Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488353
• Subject: NM_001291783.1
• Aligned Length: 1278
• Identities: 930
• Gaps: 240

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGTCCTCCCTGGAACAGAAGCTGTCCCGCCTGGAAGCAAAGCTAAAGCAGGAGAACCGGGAGGCCCG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCGGAGGATCGACCTCAACCTGGATATCAGCCCCCAGCGGCCCAGGCCCACCCTGCAGCTCCCGCTGGCCAACG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGGGGGCAGCCGCTCGCCATCCTCAGAGAGCTCCCCGCAGCACCCCACGCCCCCCGCCCGGCCCCGCCACATG  222
                                                                                   |||
Sbjct    1  -----------------------------------------------------------------------ATG  3

Query  223  CTGGGGCTCCCGTCAACCCTGTTCACACCCCGCAGCATGGAGAGCATTGAGATTGACCAGAAGCTGCAGGAGAT  296
            |||||||||||.||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    4  CTGGGGCTCCCATCAACCTTGTTCACACCGCGCAGTATGGAGAGCATCGAGATTGACCAGAAGCTGCAGGAGAT  77

Query  297  CATGAAGCAGACGGGCTACCTGACCATCGGGGGCCAGCGCTACCAGGCAGAAATCAACGACCTGGAGAACTTGG  370
            ||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||||||||
Sbjct   78  CATGAAGCAGACAGGGTACCTGACTATCGGGGGCCAGCGTTATCAGGCAGAAATCAATGACTTGGAGAACTTGG  151

Query  371  GCGAGATGGGCAGCGGCACCTGCGGCCAGGTGTGGAAGATGCGCTTCCGGAAGACCGGCCACGTCATTGCCGTT  444
            |.|||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||.|||
Sbjct  152  GTGAGATGGGCAGTGGTACCTGTGGTCAGGTGTGGAAGATGCGGTTCCGGAAGACAGGCCACATCATTGCTGTT  225

Query  445  AAGCAAATGCGGCGCTCCGGGAACAAGGAGGAGAACAAGCGCATCCTCATGGACCTGGATGTGGTGCTGAAGAG  518
            |||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||..|.||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct  226  AAGCAAATGCGGCGCTCTGGGAACAAGGAAGAGAATAAGCGCATTTTGATGGACCTGGATGTAGTACTCAAGAG  299

Query  519  CCACGACTGCCCCTACATCGTGCAGTGCTTTGGGACGTTCATCACCAACACGGATGTCTTCATCGCCATGGAGC  592
            |||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  300  CCATGACTGCCCTTACATCGTTCAGTGCTTTGGCACCTTCATCACCAACACAGACGTCTTTATTGCCATGGAGC  373

Query  593  TCATGGGCACCTGCGCTGAGAAGCTCAAGAAGCGGATGCAGGGCCCCATCCCCGAGCGCATTCTGGGCAAGATG  666
            ||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct  374  TCATGGGCACATGTGCAGAGAAGCTGAAGAAACGAATGCAGGGCCCCATTCCAGAGCGAATCCTGGGCAAGATG  447

Query  667  ACAGTGGCGATTGTGAAGGCGCTGTACTACCTGAAGGAGAAGCACGGTGTCATCCACCGCGACGTCAAGCCCTC  740
            ||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  448  ACTGTGGCGATTGTGAAAGCACTGTACTATCTGAAGGAGAAGCATGGCGTCATCCATCGCGATGTCAAACCCTC  521

Query  741  CAACATCCTGCTGGACGAGCGGGGCCAGATCAAGCTCTGCGACTTCGGCATCAGCGGCCGCCTGGTGGACTCCA  814
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct  522  CAACATCCTGCTAGATGAGCGGGGCCAGATCAAGCTCTGTGACTTTGGCATCAGTGGCCGCCTTGTTGACTCCA  595

Query  815  AAGCCAAGACGCGGAGCGCCGGCTGTGCCGCCTACATGGCACCCGAGCGCATTGACCCCCCAGACCCCACCAAG  888
            |||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct  596  AAGCCAAAACACGGAGTGCTGGCTGTGCTGCCTATATGGCTCCCGAGCGCATCGACCCTCCAGATCCCACCAAG  669

Query  889  CCGGACTATGACATCCGGGCCGACGTATGGAGCCTGGGCATCTCGTTGCCCTGCCCGTCTCCCTCCCAGGTGGA  962
            ||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||                     |||.|.||||||
Sbjct  670  CCTGACTATGACATCCGAGCTGATGTGTGGAGCCTGGGCAT---------------------CTCACTGGTGGA  722

Query  963  GCTGGCAACAGGACAGTTTCCCTACAAGAACTGCAAGACGGACTTTGAGGTCCTCACCAAAGTCCTACAGGAAG  1036
            ||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  723  GCTGGCAACAGGACAGTTCCCCTATAAGAACTGCAAGACGGACTTTGAGGTCCTCACCAAAGTCCTACAGGAAG  796

Query 1037  AGCCCCCGCTTCTGCCCGGACACATGGGCTTCTCGGGGGACTTCCAGTCCTTCGTCAAAGACTGCCTTACTAAA  1110
            |||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  797  AGCCCCCACTCCTGCCTGGTCACATGGGCTTCTCAGGGGACTTCCAGTCATTTGTCAAAGACTGCCTTACTAAA  870

Query 1111  GATCACAGGAAGAGACCAAAGTATAATAAGCTACTTGAACACAGCTTCATCAAGCGCTACGAGACGCTGGAGGT  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||..||.|||||
Sbjct  871  GATCACAGGAAGAGACCAAAGTATAATAAGCTACTTGAACACAGCTTCATCAAGCACTATGAGATACTCGAGGT  944

Query 1185  GGACGTGGCGTCCTGGTTCAAGGATGTCATGGCGAAGACTGAGTCACCGCGGACTAGCGGCGTCCTGAGCCAGC  1258
            |||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||..|||||||.||.||||||||.||||
Sbjct  945  GGATGTCGCGTCCTGGTTTAAGGATGTCATGGCGAAGACCGAGTCCCCAAGGACTAGTGGAGTCCTGAGTCAGC  1018

Query 1259  CCCACCTGCCCTTCTTCAGG  1278
            .|||.|||||||||||||||
Sbjct 1019  ACCATCTGCCCTTCTTCAGG  1038