Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488354
• Subject: XM_017010487.1
• Aligned Length: 1917
• Identities: 1896
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGAATAGATACACAACAATCAGGCAGCTCGGGGATGGAACCTACGGTTCCGTCCTGCTGGGAAGAAGCATTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAATAGATACACAACAATCAGGCAGCTCGGGGATGGAACCTACGGTTCCGTCCTGCTGGGAAGAAGCATTGA  74

Query   75  GTCTGGGGAGCTGATCGCTATTAAAAAAATGAAAAGAAAATTTTATTCCTGGGAGGAATGCATGAACCTTCGGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTCTGGGGAGCTGATCGCTATTAAAAAAATGAAAAGAAAATTTTATTCCTGGGAGGAATGCATGAACCTTCGGG  148

Query  149  AGGTTAAGTCTTTAAAGAAGCTCAACCATGCCAATGTAGTCAAATTAAAAGAAGTTATCAGGGAAAATGATCAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGTTAAGTCTTTAAAGAAGCTCAACCATGCCAATGTAGTCAAATTAAAAGAAGTTATCAGGGAAAATGATCAT  222

Query  223  CTTTATTTTATCTTCGAGTACATGAAGGAAAATCTTTACCAGCTCATTAAAGAGAGAAATAAGTTGTTTCCTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTTATTTTATCTTCGAGTACATGAAGGAAAATCTTTACCAGCTCATTAAAGAGAGAAATAAGTTGTTTCCTGA  296

Query  297  GTCTGCTATAAGGAATATCATGTATCAGATATTACAAGGACTCGCATTTATTCACAAACACGGCTTCTTTCATC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTCTGCTATAAGGAATATCATGTATCAGATATTACAAGGACTCGCATTTATTCACAAACACGGCTTCTTTCATC  370

Query  371  GAGACTTAAAGCCTGAGAACCTCCTCTGCATGGGACCAGAACTTGTGAAAATTGCAGACTTTGGTTTGGCCCGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGACTTAAAGCCTGAGAACCTCCTCTGCATGGGACCAGAACTTGTGAAAATTGCAGACTTTGGTTTGGCCCGA  444

Query  445  GAAATACGATCAAAACCTCCATATACAGATTATGTATCTACCAGATGGTACAGGGCTCCAGAAGTACTCCTGAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAATACGATCAAAACCTCCATATACAGATTATGTATCTACCAGATGGTACAGGGCTCCAGAAGTACTCCTGAG  518

Query  519  GTCTACCAACTACAGCTCCCCCATTGACGTCTGGGCGGTGGGCTGCATCATGGCAGAAGTTTACACCCTCAGGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTCTACCAACTACAGCTCCCCCATTGACGTCTGGGCGGTGGGCTGCATCATGGCAGAAGTTTACACCCTCAGGC  592

Query  593  CACTCTTCCCTGGAGCCAGTGAAATTGACACAATATTCAAAATTTGCCAAGTGCTGGGGACACCAAAAAAGACT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CACTCTTCCCTGGAGCCAGTGAAATTGACACAATATTCAAAATTTGCCAAGTGCTGGGGACACCAAAAAAGACT  666

Query  667  GACTGGCCTGAAGGCTATCAACTTTCAAGTGCAATGAACTTCCGTTGGCCACAGTGTGTACCCAATAACTTAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACTGGCCTGAAGGCTATCAACTTTCAAGTGCAATGAACTTCCGTTGGCCACAGTGTGTACCCAATAACTTAAA  740

Query  741  GACCTTGATTCCCAATGCTAGCAGTGAAGCAGTCCAGCTCCTGAGAGACATGCTTCAGTGGGATCCCAAGAAAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GACCTTGATTCCCAATGCTAGCAGTGAAGCAGTCCAGCTCCTGAGAGACATGCTTCAGTGGGATCCCAAGAAAC  814

Query  815  GACCAACAGCTAGTCAGGCACTTCGATATCCTTACTTCCAAGTTGGACACCCACTAGGCAGCACCACACAAAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GACCAACAGCTAGTCAGGCACTTCGATATCCTTACTTCCAAGTTGGACACCCACTAGGCAGCACCACACAAAAC  888

Query  889  CTTCAGGATTCAGAAAAACCACAGAAAGGCATCCTGGAAAAGGCAGGCCCACCTCCTTATATTAAGCCAGTCCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTCAGGATTCAGAAAAACCACAGAAAGGCATCCTGGAAAAGGCAGGCCCACCTCCTTATATTAAGCCAGTCCC  962

Query  963  ACCTGCCCAGCCACCAGCCAAGCCACACACACGAATTTCTTCACGACAGCATCAAGCCAGCCAGCCCCCTCTGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACCTGCCCAGCCACCAGCCAAGCCACACACACGAATTTCTTCACGACAGCATCAAGCCAGCCAGCCCCCTCTGC  1036

Query 1037  ATCTCACGTACCCCTACAAAGCAGAGGTCTCCAGGACAGATCACCCAAGCCATCTCCAGGAGGACAAGCCAAGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATCTCACGTACCCCTACAAAGCAGAGGTCTCCAGGACAGATCACCCAAGCCATCTCCAGGAGGACAAGCCAAGC  1110

Query 1111  CCGTTGCTTTTCCCATCCCTCCACAACAAGCATCCACAGTCG---------------------AAAATCACAGC  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     |||||||||||
Sbjct 1111  CCGTTGCTTTTCCCATCCCTCCACAACAAGCATCCACAGTCGGTGAGCAGCCCAGATTCACCAAAAATCACAGC  1184

Query 1164  TGGCCTGGAGCACAAAAATGGTGAGATAAAGCCAAAGAGTAGGAGAAGGTGGGGTCTTATTTCCAGGTCAACAA  1237
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGGCCTGGAGCACAAAAATGGTGAGATAAAGCCAAAGAGTAGGAGAAGGTGGGGTCTTATTTCCAGGTCAACAA  1258

Query 1238  AGGATTCAGATGATTGGGCTGACTTGGATGACTTGGATTTCAGTCCATCCCTCAGCAGGATTGACCTGAAAAAC  1311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGATTCAGATGATTGGGCTGACTTGGATGACTTGGATTTCAGTCCATCCCTCAGCAGGATTGACCTGAAAAAC  1332

Query 1312  AAGAAAAGACAGAGTGATGACACTCTCTGCAGGTTTGAGAGTGTTTTGGACCTGAAGCCCTCTGAGCCTGTGGG  1385
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGAAAAGACAGAGTGATGACACTCTCTGCAGGTTTGAGAGTGTTTTGGACCTGAAGCCCTCTGAGCCTGTGGG  1406

Query 1386  CACAGGAAACAGTGCCCCCACCCAGACGTCATATCAGCGGCGAGACACGCCCACCCTGAGATCTGCAGCCAAGC  1459
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACAGGAAACAGTGCCCCCACCCAGACGTCATATCAGCGGCGAGACACGCCCACCCTGAGATCTGCAGCCAAGC  1480

Query 1460  AGCACTATTTGAAGCACTCTCGATACTTGCCTGGGATCAGTATAAGAAATGGCATACTCTCGAATCCAGGCAAG  1533
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGCACTATTTGAAGCACTCTCGATACTTGCCTGGGATCAGTATAAGAAATGGCATACTCTCGAATCCAGGCAAG  1554

Query 1534  GAATTTATTCCACCTAATCCATGGTCTAGTTCTGGCTTGTCTGGAAAATCTTCAGGGACAATGTCAGTAATCAG  1607
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAATTTATTCCACCTAATCCATGGTCTAGTTCTGGCTTGTCTGGAAAATCTTCAGGGACAATGTCAGTAATCAG  1628

Query 1608  CAAAGTAAATTCAGTTGGTTCCAGCTCTACAAGTTCTAGTGGACTGACTGGAAACTATGTCCCTTCCTTTCTGA  1681
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAAAGTAAATTCAGTTGGTTCCAGCTCTACAAGTTCTAGTGGACTGACTGGAAACTATGTCCCTTCCTTTCTGA  1702

Query 1682  AAAAAGAAATCGGTTCTGCTATGCAGAGGGTACACCTAGCACCTATTCCAGACCCTTCCCCTGGTTATTCCTCC  1755
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AAAAAGAAATCGGTTCTGCTATGCAGAGGGTACACCTAGCACCTATTCCAGACCCTTCCCCTGGTTATTCCTCC  1776

Query 1756  CTGAAGGCCATGAGACCTCATCCTGGGCGACCATTCTTCCACACCCAGCCTAGAAGCACTCCTGGGTTGATACC  1829
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTGAAGGCCATGAGACCTCATCCTGGGCGACCATTCTTCCACACCCAGCCTAGAAGCACTCCTGGGTTGATACC  1850

Query 1830  ACGGCCTCCAGCCGCCCAGCCAGTGCATGGCCGGACAGACTGGGCTTCCAAGTACGCATCTCGGCGA  1896
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ACGGCCTCCAGCCGCCCAGCCAGTGCATGGCCGGACAGACTGGGCTTCCAAGTACGCATCTCGGCGA  1917