct 2221 CGGGAGGCGCAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGCTCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGG 2294
Query 1731 CCACGTGCCCTTCCGCAACTCCAAGCTCACCTACCTGCTGCAGGATTCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCA 1804
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Sbjct 2295 CCACGTGCCCTTCCGCAACTCCAAGCTCACCTACCTGCTGCAGGATTCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCA 2368
Query 1805 TGGTGGTACAGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACTAGCGAGACGCTCTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTG 1878
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Sbjct 2369 TGGTGGTACAGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACTAGCGAGACGCTCTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTG 2442
Query 1879 CGCTCTGTGGAGCTGGGGCCTGGGCTACGCAGGGCAGAGCTTGGGTCCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAGAGTG 1952
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Sbjct 2443 CGCTCTGTGGAGCTGGGGCCTGGGCTACGCAGGGCAGAGCTTGGGTCCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAGAGTG 2516
Query 1953 GGAGCCGGCTTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCACGGGCCCACTCAGCCCCCAGCTCTGGGACCAGTAGCCGCC 2026
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Sbjct 2517 GGAGCCGGCTTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCACGGGCCCACTCAGCCCCCAGCTCTGGGACCAGTAGCCGCC 2590
Query 2027 CTGGATCCATCCGGAGGAAGCTGCAGCCCT-----------CGGCC---------- 2061
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Sbjct 2591 CTGGATCCATCCGGAGGAAGCTGCAGCCCTCGGGGAAGTCGCGGCCACTGCCTGTG 2646
