Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000488241
Subject:
NM_001291085.1
Aligned Length:
1680
Identities:
1386
Gaps:
294

Alignment

Query    1  ATGGATCTGAAGACAGTGCTCTCCCTGCCCCGCTACCCAGGGGAGTTCCTGCACCCCGTGGTGTACGCGTGCAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGCCGTCATGCTGCTCTGCCTCCTGGCCTCCTTCGTCACCTACATCGTGCACCAGAGCGCCATCCGCATCAGCC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GCAAGGGCCGGCACACGCTCCTGAATTTCTGCTTCCACGCGGCCCTGACCTTCACTGTGTTCGCCGGCGGCATC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AATCGCACCAAGTACCCCATCCTGTGCCAGGCGGTGGGCATCGTGCTGCACTATTCTACACTGTCCACCATGCT  296
                                                                                 |||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------------------ATGCT  5

Query  297  GTGGATAGGAGTGACCGCCAGGAACATCTACAAGCAGGTGACCAAGAAGGCCCCTCTGTGCCTGGACACAGACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    6  GTGGATAGGAGTGACCGCCAGGAACATCTACAAGCAGGTGACCAAGAAGGCCCCTCTGTGCCTGGACACAGACC  79

Query  371  AGCCACCGTACCCCAGGCAGCCCCTGCTCAGGTTTTACCTCGTCAGCGGAGGGGTCCCCTTTATCATCTGTGGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   80  AGCCACCGTACCCCAGGCAGCCCCTGCTCAGGTTTTACCTCGTCAGCGGAGGGGTCCCCTTTATCATCTGTGGG  153

Query  445  GTCACGGCTGCCACGAACATCAGGAATTACGGGACAGAGGACGAGGACACGGC---CTGCTGGATGGCCTGGGA  515
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||
Sbjct  154  GTCACGGCTGCCACGAACATCAGGAATTACGGGACAGAGGACGAGGACACGGCGTACTGCTGGATGGCCTGGGA  227

Query  516  GCCCAGCCTGGGCGCCTTCTACGGCCCAGCCGCCATCATCACCCTGGTCACCTGTGTGTACTTCCTGGGCACCT  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  228  GCCCAGCCTGGGCGCCTTCTACGGCCCAGCCGCCATCATCACCCTGGTCACCTGTGTGTACTTCCTGGGCACCT  301

Query  590  ACGTGCAGCTGCGGCGCCACCCAGGGCGCAGGTACGAGCTGCGCACACAGCCCGAGGAGCAGCGGCGGCTGGCG  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  302  ACGTGCAGCTGCGGCGCCACCCAGGGCGCAGGTACGAGCTGCGCACACAGCCCGAGGAGCAGCGGCGGCTGGCG  375

Query  664  ACACCCGAGGGCGGCCGTGGGATCCGGCCAGGCACCCCACCCGCACACGATGCCCCCGGCGCCTCCGTGCTGCA  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  376  ACACCCGAGGGCGGCCGTGGGATCCGGCCAGGCACCCCACCCGCACACGATGCCCCCGGCGCCTCCGTGCTGCA  449

Query  738  GAACGAGCACTCATTCCAGGCACAGCTGCGCGCCGCCGCCTTCACGCTGTTCCTGTTCACGGCCACGTGGGCCT  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  450  GAACGAGCACTCATTCCAGGCACAGCTGCGCGCCGCCGCCTTCACGCTGTTCCTGTTCACGGCCACGTGGGCCT  523

Query  812  TCGGGGCGCTGGCGGTGTCACAGGGCCACTTCCTGGACATGGTCTTCAGCTGCCTGTACGGCGCCTTCTGCGTG  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  524  TCGGGGCGCTGGCGGTGTCACAGGGCCACTTCCTGGACATGGTCTTCAGCTGCCTGTACGGCGCCTTCTGCGTG  597

Query  886  ACCCTGGGACTCTTCGTGCTCATCCACCACTGCGCCAAGCGTGAGGACGTGTGGCAGTGCTGGTGGGCATGCTG  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  598  ACCCTGGGACTCTTCGTGCTCATCCACCACTGCGCCAAGCGTGAGGACGTGTGGCAGTGCTGGTGGGCATGCTG  671

Query  960  CCCGCCCCGCAAGGACGCCCACCCCGCACTTGACGCCAACGGGGCCGCGCTGGGCCGCGCCGCCTGCCTGCACT  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  672  CCCGCCCCGCAAGGACGCCCACCCCGCACTTGACGCCAACGGGGCCGCGCTGGGCCGCGCCGCCTGCCTGCACT  745

Query 1034  CGCCGGGACTGGGCCAGCCACGGGGCTTCGCGCACCCACCGGGCCCCTGCAAGATGACCAACCTGCAGGCCGCG  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  746  CGCCGGGACTGGGCCAGCCACGGGGCTTCGCGCACCCACCGGGCCCCTGCAAGATGACCAACCTGCAGGCCGCG  819

Query 1108  CAGGGCCACGCCAGTTGCCTGTCACCGGCCACCCCGTGCTGCGCCAAGATGCACTGCGAGCCACTGACGGCGGA  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  820  CAGGGCCACGCCAGTTGCCTGTCACCGGCCACCCCGTGCTGCGCCAAGATGCACTGCGAGCCACTGACGGCGGA  893

Query 1182  CGAGGCGCACGTGCACCTGCAGGAGGAGGGCGCCTTCGGGCACGACCCCCACCTGCACGGGTGCCTTCAGGGCA  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  894  CGAGGCGCACGTGCACCTGCAGGAGGAGGGCGCCTTCGGGCACGACCCCCACCTGCACGGGTGCCTTCAGGGCA  967

Query 1256  GAACTAAGCCGCCCTACTTTAGCCGGCACCCAGCAGAGGAGCCCGAGTACGCCTACCACATCCCATCCAGCCTG  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  968  GAACTAAGCCGCCCTACTTTAGCCGGCACCCAGCAGAGGAGCCCGAGTACGCCTACCACATCCCATCCAGCCTG  1041

Query 1330  GATGGCAGCCCCCGCAGCTCGCGCACAGACAGCCCCCCCAGCTCTCTGGATGGCCCGGCGGGGACACACACGCT  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1042  GATGGCAGCCCCCGCAGCTCGCGCACAGACAGCCCCCCCAGCTCTCTGGATGGCCCGGCGGGGACACACACGCT  1115

Query 1404  GGCCTGCTGCACCCAGGGCGACCCCTTCCCCATGGTCACCCAGCCCGAGGGCAGTGATGGGAGCCCTGCCCTCT  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1116  GGCCTGCTGCACCCAGGGCGACCCCTTCCCCATGGTCACCCAGCCCGAGGGCAGTGATGGGAGCCCTGCCCTCT  1189

Query 1478  ACAGCTGCCCCACGCAGCCGGGCAGGGAGGCAGCGCTCGGGCCCGGCCACTTGGAGATGCTGCGGAGGACACAG  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1190  ACAGCTGCCCCACGCAGCCGGGCAGGGAGGCAGCGCTCGGGCCCGGCCACTTGGAGATGCTGCGGAGGACACAG  1263

Query 1552  TCCCTGCCCTTTGGTGGCCCCAGCCAGAACGGGCTGCCCAAGGGTAAATTGCTAGAAGGCCTGCCGTTTGGCAC  1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1264  TCCCTGCCCTTTGGTGGCCCCAGCCAGAACGGGCTGCCCAAGGGTAAATTGCTAGAAGGCCTGCCGTTTGGCAC  1337

Query 1626  CGACGGGACCGGCAACATCCGAACGGGACCCTGGAAAAACGAAACTACTGTG  1677
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1338  CGACGGGACCGGCAACATCCGAACGGGACCCTGGAAAAACGAAACTACTGTG  1389